Protein–RNA interactions for Protein: Q15904

ATP6AP1, V-type proton ATPase subunit S1, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6AP1Q15904 AC010133.1-201ENST00000615809 842 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
ATP6AP1Q15904 AC140725.3-201ENST00000616193 880 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
ATP6AP1Q15904 HOTAIRM1_2.1-201ENST00000616712 215 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
ATP6AP1Q15904 C3orf85-208ENST00000622536 925 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
ATP6AP1Q15904 AL109837.2-201ENST00000632608 295 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
ATP6AP1Q15904 ATP11C-201ENST00000327569 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
ATP6AP1Q15904 XPO4-202ENST00000400602 9884 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
ATP6AP1Q15904 OGN-201ENST00000262551 2971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
ATP6AP1Q15904 DENND4A-202ENST00000443035 8665 ntTSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
ATP6AP1Q15904 AC092125.1-201ENST00000562568 1995 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
ATP6AP1Q15904 KERA-201ENST00000266719 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
ATP6AP1Q15904 OR5B3-201ENST00000309403 945 ntAPPRIS P1 BASIC2.38□□□□□ -2.03
ATP6AP1Q15904 RNU6-1214P-201ENST00000363650 109 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
ATP6AP1Q15904 RNU1-112P-201ENST00000364401 164 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
ATP6AP1Q15904 LINC00587-201ENST00000374801 590 ntTSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
ATP6AP1Q15904 RNU6-198P-201ENST00000384258 104 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
ATP6AP1Q15904 RNU6-1035P-201ENST00000384477 107 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
ATP6AP1Q15904 AC119751.3-201ENST00000399720 670 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
ATP6AP1Q15904 AF130351.1-202ENST00000400562 808 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
ATP6AP1Q15904 TXNP7-201ENST00000406296 293 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
ATP6AP1Q15904 AC080125.1-201ENST00000414888 684 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
ATP6AP1Q15904 AL451054.2-201ENST00000420896 202 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
ATP6AP1Q15904 AC093019.2-201ENST00000432294 384 ntTSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
ATP6AP1Q15904 AL033504.1-204ENST00000434985 413 ntTSL 2 BASIC2.38□□□□□ -2.03
ATP6AP1Q15904 UBE2FP3-201ENST00000436366 524 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
ATP6AP1Q15904 AP000146.1-202ENST00000441666 441 ntTSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
ATP6AP1Q15904 AL606662.1-201ENST00000445763 553 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
ATP6AP1Q15904 SNRPG-206ENST00000454893 527 ntTSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
ATP6AP1Q15904 AL136164.1-201ENST00000456795 352 ntTSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
ATP6AP1Q15904 AL359095.1-201ENST00000457383 635 ntTSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
ATP6AP1Q15904 THAP6-205ENST00000504190 1004 ntTSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
ATP6AP1Q15904 AC107222.1-201ENST00000510899 637 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
ATP6AP1Q15904 RNU6-1282P-201ENST00000516735 96 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
ATP6AP1Q15904 MYL12A-202ENST00000536605 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
ATP6AP1Q15904 AC078880.1-201ENST00000546696 553 ntTSL 4 BASIC2.38□□□□□ -2.03
ATP6AP1Q15904 AL161757.2-201ENST00000553800 421 ntTSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
ATP6AP1Q15904 HMGB1P6-201ENST00000569046 646 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
ATP6AP1Q15904 RPL23AP84-201ENST00000571193 464 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
ATP6AP1Q15904 MYL12A-209ENST00000580887 899 ntTSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
ATP6AP1Q15904 MIR4444-1-201ENST00000581696 74 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
ATP6AP1Q15904 MIR4444-2-201ENST00000584390 74 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
ATP6AP1Q15904 MIR4760-201ENST00000585040 80 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
ATP6AP1Q15904 AC008739.2-201ENST00000597006 317 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
ATP6AP1Q15904 AC079089.3-201ENST00000603094 673 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
ATP6AP1Q15904 HNRNPDLP4-201ENST00000605144 301 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
ATP6AP1Q15904 AP000240.1-201ENST00000609910 452 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
ATP6AP1Q15904 UBE2Q2P6-201ENST00000612666 153 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
ATP6AP1Q15904 AP000676.3-201ENST00000623299 569 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
ATP6AP1Q15904 AC110079.1-202ENST00000635213 138 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
