Protein–RNA interactions for Protein: Q1ED39

KNOP1, Lysine-rich nucleolar protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNOP1Q1ED39 C3orf85-208ENST00000622536 925 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
KNOP1Q1ED39 AC093591.3-201ENST00000634516 308 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
KNOP1Q1ED39 IL6ST-205ENST00000381294 2574 ntTSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
KNOP1Q1ED39 APC-201ENST00000257430 10701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
KNOP1Q1ED39 SLC30A6-202ENST00000357055 4758 ntTSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
KNOP1Q1ED39 CHD9-218ENST00000566029 13110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
KNOP1Q1ED39 MTCO1P9-201ENST00000505577 1534 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
KNOP1Q1ED39 TMEM59-205ENST00000371348 1911 ntTSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
KNOP1Q1ED39 TAB2-201ENST00000367456 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
KNOP1Q1ED39 OR5B3-201ENST00000309403 945 ntAPPRIS P1 BASIC2.94□□□□□ -1.94
KNOP1Q1ED39 RNU6-1078P-201ENST00000364522 103 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
KNOP1Q1ED39 SNORD116-1-201ENST00000384335 95 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
KNOP1Q1ED39 SAR1AP2-201ENST00000392696 594 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
KNOP1Q1ED39 ZNF705D-201ENST00000400078 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.94□□□□□ -1.94
KNOP1Q1ED39 AL136372.1-201ENST00000403060 228 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
KNOP1Q1ED39 AL354719.1-201ENST00000406535 843 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
KNOP1Q1ED39 AL031121.1-201ENST00000406553 254 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
KNOP1Q1ED39 HSPE1P1-201ENST00000421494 318 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
KNOP1Q1ED39 AC013401.1-202ENST00000422017 626 ntTSL 2 BASIC2.94□□□□□ -1.94
KNOP1Q1ED39 AL109947.1-201ENST00000423747 382 ntTSL 2 BASIC2.94□□□□□ -1.94
KNOP1Q1ED39 USP9YP36-201ENST00000424581 829 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
KNOP1Q1ED39 MTATP6P4-201ENST00000427725 675 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
KNOP1Q1ED39 UBE2E2-AS1-202ENST00000430018 499 ntTSL 2 BASIC2.94□□□□□ -1.94
KNOP1Q1ED39 AC098826.1-201ENST00000433943 471 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
KNOP1Q1ED39 AC129850.1-201ENST00000436203 508 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
KNOP1Q1ED39 COX6CP2-201ENST00000444980 225 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
KNOP1Q1ED39 RAC1P7-201ENST00000445367 377 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
KNOP1Q1ED39 AL163192.1-201ENST00000448858 708 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
KNOP1Q1ED39 AC234775.1-201ENST00000454247 670 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
KNOP1Q1ED39 LINC00374-201ENST00000454780 800 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
KNOP1Q1ED39 AC116337.2-201ENST00000477662 156 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
KNOP1Q1ED39 RPS3AP14-201ENST00000483907 780 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
KNOP1Q1ED39 LINC01957-201ENST00000506392 751 ntTSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
KNOP1Q1ED39 AC022483.1-201ENST00000514020 567 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
KNOP1Q1ED39 AC106895.1-201ENST00000515825 548 ntTSL 4 BASIC2.94□□□□□ -1.94
KNOP1Q1ED39 RN7SKP132-201ENST00000516001 208 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
KNOP1Q1ED39 NDST1-AS1-201ENST00000519040 368 ntTSL 2 BASIC2.94□□□□□ -1.94
KNOP1Q1ED39 MTND4LP18-201ENST00000526864 291 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
KNOP1Q1ED39 PIGY-201ENST00000527353 217 ntAPPRIS P1 BASIC2.94□□□□□ -1.94
KNOP1Q1ED39 AC007513.1-201ENST00000548740 379 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
KNOP1Q1ED39 GNG2-205ENST00000554736 569 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC2.94□□□□□ -1.94
KNOP1Q1ED39 AL139317.3-202ENST00000555689 528 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
KNOP1Q1ED39 MEG8-218ENST00000556720 456 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
KNOP1Q1ED39 AC074052.2-201ENST00000562516 214 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
KNOP1Q1ED39 AC092378.2-202ENST00000569328 445 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
KNOP1Q1ED39 AC060771.1-201ENST00000582031 164 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
KNOP1Q1ED39 ELOCP29-201ENST00000588193 334 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
KNOP1Q1ED39 AC002076.2-201ENST00000617362 122 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
KNOP1Q1ED39 AC012150.2-201ENST00000621300 544 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
KNOP1Q1ED39 OR5B3-202ENST00000641865 1046 ntAPPRIS P1 BASIC2.94□□□□□ -1.94
KNOP1Q1ED39 FGF14-201ENST00000376131 12882 ntTSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
KNOP1Q1ED39 AC092125.1-201ENST00000562568 1995 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
KNOP1Q1ED39 AKAP9-202ENST00000358100 10309 ntTSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
KNOP1Q1ED39 DNAJC2-201ENST00000249270 1846 ntTSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
KNOP1Q1ED39 AC009812.4-201ENST00000569134 1805 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
KNOP1Q1ED39 MTND4P4-201ENST00000439033 1366 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
KNOP1Q1ED39 RNU5F-7P-201ENST00000363696 115 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
KNOP1Q1ED39 RNU6-809P-201ENST00000384461 107 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
KNOP1Q1ED39 RNU1-101P-201ENST00000391171 127 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
KNOP1Q1ED39 AL360182.1-201ENST00000397433 468 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
KNOP1Q1ED39 RPS3AP24-201ENST00000407896 734 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
KNOP1Q1ED39 MTND1P21-201ENST00000412991 285 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
KNOP1Q1ED39 RPL17P12-201ENST00000413391 526 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
KNOP1Q1ED39 TCF7L1-IT1-201ENST00000433581 458 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
KNOP1Q1ED39 AC004866.2-201ENST00000438285 481 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
KNOP1Q1ED39 AL121871.1-201ENST00000443413 436 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
KNOP1Q1ED39 COX6CP12-201ENST00000446748 202 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
KNOP1Q1ED39 AC092162.2-204ENST00000451851 566 ntTSL 4 BASIC2.93□□□□□ -1.94
KNOP1Q1ED39 GSTA11P-201ENST00000452866 669 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
KNOP1Q1ED39 LINC00430-201ENST00000457672 597 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
KNOP1Q1ED39 GPX5-203ENST00000469384 428 ntTSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
KNOP1Q1ED39 ATP6V1G3-204ENST00000489986 449 ntTSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
KNOP1Q1ED39 AC109466.1-211ENST00000519327 496 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
KNOP1Q1ED39 AC060788.1-201ENST00000521318 469 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
KNOP1Q1ED39 ERHP1-201ENST00000523006 310 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
KNOP1Q1ED39 C11orf1-204ENST00000530214 599 ntTSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
KNOP1Q1ED39 ACTR3BP3-201ENST00000565577 979 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
KNOP1Q1ED39 MTCO3P24-201ENST00000572729 782 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
KNOP1Q1ED39 MIR5697-201ENST00000578045 78 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
KNOP1Q1ED39 AC069114.1-201ENST00000580927 287 ntTSL 2 BASIC2.93□□□□□ -1.94
KNOP1Q1ED39 MIR4635-201ENST00000583759 79 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
KNOP1Q1ED39 ABBA01006766.1-201ENST00000584728 294 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
KNOP1Q1ED39 AC012065.4-201ENST00000602445 679 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
KNOP1Q1ED39 AC012443.1-201ENST00000605605 231 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
KNOP1Q1ED39 AC083798.2-205ENST00000608015 575 ntTSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
KNOP1Q1ED39 AC009570.1-201ENST00000609599 745 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
KNOP1Q1ED39 AC073114.1-201ENST00000612027 490 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
KNOP1Q1ED39 TMBIM4-213ENST00000613669 851 ntTSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
KNOP1Q1ED39 AL450472.3-201ENST00000615578 367 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
KNOP1Q1ED39 AC104010.1-201ENST00000616889 150 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
KNOP1Q1ED39 DLEU1_1.1-201ENST00000618107 190 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
KNOP1Q1ED39 AC009268.2-201ENST00000621925 457 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
KNOP1Q1ED39 Z69908.1-201ENST00000622603 247 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
KNOP1Q1ED39 OR9G4-203ENST00000641581 2603 ntAPPRIS P1 BASIC2.93□□□□□ -1.94
KNOP1Q1ED39 AC114316.2-202ENST00000502934 2957 ntTSL 2 BASIC2.93□□□□□ -1.94
KNOP1Q1ED39 OR4K2-204ENST00000641885 8681 ntAPPRIS P1 BASIC2.93□□□□□ -1.94
KNOP1Q1ED39 METTL18-201ENST00000303469 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
KNOP1Q1ED39 AC090740.1-201ENST00000623193 2262 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
KNOP1Q1ED39 OR5J1P-201ENST00000313544 939 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
KNOP1Q1ED39 OR52E6-201ENST00000329322 970 ntAPPRIS P1 BASIC2.92□□□□□ -1.94
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