Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAM2

RASGEF1B, Ras-GEF domain-containing family member 1B, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASGEF1BQ0VAM2 FIGNL1-212ENST00000613602 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
RASGEF1BQ0VAM2 MTND5P27-201ENST00000428871 1720 ntBASIC2.96□□□□□ -1.93
RASGEF1BQ0VAM2 NEB-220ENST00000618972 26307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
RASGEF1BQ0VAM2 PRB2-201ENST00000389362 1429 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
RASGEF1BQ0VAM2 AL049641.1-201ENST00000441055 1948 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
RASGEF1BQ0VAM2 FAM35BP-202ENST00000497389 3337 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
RASGEF1BQ0VAM2 RNA5SP267-201ENST00000364893 126 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
RASGEF1BQ0VAM2 DYNLT3P1-201ENST00000378574 347 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
RASGEF1BQ0VAM2 RNU6-297P-201ENST00000384636 107 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
RASGEF1BQ0VAM2 MIR491-201ENST00000384877 84 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
RASGEF1BQ0VAM2 STAP1-202ENST00000396225 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
RASGEF1BQ0VAM2 ZNF90P2-204ENST00000419323 1075 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
RASGEF1BQ0VAM2 AC091390.3-201ENST00000426478 338 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
RASGEF1BQ0VAM2 AC119618.1-201ENST00000434191 222 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
RASGEF1BQ0VAM2 AL360169.1-201ENST00000435116 143 ntTSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
RASGEF1BQ0VAM2 AC016644.1-201ENST00000438553 434 ntTSL 2 BASIC2.96□□□□□ -1.94
RASGEF1BQ0VAM2 USP9YP15-201ENST00000442391 422 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
RASGEF1BQ0VAM2 AL360221.1-201ENST00000445989 335 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
RASGEF1BQ0VAM2 AL589678.1-201ENST00000452685 561 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
RASGEF1BQ0VAM2 SATB1-AS1-204ENST00000453361 726 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
RASGEF1BQ0VAM2 AC005538.1-201ENST00000455991 594 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
RASGEF1BQ0VAM2 AL122001.1-201ENST00000457027 370 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
RASGEF1BQ0VAM2 LINC01510-203ENST00000458082 626 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
RASGEF1BQ0VAM2 RNU6-420P-201ENST00000458780 107 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
RASGEF1BQ0VAM2 RBM43P1-201ENST00000476891 1081 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
RASGEF1BQ0VAM2 HSPD1P15-201ENST00000505573 1122 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
RASGEF1BQ0VAM2 AC026427.2-201ENST00000506228 536 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
RASGEF1BQ0VAM2 AC010424.1-201ENST00000506336 297 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
RASGEF1BQ0VAM2 AC104663.1-201ENST00000508555 557 ntTSL 2 BASIC2.96□□□□□ -1.94
RASGEF1BQ0VAM2 TTC39CP1-201ENST00000512513 755 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
RASGEF1BQ0VAM2 AC063919.1-201ENST00000514281 254 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
RASGEF1BQ0VAM2 RNA5SP337-201ENST00000517007 109 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
RASGEF1BQ0VAM2 AC068657.1-201ENST00000520807 306 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
RASGEF1BQ0VAM2 AL138812.1-201ENST00000525573 471 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
RASGEF1BQ0VAM2 AC010185.1-201ENST00000542489 456 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
RASGEF1BQ0VAM2 AC096558.2-201ENST00000546678 506 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
RASGEF1BQ0VAM2 RPS3AP4-201ENST00000555161 764 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
RASGEF1BQ0VAM2 AL445074.1-201ENST00000555362 318 ntTSL 2 BASIC2.96□□□□□ -1.94
RASGEF1BQ0VAM2 HMGB1P14-201ENST00000557424 591 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
RASGEF1BQ0VAM2 AC016987.2-201ENST00000560696 351 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
RASGEF1BQ0VAM2 AC012378.1-201ENST00000561155 364 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
RASGEF1BQ0VAM2 AC127024.3-201ENST00000582841 460 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
RASGEF1BQ0VAM2 MIR5195-201ENST00000583555 115 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
RASGEF1BQ0VAM2 AC012593.1-213ENST00000587255 510 ntTSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
RASGEF1BQ0VAM2 AC002545.1-201ENST00000592511 181 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
RASGEF1BQ0VAM2 AC119751.7-201ENST00000600494 245 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
RASGEF1BQ0VAM2 AC080013.6-201ENST00000606185 215 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
RASGEF1BQ0VAM2 CEP164P1-207ENST00000608660 504 ntTSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
RASGEF1BQ0VAM2 DLEU2_1.1-201ENST00000612089 120 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
RASGEF1BQ0VAM2 DLEU2_1.2-201ENST00000614667 120 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
