Protein–RNA interactions for Protein: Q15262

PTPRK, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, humanhuman

Predictions only

Length 1,439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRKQ15262 AC023824.3-201ENST00000569003 562 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
PTPRKQ15262 GLUD1P4-201ENST00000590914 418 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
PTPRKQ15262 AC040174.2-201ENST00000602701 465 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
PTPRKQ15262 GAS5-AS1-201ENST00000602767 694 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
PTPRKQ15262 AL020997.3-201ENST00000602843 359 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
PTPRKQ15262 DUXAP4-201ENST00000603046 613 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
PTPRKQ15262 AC008083.4-201ENST00000615076 444 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
PTPRKQ15262 AP000676.4-201ENST00000624659 623 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
PTPRKQ15262 AC006026.1-201ENST00000444025 1803 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
PTPRKQ15262 EYS-205ENST00000393380 5450 ntTSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
PTPRKQ15262 AL513185.3-201ENST00000433335 1300 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
PTPRKQ15262 SGO1P1-201ENST00000603525 1447 ntBASIC2.34□□□□□ -2.04
PTPRKQ15262 Y_RNA.205-201ENST00000364128 113 ntBASIC2.34□□□□□ -2.04
PTPRKQ15262 SNORD82-201ENST00000365530 70 ntBASIC2.34□□□□□ -2.04
PTPRKQ15262 CLDN10-202ENST00000376855 701 ntTSL 2 BASIC2.34□□□□□ -2.04
PTPRKQ15262 DEFB133-201ENST00000398721 186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.04
PTPRKQ15262 FBXO11-203ENST00000405808 299 ntTSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.04
PTPRKQ15262 AL136369.2-201ENST00000420825 537 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.04
PTPRKQ15262 VN1R42P-201ENST00000424651 344 ntBASIC2.34□□□□□ -2.04
PTPRKQ15262 AL158840.1-202ENST00000425754 694 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.04
PTPRKQ15262 AL139081.1-201ENST00000452207 382 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.04
PTPRKQ15262 AC011586.1-201ENST00000521055 458 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.04
PTPRKQ15262 ARL2BPP5-201ENST00000523141 481 ntBASIC2.34□□□□□ -2.04
PTPRKQ15262 EEF1B2P4-201ENST00000551398 348 ntBASIC2.34□□□□□ -2.04
PTPRKQ15262 AL356804.1-201ENST00000553791 448 ntTSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.04
PTPRKQ15262 AC079791.1-201ENST00000605356 973 ntBASIC2.34□□□□□ -2.04
PTPRKQ15262 AC006213.5-201ENST00000619673 288 ntBASIC2.34□□□□□ -2.04
PTPRKQ15262 BX649567.1-201ENST00000642071 1134 ntBASIC2.34□□□□□ -2.04
PTPRKQ15262 RNA5SP139-201ENST00000364340 117 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
PTPRKQ15262 AL136133.1-201ENST00000413694 376 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
PTPRKQ15262 ZRANB2-AS2-204ENST00000430605 213 ntTSL 2 BASIC2.33□□□□□ -2.04
PTPRKQ15262 AC005208.1-201ENST00000435112 599 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
PTPRKQ15262 AC068533.3-201ENST00000435524 404 ntTSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
PTPRKQ15262 AL691517.1-201ENST00000440833 1235 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
PTPRKQ15262 KATNBL1P3-201ENST00000443475 909 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
PTPRKQ15262 OR51B8P-201ENST00000449892 769 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
PTPRKQ15262 AIG1P1-201ENST00000503376 148 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
PTPRKQ15262 AC093767.1-201ENST00000504523 156 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
PTPRKQ15262 LINC02103-201ENST00000512849 523 ntTSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
PTPRKQ15262 RNU6-1223P-201ENST00000517124 104 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
PTPRKQ15262 PKIA-203ENST00000518467 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
PTPRKQ15262 AC008015.1-201ENST00000555505 465 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
PTPRKQ15262 AL137100.2-201ENST00000555786 315 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
PTPRKQ15262 AC015720.1-201ENST00000565251 277 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
PTPRKQ15262 AC024614.2-201ENST00000577584 372 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
PTPRKQ15262 GALNT1-205ENST00000591081 1120 ntTSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
PTPRKQ15262 AC008764.5-201ENST00000597851 190 ntTSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
PTPRKQ15262 AC012669.1-201ENST00000603209 283 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
PTPRKQ15262 OR4H6P-202ENST00000603819 340 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
PTPRKQ15262 NUTF2P8-201ENST00000604593 363 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
