Protein–RNA interactions for Protein: A0A1B0GSI2

1700018G05Rik, RIKEN cDNA 1700018G05 gene, mousemouse

Predictions only

Length 66 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
1700018G05RikA0A1B0GSI2 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
1700018G05RikA0A1B0GSI2 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
1700018G05RikA0A1B0GSI2 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
1700018G05RikA0A1B0GSI2 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
1700018G05RikA0A1B0GSI2 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
1700018G05RikA0A1B0GSI2 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
1700018G05RikA0A1B0GSI2 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
1700018G05RikA0A1B0GSI2 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
1700018G05RikA0A1B0GSI2 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC10.01□□□□□ -0.81
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms