Protein–RNA interactions for Protein: Q149N8

SHPRH, E3 ubiquitin-protein ligase SHPRH, humanhuman

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Length 1,683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHPRHQ149N8 AC130469.1-201ENST00000597256 388 ntTSL 5 BASIC1.57□□□□□ -2.16
SHPRHQ149N8 AC123912.5-201ENST00000605470 343 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
SHPRHQ149N8 AC116563.2-201ENST00000624751 535 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
SHPRHQ149N8 AC068620.4-201ENST00000636730 1182 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
SHPRHQ149N8 C1orf141-203ENST00000371007 2153 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC1.57□□□□□ -2.16
SHPRHQ149N8 RNA5SP62-201ENST00000363457 110 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SHPRHQ149N8 AL355497.1-201ENST00000406262 551 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SHPRHQ149N8 AC096632.1-201ENST00000427395 310 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SHPRHQ149N8 FAR2P3-204ENST00000434661 444 ntTSL 2 BASIC1.56□□□□□ -2.16
SHPRHQ149N8 AL121601.2-201ENST00000438019 707 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SHPRHQ149N8 AL691517.1-201ENST00000440833 1235 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SHPRHQ149N8 AC010285.1-201ENST00000470580 392 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SHPRHQ149N8 ZBTB20-AS3-201ENST00000498630 464 ntTSL 3 BASIC1.56□□□□□ -2.16
SHPRHQ149N8 AC100807.1-201ENST00000517640 552 ntTSL 5 BASIC1.56□□□□□ -2.16
SHPRHQ149N8 AC092747.1-202ENST00000540595 380 ntTSL 5 BASIC1.56□□□□□ -2.16
SHPRHQ149N8 CYP3A137P-201ENST00000562436 69 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SHPRHQ149N8 ATG5-207ENST00000613993 733 ntTSL 1 (best) BASIC1.56□□□□□ -2.16
SHPRHQ149N8 AC111188.2-201ENST00000529697 1387 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SHPRHQ149N8 MIR513A1-201ENST00000385138 129 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SHPRHQ149N8 AL513343.1-201ENST00000451818 792 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SHPRHQ149N8 HMGB3P17-201ENST00000504195 649 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SHPRHQ149N8 CDC42P4-201ENST00000510507 563 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SHPRHQ149N8 AC093248.1-201ENST00000513197 417 ntTSL 2 BASIC1.55□□□□□ -2.16
SHPRHQ149N8 AP004247.1-201ENST00000531556 1289 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SHPRHQ149N8 AC233266.2-201ENST00000567067 528 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SHPRHQ149N8 AC090616.5-202ENST00000582111 297 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SHPRHQ149N8 NEAT1-205ENST00000616315 483 ntTSL 2 BASIC1.55□□□□□ -2.16
SHPRHQ149N8 AC097655.1-201ENST00000635075 318 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SHPRHQ149N8 PPP1R3A-201ENST00000284601 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.55□□□□□ -2.16
SHPRHQ149N8 ZMYM4-AS1-201ENST00000432683 459 ntTSL 2 BASIC1.55□□□□□ -2.16
SHPRHQ149N8 AP001043.2-201ENST00000434589 288 ntTSL 3 BASIC1.55□□□□□ -2.16
SHPRHQ149N8 AL138808.1-201ENST00000441428 371 ntTSL 2 BASIC1.55□□□□□ -2.16
SHPRHQ149N8 Y_RNA.681-201ENST00000516445 113 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SHPRHQ149N8 SNORA31.16-201ENST00000516773 139 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SHPRHQ149N8 RNU6-1073P-201ENST00000517182 106 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SHPRHQ149N8 SMILR-201ENST00000533992 553 ntTSL 4 BASIC1.55□□□□□ -2.16
SHPRHQ149N8 OSBPL9P3-201ENST00000534523 595 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SHPRHQ149N8 AC023824.4-201ENST00000562572 476 ntTSL 3 BASIC1.55□□□□□ -2.16
SHPRHQ149N8 AC105245.1-201ENST00000581934 244 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SHPRHQ149N8 AL050343.2-201ENST00000607338 280 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SHPRHQ149N8 TSHB-201ENST00000256592 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.54□□□□□ -2.16
SHPRHQ149N8 OR8B3-201ENST00000354597 942 ntAPPRIS P1 BASIC1.54□□□□□ -2.16
SHPRHQ149N8 RNU1-62P-201ENST00000362599 164 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SHPRHQ149N8 OR8B2-201ENST00000375013 942 ntAPPRIS P1 BASIC1.54□□□□□ -2.16
SHPRHQ149N8 RNU6-629P-201ENST00000384061 103 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SHPRHQ149N8 MIR193B-201ENST00000384907 83 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SHPRHQ149N8 LAMTOR3P1-201ENST00000428620 370 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SHPRHQ149N8 RPL30P12-201ENST00000474666 353 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SHPRHQ149N8 MTCO3P35-201ENST00000485582 781 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SHPRHQ149N8 RPL30P11-201ENST00000495304 339 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SHPRHQ149N8 AC022690.1-201ENST00000526681 550 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SHPRHQ149N8 MIR1273G-201ENST00000577677 100 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SHPRHQ149N8 AC211469.2-201ENST00000605461 205 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SHPRHQ149N8 AC021755.4-201ENST00000616620 456 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SHPRHQ149N8 MT-TP-201ENST00000387461 68 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
SHPRHQ149N8 TRAJ22-201ENST00000390515 63 ntAPPRIS P1 BASIC1.53□□□□□ -2.16
SHPRHQ149N8 TXNP7-201ENST00000406296 293 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
SHPRHQ149N8 TRAPPC2P4-201ENST00000421750 331 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
SHPRHQ149N8 RNA5SP233-201ENST00000459153 113 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
SHPRHQ149N8 OR9N1P-202ENST00000494289 481 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
SHPRHQ149N8 AC109927.1-202ENST00000511951 282 ntTSL 3 BASIC1.53□□□□□ -2.16
SHPRHQ149N8 VCAN-AS1-202ENST00000513899 453 ntTSL 3 BASIC1.53□□□□□ -2.16
SHPRHQ149N8 AC060765.1-201ENST00000522776 544 ntTSL 4 BASIC1.53□□□□□ -2.16
SHPRHQ149N8 AC066613.1-202ENST00000560727 630 ntTSL 5 BASIC1.53□□□□□ -2.16
SHPRHQ149N8 AC108706.1-201ENST00000611053 297 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
SHPRHQ149N8 uc_338.9-201ENST00000617424 182 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
SHPRHQ149N8 SNORA62.1-201ENST00000364287 154 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SHPRHQ149N8 RNA5SP38-201ENST00000410750 119 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SHPRHQ149N8 AC016687.2-201ENST00000504795 541 ntTSL 5 BASIC1.52□□□□□ -2.17
SHPRHQ149N8 AC108156.1-201ENST00000507849 481 ntTSL 3 BASIC1.52□□□□□ -2.17
SHPRHQ149N8 ZFAND1-217ENST00000521895 885 ntTSL 3 BASIC1.52□□□□□ -2.17
SHPRHQ149N8 AC008115.2-201ENST00000539988 241 ntTSL 3 BASIC1.52□□□□□ -2.17
SHPRHQ149N8 ZNF518A-210ENST00000624776 7994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.52□□□□□ -2.17
SHPRHQ149N8 SNX10-209ENST00000619420 2361 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC1.52□□□□□ -2.17
SHPRHQ149N8 MTND4P11-201ENST00000417020 1058 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SHPRHQ149N8 SDCBPP1-201ENST00000440192 890 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SHPRHQ149N8 MYCBP2-AS1-202ENST00000448470 333 ntTSL 3 BASIC1.51□□□□□ -2.17
SHPRHQ149N8 AL031183.1-201ENST00000457667 207 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SHPRHQ149N8 MTCYBP41-201ENST00000528913 1123 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SHPRHQ149N8 AC025918.2-201ENST00000558683 763 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SHPRHQ149N8 AC008739.2-201ENST00000597006 317 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SHPRHQ149N8 AC106791.2-201ENST00000604680 391 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SHPRHQ149N8 AC106028.5-201ENST00000610332 395 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SHPRHQ149N8 TLR6-205ENST00000610323 1443 ntTSL 5 BASIC1.51□□□□□ -2.17
SHPRHQ149N8 AC099654.7-201ENST00000635788 2127 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SHPRHQ149N8 AL139109.1-201ENST00000455491 297 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SHPRHQ149N8 IMMP1LP2-201ENST00000552954 492 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SHPRHQ149N8 SULT1C2P1-202ENST00000562418 459 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SHPRHQ149N8 AC245884.12-201ENST00000615364 59 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SHPRHQ149N8 PCF11-AS1-201ENST00000602322 1516 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SHPRHQ149N8 MIPOL1-203ENST00000537471 5954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.5□□□□□ -2.17
SHPRHQ149N8 Y_RNA.115-201ENST00000363272 98 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SHPRHQ149N8 U8.3-201ENST00000363321 132 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SHPRHQ149N8 RNU6-1181P-201ENST00000384191 106 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SHPRHQ149N8 AC233728.2-201ENST00000425348 757 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SHPRHQ149N8 RABEPKP1-201ENST00000440529 1026 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SHPRHQ149N8 AC234775.1-201ENST00000454247 670 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SHPRHQ149N8 AC005538.1-201ENST00000455991 594 ntTSL 3 BASIC1.5□□□□□ -2.17
SHPRHQ149N8 AC092989.1-201ENST00000481235 277 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SHPRHQ149N8 HSPE1P4-201ENST00000550617 308 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
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