PTPRKQ15262 AC010738.1-201ENST00000604970 987 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
PTPRKQ15262 KATNBL1P5-201ENST00000605015 517 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
PTPRKQ15262 AC025048.6-202ENST00000627667 438 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
PTPRKQ15262 NUP58P1-201ENST00000502546 1738 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
PTPRKQ15262 MIR96-201ENST00000362288 78 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
PTPRKQ15262 OR51A4-201ENST00000380373 1002 ntAPPRIS P1 BASIC2.32□□□□□ -2.04
PTPRKQ15262 MIR16-1-201ENST00000385271 89 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
PTPRKQ15262 AL136372.1-201ENST00000403060 228 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
PTPRKQ15262 AL049765.1-201ENST00000416237 573 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
PTPRKQ15262 HMGN2P38-201ENST00000423806 265 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
PTPRKQ15262 AC079780.1-201ENST00000428259 207 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
PTPRKQ15262 MTND2P29-201ENST00000438595 412 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
PTPRKQ15262 RNFT1P2-201ENST00000443064 757 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
PTPRKQ15262 AC073486.1-201ENST00000453278 531 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
PTPRKQ15262 AC006390.1-201ENST00000508068 283 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
PTPRKQ15262 CBX3P3-201ENST00000508108 532 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
PTPRKQ15262 RNA5SP364-201ENST00000516938 78 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
PTPRKQ15262 MED28P6-201ENST00000558776 231 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
PTPRKQ15262 LINC02126-202ENST00000563754 750 ntTSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
PTPRKQ15262 TTN-AS1-212ENST00000582847 1036 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
PTPRKQ15262 AC245036.5-201ENST00000596330 847 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
PTPRKQ15262 AC009318.4-201ENST00000620496 486 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
PTPRKQ15262 FLG-AS1-207ENST00000628475 497 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
PTPRKQ15262 AC073130.1-201ENST00000457033 1958 ntTSL 2 BASIC2.32□□□□□ -2.04
PTPRKQ15262 MLF1-203ENST00000392822 2157 ntTSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
PTPRKQ15262 CYSLTR1-203ENST00000614798 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
PTPRKQ15262 TRIQK-201ENST00000378861 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
PTPRKQ15262 OR5T3-201ENST00000303059 1023 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
PTPRKQ15262 Y_RNA.178-201ENST00000363832 102 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
PTPRKQ15262 RNU6-115P-201ENST00000364310 107 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
PTPRKQ15262 RNU1-93P-201ENST00000364704 169 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
PTPRKQ15262 RNU6-650P-201ENST00000365658 111 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
PTPRKQ15262 AL589880.1-201ENST00000448271 287 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
PTPRKQ15262 NDUFA5P7-201ENST00000452914 242 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
PTPRKQ15262 AC117386.2-202ENST00000472821 522 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
PTPRKQ15262 SETP11-201ENST00000473027 690 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
PTPRKQ15262 MTND3P24-201ENST00000506306 329 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
PTPRKQ15262 RNU6-1095P-201ENST00000516148 108 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
PTPRKQ15262 AC087362.2-201ENST00000529325 256 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
PTPRKQ15262 AL359238.1-201ENST00000557770 744 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
PTPRKQ15262 AP002826.1-201ENST00000608835 315 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
PTPRKQ15262 CC2D2B-209ENST00000618242 980 ntTSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
PTPRKQ15262 ZDBF2-202ENST00000611847 9890 ntTSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
PTPRKQ15262 PTPRQ-208ENST00000614701 8289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
PTPRKQ15262 TEX41-202ENST00000414256 604 ntTSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
PTPRKQ15262 AC092447.6-201ENST00000414578 210 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
PTPRKQ15262 AC010967.2-201ENST00000418451 333 ntTSL 2 BASIC2.3□□□□□ -2.04
PTPRKQ15262 LINC01780-201ENST00000420059 442 ntTSL 2 BASIC2.3□□□□□ -2.04
PTPRKQ15262 RPL27AP8-201ENST00000424277 446 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
PTPRKQ15262 AC012497.1-201ENST00000429392 575 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103 ms