Protein–RNA interactions for Protein: Q13838

DDX39B, Spliceosome RNA helicase DDX39B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39BQ13838 AC096576.1-201ENST00000489014 359 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
DDX39BQ13838 AC079395.1-201ENST00000510981 262 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
DDX39BQ13838 SNORA19.3-201ENST00000516165 130 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
DDX39BQ13838 LINC00824-201ENST00000517583 805 ntTSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
DDX39BQ13838 NARSP2-202ENST00000522022 349 ntTSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
DDX39BQ13838 AC023538.1-201ENST00000534576 736 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
DDX39BQ13838 AL136146.2-201ENST00000534594 494 ntTSL 2 BASIC2.46□□□□□ -2.02
DDX39BQ13838 AP000462.3-201ENST00000545593 330 ntTSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
DDX39BQ13838 AC009712.1-201ENST00000564938 316 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
DDX39BQ13838 AC024619.4-201ENST00000580924 316 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
DDX39BQ13838 MIR3199-1-201ENST00000582434 88 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
DDX39BQ13838 OR2AS2P-201ENST00000606902 342 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
DDX39BQ13838 AC131235.4-201ENST00000609288 620 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
DDX39BQ13838 AC092574.1-201ENST00000609771 420 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
DDX39BQ13838 AL591441.2-201ENST00000620059 535 ntTSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
DDX39BQ13838 WARS-244ENST00000627608 123 ntTSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
DDX39BQ13838 MIR3199-2-201ENST00000636243 86 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
DDX39BQ13838 AC013437.2-201ENST00000639587 677 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
DDX39BQ13838 MTND5P29-201ENST00000458676 1807 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
DDX39BQ13838 PCF11-AS1-201ENST00000602322 1516 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
DDX39BQ13838 RRAS2-211ENST00000537760 2034 ntTSL 2 BASIC2.46□□□□□ -2.02
DDX39BQ13838 RNU6-853P-201ENST00000364306 107 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
DDX39BQ13838 IVNS1ABP-201ENST00000367497 746 ntTSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
DDX39BQ13838 AL139039.1-201ENST00000401900 692 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
DDX39BQ13838 AC006150.1-201ENST00000412014 263 ntTSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
DDX39BQ13838 RPL26P27-201ENST00000414397 437 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
DDX39BQ13838 BTF3L4P3-201ENST00000418879 476 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
DDX39BQ13838 MTND1P28-201ENST00000435623 950 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
DDX39BQ13838 AL357140.2-201ENST00000445884 440 ntTSL 3 BASIC2.45□□□□□ -2.02
DDX39BQ13838 AC020550.1-201ENST00000447385 163 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
DDX39BQ13838 LEKR1-206ENST00000483177 546 ntTSL 3 BASIC2.45□□□□□ -2.02
DDX39BQ13838 AC108729.1-201ENST00000487812 947 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
DDX39BQ13838 SRI-210ENST00000490437 570 ntTSL 2 BASIC2.45□□□□□ -2.02
DDX39BQ13838 HMGB3P3-201ENST00000510526 400 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
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DDX39BQ13838 AC011405.1-201ENST00000514207 248 ntTSL 3 BASIC2.45□□□□□ -2.02
DDX39BQ13838 AC068880.3-201ENST00000519185 179 ntTSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
DDX39BQ13838 C14orf105-204ENST00000526336 598 ntTSL 4 BASIC2.45□□□□□ -2.02
DDX39BQ13838 MAL2-203ENST00000534619 578 ntTSL 4 BASIC2.45□□□□□ -2.02
DDX39BQ13838 LINC02165-201ENST00000563061 443 ntTSL 3 BASIC2.45□□□□□ -2.02
DDX39BQ13838 AC134669.2-201ENST00000578584 1008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.45□□□□□ -2.02
DDX39BQ13838 AC217774.1-201ENST00000578936 517 ntTSL 4 BASIC2.45□□□□□ -2.02
DDX39BQ13838 AC060771.1-201ENST00000582031 164 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
DDX39BQ13838 C4orf22-209ENST00000621014 228 ntTSL 3 BASIC2.45□□□□□ -2.02
DDX39BQ13838 SEPT14P19-202ENST00000632397 370 ntTSL 3 BASIC2.45□□□□□ -2.02