ATP6AP1Q15904 ABBA01000935.2-201ENST00000637477 838 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
ATP6AP1Q15904 OR5B3-202ENST00000641865 1046 ntAPPRIS P1 BASIC2.38□□□□□ -2.03
ATP6AP1Q15904 MAPK10-266ENST00000641066 6555 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
ATP6AP1Q15904 DDIAS-201ENST00000329143 3367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
ATP6AP1Q15904 AC026241.1-201ENST00000517873 2142 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
ATP6AP1Q15904 RGPD1-204ENST00000559485 5247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
ATP6AP1Q15904 LUZP4-201ENST00000371920 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
ATP6AP1Q15904 TECRL-202ENST00000507440 2876 ntTSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
ATP6AP1Q15904 SPA17-201ENST00000227135 853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
ATP6AP1Q15904 Y_RNA.302-201ENST00000364997 102 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
ATP6AP1Q15904 DEFB119-202ENST00000376315 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
ATP6AP1Q15904 SNORA80E-201ENST00000384744 137 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
ATP6AP1Q15904 MIR19A-201ENST00000384878 82 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
ATP6AP1Q15904 AL109755.1-201ENST00000401791 649 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
ATP6AP1Q15904 ZRANB2-AS2-201ENST00000411721 518 ntTSL 3 BASIC2.37□□□□□ -2.03
ATP6AP1Q15904 AL158834.1-201ENST00000419441 466 ntTSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
ATP6AP1Q15904 NBDY-202ENST00000423617 543 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.37□□□□□ -2.03
ATP6AP1Q15904 LINC02095-201ENST00000430908 346 ntTSL 2 BASIC2.37□□□□□ -2.03
ATP6AP1Q15904 AL354941.1-201ENST00000438600 464 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
ATP6AP1Q15904 BNIP3P2-201ENST00000441221 577 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
ATP6AP1Q15904 MTCO3P45-201ENST00000443036 613 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
ATP6AP1Q15904 BMI1P1-201ENST00000445879 941 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
ATP6AP1Q15904 AL139081.1-201ENST00000452207 382 ntTSL 3 BASIC2.37□□□□□ -2.03
ATP6AP1Q15904 DCLRE1CP1-201ENST00000454630 470 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
ATP6AP1Q15904 AC092422.1-201ENST00000455576 584 ntTSL 4 BASIC2.37□□□□□ -2.03
ATP6AP1Q15904 AL358832.1-201ENST00000497800 389 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
ATP6AP1Q15904 LINC02377-201ENST00000500169 450 ntTSL 3 BASIC2.37□□□□□ -2.03
ATP6AP1Q15904 SLC25A15P5-201ENST00000508033 253 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
ATP6AP1Q15904 RNA5SP367-201ENST00000516557 118 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
ATP6AP1Q15904 HMGN1P28-201ENST00000521340 364 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
ATP6AP1Q15904 AC068587.4-201ENST00000533893 186 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
ATP6AP1Q15904 RRAS2-210ENST00000534746 993 ntTSL 2 BASIC2.37□□□□□ -2.03
ATP6AP1Q15904 LINC02384-205ENST00000539404 785 ntTSL 3 BASIC2.37□□□□□ -2.03
ATP6AP1Q15904 MTND1P24-201ENST00000552175 861 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
ATP6AP1Q15904 AL133153.1-201ENST00000557756 303 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
ATP6AP1Q15904 LINC01584-203ENST00000567231 646 ntTSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
ATP6AP1Q15904 LINC01893-201ENST00000581750 479 ntTSL 3 BASIC2.37□□□□□ -2.03
ATP6AP1Q15904 AF038458.1-201ENST00000588406 262 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
ATP6AP1Q15904 SOX2-OT-224ENST00000595313 716 ntTSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
ATP6AP1Q15904 AC024220.1-201ENST00000603675 484 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
ATP6AP1Q15904 AC018714.1-201ENST00000605028 208 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
ATP6AP1Q15904 SDR42E1P2-201ENST00000614861 481 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
ATP6AP1Q15904 AL031667.3-201ENST00000620124 655 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
ATP6AP1Q15904 AC007490.1-201ENST00000624321 703 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
ATP6AP1Q15904 CACNB4-228ENST00000636598 7808 ntTSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
ATP6AP1Q15904 MINPP1-204ENST00000536010 2215 ntTSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
ATP6AP1Q15904 CCT4P2-201ENST00000233836 1548 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
ATP6AP1Q15904 AC010680.1-201ENST00000590024 3590 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
ATP6AP1Q15904 FGF7-201ENST00000267843 5467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
ATP6AP1Q15904 ANKRD36BP1-201ENST00000358576 1779 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
ATP6AP1Q15904 HELLS-201ENST00000239026 2740 ntTSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.5 ms