Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YTW6

Scn2a, Sodium channel protein, mousemouse

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Length 2,006 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn2aA0A0J9YTW6 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Scn2aA0A0J9YTW6 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Scn2aA0A0J9YTW6 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Scn2aA0A0J9YTW6 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Scn2aA0A0J9YTW6 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Scn2aA0A0J9YTW6 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Scn2aA0A0J9YTW6 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Scn2aA0A0J9YTW6 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Scn2aA0A0J9YTW6 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Scn2aA0A0J9YTW6 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Scn2aA0A0J9YTW6 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Scn2aA0A0J9YTW6 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Scn2aA0A0J9YTW6 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Scn2aA0A0J9YTW6 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Scn2aA0A0J9YTW6 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Scn2aA0A0J9YTW6 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Scn2aA0A0J9YTW6 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Scn2aA0A0J9YTW6 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Scn2aA0A0J9YTW6 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Scn2aA0A0J9YTW6 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Scn2aA0A0J9YTW6 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Scn2aA0A0J9YTW6 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Scn2aA0A0J9YTW6 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Scn2aA0A0J9YTW6 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Scn2aA0A0J9YTW6 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Scn2aA0A0J9YTW6 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Scn2aA0A0J9YTW6 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Scn2aA0A0J9YTW6 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Scn2aA0A0J9YTW6 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Scn2aA0A0J9YTW6 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Scn2aA0A0J9YTW6 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Scn2aA0A0J9YTW6 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Scn2aA0A0J9YTW6 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Scn2aA0A0J9YTW6 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Scn2aA0A0J9YTW6 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Scn2aA0A0J9YTW6 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Scn2aA0A0J9YTW6 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Scn2aA0A0J9YTW6 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Scn2aA0A0J9YTW6 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Scn2aA0A0J9YTW6 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Scn2aA0A0J9YTW6 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Scn2aA0A0J9YTW6 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Scn2aA0A0J9YTW6 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
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Scn2aA0A0J9YTW6 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Scn2aA0A0J9YTW6 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Scn2aA0A0J9YTW6 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Scn2aA0A0J9YTW6 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Scn2aA0A0J9YTW6 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Scn2aA0A0J9YTW6 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Scn2aA0A0J9YTW6 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Scn2aA0A0J9YTW6 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Scn2aA0A0J9YTW6 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Scn2aA0A0J9YTW6 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Scn2aA0A0J9YTW6 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Scn2aA0A0J9YTW6 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Scn2aA0A0J9YTW6 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Scn2aA0A0J9YTW6 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Scn2aA0A0J9YTW6 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Scn2aA0A0J9YTW6 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Scn2aA0A0J9YTW6 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Scn2aA0A0J9YTW6 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Scn2aA0A0J9YTW6 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Scn2aA0A0J9YTW6 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Scn2aA0A0J9YTW6 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Scn2aA0A0J9YTW6 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Scn2aA0A0J9YTW6 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Scn2aA0A0J9YTW6 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Scn2aA0A0J9YTW6 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Scn2aA0A0J9YTW6 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Scn2aA0A0J9YTW6 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Scn2aA0A0J9YTW6 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Scn2aA0A0J9YTW6 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Scn2aA0A0J9YTW6 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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