DDX39BQ13838 AC106858.1-201ENST00000637497 429 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
DDX39BQ13838 TXLNGY-201ENST00000253320 7299 ntTSL 2 BASIC2.45□□□□□ -2.02
DDX39BQ13838 NEB-203ENST00000397345 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
DDX39BQ13838 NEB-209ENST00000427231 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
DDX39BQ13838 AL355596.1-201ENST00000565399 3996 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
DDX39BQ13838 OR13C4-201ENST00000277216 957 ntAPPRIS P1 BASIC2.44□□□□□ -2.02
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DDX39BQ13838 MDM4-202ENST00000367180 547 ntTSL 3 BASIC2.44□□□□□ -2.02
DDX39BQ13838 MEIG1-201ENST00000378240 507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.44□□□□□ -2.02
DDX39BQ13838 RNU1-73P-201ENST00000383971 164 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
DDX39BQ13838 MIR196B-201ENST00000384852 84 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
DDX39BQ13838 MIR34A-201ENST00000385130 110 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
DDX39BQ13838 USP9YP33-201ENST00000412220 421 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
DDX39BQ13838 USP9YP26-201ENST00000421008 661 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
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DDX39BQ13838 MICF-203ENST00000432679 129 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
DDX39BQ13838 USP9YP35-201ENST00000435696 412 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
DDX39BQ13838 AC004691.1-201ENST00000440376 547 ntTSL 3 BASIC2.44□□□□□ -2.02
DDX39BQ13838 AL118523.1-201ENST00000444436 480 ntTSL 3 BASIC2.44□□□□□ -2.02
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DDX39BQ13838 AL441989.1-201ENST00000454204 382 ntTSL 3 BASIC2.44□□□□□ -2.02
DDX39BQ13838 AL583803.1-201ENST00000454262 334 ntTSL 3 BASIC2.44□□□□□ -2.02
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DDX39BQ13838 AC012379.1-201ENST00000558304 406 ntTSL 3 BASIC2.44□□□□□ -2.02
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DDX39BQ13838 AC012146.1-204ENST00000570712 426 ntTSL 3 BASIC2.44□□□□□ -2.02
DDX39BQ13838 MIR4319-201ENST00000577285 85 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
DDX39BQ13838 MIR5092-201ENST00000583139 88 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
DDX39BQ13838 BNIP3P27-201ENST00000599991 412 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
DDX39BQ13838 AC098617.1-216ENST00000602099 708 ntTSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
DDX39BQ13838 AL391813.1-201ENST00000603098 260 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
DDX39BQ13838 AC025588.2-201ENST00000604851 466 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
DDX39BQ13838 AC005332.10-201ENST00000612725 619 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
DDX39BQ13838 AC092608.2-201ENST00000624427 218 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
DDX39BQ13838 PCMTD1P7-201ENST00000634506 357 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
DDX39BQ13838 AC116618.1-201ENST00000634617 774 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
DDX39BQ13838 U2.21-201ENST00000637295 81 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
DDX39BQ13838 CBLL1-201ENST00000222597 2003 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
DDX39BQ13838 FGF7-201ENST00000267843 5467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
DDX39BQ13838 CYLC2-201ENST00000374798 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
DDX39BQ13838 LINC01592-202ENST00000518540 2367 ntTSL 2 BASIC2.43□□□□□ -2.02
DDX39BQ13838 STARD6-201ENST00000307844 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
DDX39BQ13838 OR5AC2-201ENST00000358642 930 ntAPPRIS P1 BASIC2.43□□□□□ -2.02
DDX39BQ13838 RNU6-778P-201ENST00000363269 103 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
DDX39BQ13838 SNORA80A-201ENST00000363922 136 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
DDX39BQ13838 DEFA7P-201ENST00000382676 285 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
DDX39BQ13838 AL162578.1-201ENST00000406202 378 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
DDX39BQ13838 LANCL1-AS1-202ENST00000420418 476 ntTSL 3 BASIC2.43□□□□□ -2.02
DDX39BQ13838 AL391832.1-201ENST00000423963 423 ntTSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
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