Protein–RNA interactions for Protein: A2AB62

1700023F06Rik, RIKEN cDNA 1700023F06 gene, mousemouse

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700023F06RikA2AB62 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
1700023F06RikA2AB62 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
1700023F06RikA2AB62 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
1700023F06RikA2AB62 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
1700023F06RikA2AB62 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
1700023F06RikA2AB62 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
1700023F06RikA2AB62 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
1700023F06RikA2AB62 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
1700023F06RikA2AB62 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
1700023F06RikA2AB62 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
1700023F06RikA2AB62 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
1700023F06RikA2AB62 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
1700023F06RikA2AB62 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
1700023F06RikA2AB62 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
1700023F06RikA2AB62 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
1700023F06RikA2AB62 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
1700023F06RikA2AB62 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
1700023F06RikA2AB62 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
1700023F06RikA2AB62 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
1700023F06RikA2AB62 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
1700023F06RikA2AB62 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
1700023F06RikA2AB62 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
1700023F06RikA2AB62 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
1700023F06RikA2AB62 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
1700023F06RikA2AB62 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
1700023F06RikA2AB62 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
1700023F06RikA2AB62 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
1700023F06RikA2AB62 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
1700023F06RikA2AB62 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
1700023F06RikA2AB62 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
1700023F06RikA2AB62 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
1700023F06RikA2AB62 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
1700023F06RikA2AB62 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
1700023F06RikA2AB62 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
1700023F06RikA2AB62 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
1700023F06RikA2AB62 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
1700023F06RikA2AB62 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
1700023F06RikA2AB62 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
1700023F06RikA2AB62 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
1700023F06RikA2AB62 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
1700023F06RikA2AB62 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
1700023F06RikA2AB62 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
1700023F06RikA2AB62 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
1700023F06RikA2AB62 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
1700023F06RikA2AB62 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
1700023F06RikA2AB62 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
1700023F06RikA2AB62 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
1700023F06RikA2AB62 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
1700023F06RikA2AB62 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
1700023F06RikA2AB62 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
1700023F06RikA2AB62 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
1700023F06RikA2AB62 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
1700023F06RikA2AB62 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
1700023F06RikA2AB62 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
1700023F06RikA2AB62 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
1700023F06RikA2AB62 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
1700023F06RikA2AB62 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
1700023F06RikA2AB62 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
1700023F06RikA2AB62 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
1700023F06RikA2AB62 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
1700023F06RikA2AB62 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
1700023F06RikA2AB62 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
1700023F06RikA2AB62 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
1700023F06RikA2AB62 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
1700023F06RikA2AB62 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
1700023F06RikA2AB62 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
1700023F06RikA2AB62 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
1700023F06RikA2AB62 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
1700023F06RikA2AB62 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
1700023F06RikA2AB62 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
1700023F06RikA2AB62 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
1700023F06RikA2AB62 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
1700023F06RikA2AB62 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
1700023F06RikA2AB62 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
1700023F06RikA2AB62 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
1700023F06RikA2AB62 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
1700023F06RikA2AB62 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
1700023F06RikA2AB62 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
1700023F06RikA2AB62 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
1700023F06RikA2AB62 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
1700023F06RikA2AB62 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
1700023F06RikA2AB62 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
1700023F06RikA2AB62 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
1700023F06RikA2AB62 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
1700023F06RikA2AB62 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
1700023F06RikA2AB62 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
1700023F06RikA2AB62 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
1700023F06RikA2AB62 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
1700023F06RikA2AB62 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
1700023F06RikA2AB62 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
1700023F06RikA2AB62 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
1700023F06RikA2AB62 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
1700023F06RikA2AB62 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
1700023F06RikA2AB62 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
1700023F06RikA2AB62 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
1700023F06RikA2AB62 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
1700023F06RikA2AB62 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
1700023F06RikA2AB62 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
1700023F06RikA2AB62 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
1700023F06RikA2AB62 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms