Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBW8

COPS7A, COP9 signalosome complex subunit 7a, humanhuman

Predictions only

Length 275 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS7AQ9UBW8 AC069114.1-201ENST00000580927 287 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
COPS7AQ9UBW8 MYL12B-204ENST00000584539 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
COPS7AQ9UBW8 AL451007.1-201ENST00000595491 289 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
COPS7AQ9UBW8 AC010620.2-201ENST00000600135 313 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
COPS7AQ9UBW8 AL391813.2-201ENST00000609113 322 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
COPS7AQ9UBW8 AC108747.1-201ENST00000609508 535 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
COPS7AQ9UBW8 AC009159.1-201ENST00000618386 642 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
COPS7AQ9UBW8 AP002791.1-201ENST00000623291 381 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
COPS7AQ9UBW8 MGAT4C-210ENST00000620241 3194 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
COPS7AQ9UBW8 ZCCHC10-201ENST00000324170 2178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
COPS7AQ9UBW8 FGF14-201ENST00000376131 12882 ntTSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
COPS7AQ9UBW8 FOXP2-210ENST00000403559 6415 ntTSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
COPS7AQ9UBW8 KLRF1-202ENST00000354855 838 ntTSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
COPS7AQ9UBW8 RN7SKP58-201ENST00000411010 305 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
COPS7AQ9UBW8 RPL7P37-201ENST00000425095 738 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
COPS7AQ9UBW8 ELOCP14-201ENST00000428070 331 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
COPS7AQ9UBW8 AC010153.1-201ENST00000432862 727 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
COPS7AQ9UBW8 AC093579.1-201ENST00000439455 352 ntTSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
COPS7AQ9UBW8 ELOCP7-201ENST00000439968 331 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
COPS7AQ9UBW8 RPL21P2-201ENST00000440049 481 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
COPS7AQ9UBW8 DARS-AS1-205ENST00000444649 558 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
COPS7AQ9UBW8 AC096666.1-201ENST00000454965 348 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
COPS7AQ9UBW8 LINC01611-203ENST00000454981 504 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
COPS7AQ9UBW8 AC011825.1-201ENST00000484967 388 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
COPS7AQ9UBW8 RN7SL283P-201ENST00000489055 303 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
COPS7AQ9UBW8 DSTNP2-201ENST00000504533 515 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
COPS7AQ9UBW8 RPF2P2-201ENST00000504693 896 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
COPS7AQ9UBW8 AC114786.4-201ENST00000508771 728 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
COPS7AQ9UBW8 AC114797.1-201ENST00000514003 728 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
COPS7AQ9UBW8 AC116347.2-201ENST00000514912 523 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
COPS7AQ9UBW8 RNA5SP290-201ENST00000517133 127 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
COPS7AQ9UBW8 AC090802.1-201ENST00000520870 445 ntTSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
COPS7AQ9UBW8 MTCO1P47-201ENST00000523889 1271 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
COPS7AQ9UBW8 AC107882.1-201ENST00000530837 477 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
COPS7AQ9UBW8 AC008083.1-201ENST00000547748 663 ntTSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
COPS7AQ9UBW8 AC123904.2-201ENST00000548059 300 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
COPS7AQ9UBW8 ZNF321P-202ENST00000550843 495 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
COPS7AQ9UBW8 AL445074.1-201ENST00000555362 318 ntTSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
COPS7AQ9UBW8 AL157394.1-201ENST00000562983 1224 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
COPS7AQ9UBW8 PCMTD1P2-201ENST00000565017 355 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
COPS7AQ9UBW8 AC090772.1-201ENST00000583782 507 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
COPS7AQ9UBW8 ZRANB2-AS2-213ENST00000591654 719 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
COPS7AQ9UBW8 AC078899.3-201ENST00000599065 212 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
COPS7AQ9UBW8 KC877982.1-201ENST00000602313 470 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
COPS7AQ9UBW8 AC015871.2-201ENST00000603605 948 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
COPS7AQ9UBW8 DPPA3P3-201ENST00000603842 430 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
COPS7AQ9UBW8 AC103858.1-201ENST00000607019 476 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
COPS7AQ9UBW8 AC004223.4-201ENST00000612426 332 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
