Protein–RNA interactions for Protein: A0A0A6YX06

Trbv21, T cell receptor beta, variable 21 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv21A0A0A6YX06 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
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Trbv21A0A0A6YX06 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trbv21A0A0A6YX06 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trbv21A0A0A6YX06 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Trbv21A0A0A6YX06 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trbv21A0A0A6YX06 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trbv21A0A0A6YX06 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
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Trbv21A0A0A6YX06 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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Trbv21A0A0A6YX06 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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Trbv21A0A0A6YX06 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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Trbv21A0A0A6YX06 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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Trbv21A0A0A6YX06 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trbv21A0A0A6YX06 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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