Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RP08

1700028J19Rik, RIKEN cDNA 1700028J19 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700028J19RikA0A0U1RP08 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
1700028J19RikA0A0U1RP08 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
1700028J19RikA0A0U1RP08 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
1700028J19RikA0A0U1RP08 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
1700028J19RikA0A0U1RP08 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
1700028J19RikA0A0U1RP08 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
1700028J19RikA0A0U1RP08 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
1700028J19RikA0A0U1RP08 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
1700028J19RikA0A0U1RP08 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
1700028J19RikA0A0U1RP08 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
1700028J19RikA0A0U1RP08 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
1700028J19RikA0A0U1RP08 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
1700028J19RikA0A0U1RP08 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
1700028J19RikA0A0U1RP08 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
1700028J19RikA0A0U1RP08 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
1700028J19RikA0A0U1RP08 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
1700028J19RikA0A0U1RP08 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
1700028J19RikA0A0U1RP08 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
1700028J19RikA0A0U1RP08 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
1700028J19RikA0A0U1RP08 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
1700028J19RikA0A0U1RP08 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
1700028J19RikA0A0U1RP08 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
1700028J19RikA0A0U1RP08 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
1700028J19RikA0A0U1RP08 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
1700028J19RikA0A0U1RP08 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
1700028J19RikA0A0U1RP08 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
1700028J19RikA0A0U1RP08 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
1700028J19RikA0A0U1RP08 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
1700028J19RikA0A0U1RP08 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
1700028J19RikA0A0U1RP08 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
1700028J19RikA0A0U1RP08 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
1700028J19RikA0A0U1RP08 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
1700028J19RikA0A0U1RP08 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
1700028J19RikA0A0U1RP08 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
1700028J19RikA0A0U1RP08 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
1700028J19RikA0A0U1RP08 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
1700028J19RikA0A0U1RP08 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
1700028J19RikA0A0U1RP08 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
1700028J19RikA0A0U1RP08 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
1700028J19RikA0A0U1RP08 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
1700028J19RikA0A0U1RP08 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
1700028J19RikA0A0U1RP08 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
1700028J19RikA0A0U1RP08 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
1700028J19RikA0A0U1RP08 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
1700028J19RikA0A0U1RP08 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
1700028J19RikA0A0U1RP08 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
1700028J19RikA0A0U1RP08 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
1700028J19RikA0A0U1RP08 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
1700028J19RikA0A0U1RP08 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
1700028J19RikA0A0U1RP08 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
1700028J19RikA0A0U1RP08 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
1700028J19RikA0A0U1RP08 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
1700028J19RikA0A0U1RP08 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
1700028J19RikA0A0U1RP08 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
1700028J19RikA0A0U1RP08 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
1700028J19RikA0A0U1RP08 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
1700028J19RikA0A0U1RP08 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
1700028J19RikA0A0U1RP08 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
1700028J19RikA0A0U1RP08 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
1700028J19RikA0A0U1RP08 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
1700028J19RikA0A0U1RP08 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
1700028J19RikA0A0U1RP08 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
1700028J19RikA0A0U1RP08 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
1700028J19RikA0A0U1RP08 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
1700028J19RikA0A0U1RP08 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
1700028J19RikA0A0U1RP08 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
1700028J19RikA0A0U1RP08 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
1700028J19RikA0A0U1RP08 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
1700028J19RikA0A0U1RP08 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
1700028J19RikA0A0U1RP08 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
1700028J19RikA0A0U1RP08 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
1700028J19RikA0A0U1RP08 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
1700028J19RikA0A0U1RP08 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
1700028J19RikA0A0U1RP08 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
1700028J19RikA0A0U1RP08 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
1700028J19RikA0A0U1RP08 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
1700028J19RikA0A0U1RP08 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53 ms