Protein–RNA interactions for Protein: A2AEN9

Gm5938, Predicted gene 5938, mousemouse

Predictions only

Length 163 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5938A2AEN9 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm5938A2AEN9 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm5938A2AEN9 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm5938A2AEN9 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm5938A2AEN9 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm5938A2AEN9 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm5938A2AEN9 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm5938A2AEN9 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm5938A2AEN9 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm5938A2AEN9 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm5938A2AEN9 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm5938A2AEN9 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm5938A2AEN9 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm5938A2AEN9 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm5938A2AEN9 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm5938A2AEN9 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm5938A2AEN9 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm5938A2AEN9 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm5938A2AEN9 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm5938A2AEN9 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm5938A2AEN9 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm5938A2AEN9 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm5938A2AEN9 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm5938A2AEN9 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm5938A2AEN9 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm5938A2AEN9 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm5938A2AEN9 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm5938A2AEN9 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm5938A2AEN9 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm5938A2AEN9 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm5938A2AEN9 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm5938A2AEN9 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm5938A2AEN9 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm5938A2AEN9 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm5938A2AEN9 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm5938A2AEN9 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm5938A2AEN9 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm5938A2AEN9 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm5938A2AEN9 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm5938A2AEN9 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm5938A2AEN9 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm5938A2AEN9 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm5938A2AEN9 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm5938A2AEN9 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm5938A2AEN9 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm5938A2AEN9 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm5938A2AEN9 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm5938A2AEN9 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm5938A2AEN9 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm5938A2AEN9 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm5938A2AEN9 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm5938A2AEN9 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm5938A2AEN9 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm5938A2AEN9 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm5938A2AEN9 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm5938A2AEN9 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm5938A2AEN9 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm5938A2AEN9 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm5938A2AEN9 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm5938A2AEN9 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm5938A2AEN9 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm5938A2AEN9 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm5938A2AEN9 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm5938A2AEN9 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm5938A2AEN9 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm5938A2AEN9 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm5938A2AEN9 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm5938A2AEN9 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm5938A2AEN9 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm5938A2AEN9 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm5938A2AEN9 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm5938A2AEN9 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm5938A2AEN9 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm5938A2AEN9 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm5938A2AEN9 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm5938A2AEN9 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm5938A2AEN9 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm5938A2AEN9 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm5938A2AEN9 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm5938A2AEN9 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm5938A2AEN9 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm5938A2AEN9 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm5938A2AEN9 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm5938A2AEN9 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm5938A2AEN9 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm5938A2AEN9 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm5938A2AEN9 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm5938A2AEN9 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm5938A2AEN9 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm5938A2AEN9 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm5938A2AEN9 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm5938A2AEN9 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm5938A2AEN9 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm5938A2AEN9 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm5938A2AEN9 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm5938A2AEN9 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm5938A2AEN9 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm5938A2AEN9 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm5938A2AEN9 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm5938A2AEN9 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms