Protein–RNA interactions for Protein: A0JLY1

Ccdc173, Coiled-coil domain-containing protein 173, mousemouse

Predictions only

Length 547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc173A0JLY1 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc173A0JLY1 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc173A0JLY1 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc173A0JLY1 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc173A0JLY1 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc173A0JLY1 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc173A0JLY1 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc173A0JLY1 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc173A0JLY1 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc173A0JLY1 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc173A0JLY1 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc173A0JLY1 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc173A0JLY1 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc173A0JLY1 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc173A0JLY1 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc173A0JLY1 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc173A0JLY1 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc173A0JLY1 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc173A0JLY1 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc173A0JLY1 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc173A0JLY1 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc173A0JLY1 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc173A0JLY1 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc173A0JLY1 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc173A0JLY1 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc173A0JLY1 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc173A0JLY1 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc173A0JLY1 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc173A0JLY1 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc173A0JLY1 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc173A0JLY1 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc173A0JLY1 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc173A0JLY1 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc173A0JLY1 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc173A0JLY1 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc173A0JLY1 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc173A0JLY1 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc173A0JLY1 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc173A0JLY1 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc173A0JLY1 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc173A0JLY1 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc173A0JLY1 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc173A0JLY1 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc173A0JLY1 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc173A0JLY1 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc173A0JLY1 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc173A0JLY1 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc173A0JLY1 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc173A0JLY1 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc173A0JLY1 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc173A0JLY1 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc173A0JLY1 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc173A0JLY1 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc173A0JLY1 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc173A0JLY1 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc173A0JLY1 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc173A0JLY1 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc173A0JLY1 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc173A0JLY1 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc173A0JLY1 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc173A0JLY1 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc173A0JLY1 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc173A0JLY1 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc173A0JLY1 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc173A0JLY1 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc173A0JLY1 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc173A0JLY1 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc173A0JLY1 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc173A0JLY1 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc173A0JLY1 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc173A0JLY1 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc173A0JLY1 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc173A0JLY1 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc173A0JLY1 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc173A0JLY1 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc173A0JLY1 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc173A0JLY1 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc173A0JLY1 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc173A0JLY1 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc173A0JLY1 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc173A0JLY1 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc173A0JLY1 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc173A0JLY1 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc173A0JLY1 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc173A0JLY1 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc173A0JLY1 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc173A0JLY1 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc173A0JLY1 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc173A0JLY1 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc173A0JLY1 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc173A0JLY1 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc173A0JLY1 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc173A0JLY1 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc173A0JLY1 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc173A0JLY1 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc173A0JLY1 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc173A0JLY1 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc173A0JLY1 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc173A0JLY1 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc173A0JLY1 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.5 ms