Protein–RNA interactions for Protein: A0A0A6YYE3

Trbv15, T cell receptor beta, variable 15 (Fragment), mousemouse

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Length 115 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv15A0A0A6YYE3 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trbv15A0A0A6YYE3 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trbv15A0A0A6YYE3 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trbv15A0A0A6YYE3 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trbv15A0A0A6YYE3 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trbv15A0A0A6YYE3 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trbv15A0A0A6YYE3 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trbv15A0A0A6YYE3 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trbv15A0A0A6YYE3 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trbv15A0A0A6YYE3 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trbv15A0A0A6YYE3 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trbv15A0A0A6YYE3 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Trbv15A0A0A6YYE3 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trbv15A0A0A6YYE3 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trbv15A0A0A6YYE3 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trbv15A0A0A6YYE3 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trbv15A0A0A6YYE3 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trbv15A0A0A6YYE3 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trbv15A0A0A6YYE3 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trbv15A0A0A6YYE3 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trbv15A0A0A6YYE3 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trbv15A0A0A6YYE3 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trbv15A0A0A6YYE3 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trbv15A0A0A6YYE3 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trbv15A0A0A6YYE3 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trbv15A0A0A6YYE3 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trbv15A0A0A6YYE3 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trbv15A0A0A6YYE3 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trbv15A0A0A6YYE3 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trbv15A0A0A6YYE3 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trbv15A0A0A6YYE3 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trbv15A0A0A6YYE3 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Trbv15A0A0A6YYE3 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trbv15A0A0A6YYE3 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trbv15A0A0A6YYE3 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trbv15A0A0A6YYE3 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trbv15A0A0A6YYE3 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trbv15A0A0A6YYE3 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trbv15A0A0A6YYE3 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trbv15A0A0A6YYE3 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trbv15A0A0A6YYE3 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Trbv15A0A0A6YYE3 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trbv15A0A0A6YYE3 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trbv15A0A0A6YYE3 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trbv15A0A0A6YYE3 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trbv15A0A0A6YYE3 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trbv15A0A0A6YYE3 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trbv15A0A0A6YYE3 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trbv15A0A0A6YYE3 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trbv15A0A0A6YYE3 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trbv15A0A0A6YYE3 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trbv15A0A0A6YYE3 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trbv15A0A0A6YYE3 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trbv15A0A0A6YYE3 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trbv15A0A0A6YYE3 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trbv15A0A0A6YYE3 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trbv15A0A0A6YYE3 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trbv15A0A0A6YYE3 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trbv15A0A0A6YYE3 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trbv15A0A0A6YYE3 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trbv15A0A0A6YYE3 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trbv15A0A0A6YYE3 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trbv15A0A0A6YYE3 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trbv15A0A0A6YYE3 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trbv15A0A0A6YYE3 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trbv15A0A0A6YYE3 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trbv15A0A0A6YYE3 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trbv15A0A0A6YYE3 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trbv15A0A0A6YYE3 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trbv15A0A0A6YYE3 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trbv15A0A0A6YYE3 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trbv15A0A0A6YYE3 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trbv15A0A0A6YYE3 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trbv15A0A0A6YYE3 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trbv15A0A0A6YYE3 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trbv15A0A0A6YYE3 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trbv15A0A0A6YYE3 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trbv15A0A0A6YYE3 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trbv15A0A0A6YYE3 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trbv15A0A0A6YYE3 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trbv15A0A0A6YYE3 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trbv15A0A0A6YYE3 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trbv15A0A0A6YYE3 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trbv15A0A0A6YYE3 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trbv15A0A0A6YYE3 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trbv15A0A0A6YYE3 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trbv15A0A0A6YYE3 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trbv15A0A0A6YYE3 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trbv15A0A0A6YYE3 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Trbv15A0A0A6YYE3 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trbv15A0A0A6YYE3 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trbv15A0A0A6YYE3 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trbv15A0A0A6YYE3 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trbv15A0A0A6YYE3 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trbv15A0A0A6YYE3 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trbv15A0A0A6YYE3 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trbv15A0A0A6YYE3 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Trbv15A0A0A6YYE3 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trbv15A0A0A6YYE3 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trbv15A0A0A6YYE3 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
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