COPS7AQ9UBW8 AC090970.3-201ENST00000612566 866 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
COPS7AQ9UBW8 AC034102.8-201ENST00000615146 484 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
COPS7AQ9UBW8 ZRANB2-AS2-221ENST00000624050 629 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
COPS7AQ9UBW8 FAM46D-201ENST00000308293 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
COPS7AQ9UBW8 HMGN5-201ENST00000358130 2126 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
COPS7AQ9UBW8 LIPI-203ENST00000536861 1529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
COPS7AQ9UBW8 ECT2-211ENST00000441497 2825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
COPS7AQ9UBW8 AC096644.4-201ENST00000563417 2912 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
COPS7AQ9UBW8 MACC1-202ENST00000400331 9159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
COPS7AQ9UBW8 PABPC1P9-201ENST00000426076 1612 ntBASIC2.71□□□□□ -1.97
COPS7AQ9UBW8 EXOC6-203ENST00000371552 3564 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.97
COPS7AQ9UBW8 NOX4-202ENST00000343727 3347 ntTSL 2 BASIC2.71□□□□□ -1.98
COPS7AQ9UBW8 ASPN-201ENST00000375543 2237 ntTSL 2 BASIC2.71□□□□□ -1.98
COPS7AQ9UBW8 MS4A14-202ENST00000395001 3401 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
COPS7AQ9UBW8 MIR148B-201ENST00000362252 99 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
COPS7AQ9UBW8 RNU6-1167P-201ENST00000363227 94 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
COPS7AQ9UBW8 RNU6-501P-201ENST00000364072 100 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
COPS7AQ9UBW8 Y_RNA.245-201ENST00000364493 95 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
COPS7AQ9UBW8 U8.9-201ENST00000365667 134 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
COPS7AQ9UBW8 AL160162.1-202ENST00000417654 244 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
COPS7AQ9UBW8 AL365184.2-201ENST00000431139 435 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
COPS7AQ9UBW8 AL731563.2-201ENST00000431293 291 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
COPS7AQ9UBW8 AC017048.2-201ENST00000431455 822 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
COPS7AQ9UBW8 GTF2IP20-201ENST00000431663 360 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
COPS7AQ9UBW8 FCF1P1-201ENST00000432690 571 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
COPS7AQ9UBW8 LINC01884-201ENST00000433429 440 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
COPS7AQ9UBW8 MTND1P28-201ENST00000435623 950 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
COPS7AQ9UBW8 AL139237.2-201ENST00000438454 493 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
COPS7AQ9UBW8 AL512286.1-201ENST00000439244 400 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
COPS7AQ9UBW8 MRPS17P3-201ENST00000465453 385 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
COPS7AQ9UBW8 AC068587.2-201ENST00000478386 781 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
COPS7AQ9UBW8 RPS3AP14-201ENST00000483907 780 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
COPS7AQ9UBW8 SUMO2P6-201ENST00000505273 288 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
COPS7AQ9UBW8 AC034223.1-201ENST00000511054 599 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
COPS7AQ9UBW8 AC104211.1-202ENST00000521307 866 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
COPS7AQ9UBW8 AC087373.1-201ENST00000524920 491 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
COPS7AQ9UBW8 IL18-204ENST00000528832 795 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
COPS7AQ9UBW8 AP000790.2-201ENST00000534388 522 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
COPS7AQ9UBW8 AL359212.1-201ENST00000556608 614 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
COPS7AQ9UBW8 AC069029.1-201ENST00000558736 263 ntTSL 2 BASIC2.71□□□□□ -1.98
COPS7AQ9UBW8 AC037487.4-201ENST00000577423 625 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
COPS7AQ9UBW8 MIR3146-201ENST00000580367 79 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
COPS7AQ9UBW8 LINC01899-202ENST00000583756 575 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
COPS7AQ9UBW8 HMGN2P15-201ENST00000585707 270 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
COPS7AQ9UBW8 AC104365.1-201ENST00000588835 394 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
COPS7AQ9UBW8 RPL23AP78-201ENST00000599928 470 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
COPS7AQ9UBW8 MIR7844-201ENST00000616161 122 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
COPS7AQ9UBW8 AL365361.1-201ENST00000566942 3481 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
COPS7AQ9UBW8 FAM214A-201ENST00000261844 4217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
COPS7AQ9UBW8 AC108206.1-201ENST00000570186 4159 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
COPS7AQ9UBW8 CHD9-218ENST00000566029 13110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
COPS7AQ9UBW8 MTND5P29-201ENST00000458676 1807 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
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