RASGEF1BQ0VAM2 PISRT1-201ENST00000626175 531 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
RASGEF1BQ0VAM2 MTND1P37-201ENST00000636562 264 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
RASGEF1BQ0VAM2 ABBA01000935.2-201ENST00000637477 838 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
RASGEF1BQ0VAM2 PSMD5-AS1-215ENST00000640622 205 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
RASGEF1BQ0VAM2 FARSBP1-201ENST00000435808 1778 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
RASGEF1BQ0VAM2 ABCC9-202ENST00000261201 4650 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
RASGEF1BQ0VAM2 SEPT7-205ENST00000432293 1362 ntTSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
RASGEF1BQ0VAM2 DMD-203ENST00000357033 13956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
RASGEF1BQ0VAM2 GNAI3-201ENST00000369851 27174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
RASGEF1BQ0VAM2 AC022336.2-201ENST00000568966 2538 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
RASGEF1BQ0VAM2 CC2D2B-210ENST00000636965 3247 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
RASGEF1BQ0VAM2 SLC30A6-202ENST00000357055 4758 ntTSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
RASGEF1BQ0VAM2 PHF6-205ENST00000625464 4434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
RASGEF1BQ0VAM2 C12orf4-201ENST00000261250 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
RASGEF1BQ0VAM2 RNU5E-1-201ENST00000362477 120 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
RASGEF1BQ0VAM2 U8.3-201ENST00000363321 132 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
RASGEF1BQ0VAM2 RNU6-525P-201ENST00000363685 104 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
RASGEF1BQ0VAM2 RNU4-40P-201ENST00000364351 143 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
RASGEF1BQ0VAM2 RPL5P18-201ENST00000406671 891 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
RASGEF1BQ0VAM2 RNU2-33P-201ENST00000410344 192 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
RASGEF1BQ0VAM2 RPL32P35-201ENST00000415214 394 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
RASGEF1BQ0VAM2 AC000123.1-201ENST00000418215 516 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
RASGEF1BQ0VAM2 AC092047.1-201ENST00000424997 240 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
RASGEF1BQ0VAM2 AC104332.2-201ENST00000429959 156 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
RASGEF1BQ0VAM2 FCF1P1-201ENST00000432690 571 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
RASGEF1BQ0VAM2 OR2B8P-201ENST00000432841 938 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
RASGEF1BQ0VAM2 AC009961.2-201ENST00000435771 251 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
RASGEF1BQ0VAM2 CST9LP2-201ENST00000437612 320 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
RASGEF1BQ0VAM2 AL117336.1-201ENST00000439198 380 ntTSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
RASGEF1BQ0VAM2 AL022238.1-201ENST00000442557 355 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
RASGEF1BQ0VAM2 MTATP6P30-201ENST00000443540 664 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
RASGEF1BQ0VAM2 USP9YP29-201ENST00000445112 563 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
RASGEF1BQ0VAM2 AP000936.2-201ENST00000447151 681 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
RASGEF1BQ0VAM2 GAPDHP17-201ENST00000449858 1001 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
RASGEF1BQ0VAM2 AC098820.1-201ENST00000453157 512 ntTSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
RASGEF1BQ0VAM2 AC013267.1-201ENST00000458227 267 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
RASGEF1BQ0VAM2 AC087588.1-201ENST00000462203 316 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
RASGEF1BQ0VAM2 MTND4LP3-201ENST00000468320 276 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
RASGEF1BQ0VAM2 RN7SL807P-201ENST00000470923 297 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
RASGEF1BQ0VAM2 RPL21P13-201ENST00000488305 481 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
RASGEF1BQ0VAM2 ARL2BPP4-201ENST00000506854 471 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
RASGEF1BQ0VAM2 ARL4AP2-201ENST00000507378 601 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
RASGEF1BQ0VAM2 NDUFB4P2-201ENST00000509515 391 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
RASGEF1BQ0VAM2 LINC01861-201ENST00000509568 537 ntTSL 4 BASIC2.95□□□□□ -1.94
RASGEF1BQ0VAM2 RNA5SP291-201ENST00000517222 105 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
RASGEF1BQ0VAM2 AC084116.3-201ENST00000519123 429 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
RASGEF1BQ0VAM2 AC022679.1-202ENST00000520251 376 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
RASGEF1BQ0VAM2 A2ML1-AS1-201ENST00000537288 452 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
RASGEF1BQ0VAM2 AC005476.1-201ENST00000554427 397 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
RASGEF1BQ0VAM2 TRAV28-201ENST00000557548 323 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
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