Protein–RNA interactions for Protein: Q15911

ZFHX3, Zinc finger homeobox protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 3,703 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZFHX3Q15911 P2RY12-201ENST00000302632 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.3□□□□□ -2.2
ZFHX3Q15911 AL513185.2-201ENST00000425543 193 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
ZFHX3Q15911 AC016751.2-201ENST00000453206 280 ntTSL 5 BASIC1.3□□□□□ -2.2
ZFHX3Q15911 UMAD1-204ENST00000482067 569 ntTSL 5 BASIC1.3□□□□□ -2.2
ZFHX3Q15911 RPL23AP41-201ENST00000484754 458 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
ZFHX3Q15911 AC103957.1-201ENST00000517681 503 ntTSL 3 BASIC1.3□□□□□ -2.2
ZFHX3Q15911 MIR4419B-201ENST00000577260 68 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
ZFHX3Q15911 VN1R74P-201ENST00000613259 503 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
ZFHX3Q15911 GTPBP8-205ENST00000473129 1518 ntTSL 2 BASIC1.3□□□□□ -2.2
ZFHX3Q15911 RNA5SP331-201ENST00000364986 107 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
ZFHX3Q15911 Y_RNA.390-201ENST00000383932 102 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
ZFHX3Q15911 RPS15AP40-201ENST00000419621 391 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
ZFHX3Q15911 AC018630.2-202ENST00000422992 927 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
ZFHX3Q15911 AL445669.1-201ENST00000426743 755 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
ZFHX3Q15911 PCYT1B-AS1-201ENST00000432626 275 ntTSL 2 BASIC1.3□□□□□ -2.2
ZFHX3Q15911 AC090774.1-201ENST00000435925 246 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
ZFHX3Q15911 AL662889.1-201ENST00000453572 389 ntTSL 3 BASIC1.3□□□□□ -2.2
ZFHX3Q15911 ANKRD36B-207ENST00000497329 649 ntTSL 1 (best) BASIC1.3□□□□□ -2.2
ZFHX3Q15911 LINC02377-201ENST00000500169 450 ntTSL 3 BASIC1.3□□□□□ -2.2
ZFHX3Q15911 ARL2BPP4-201ENST00000506854 471 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
ZFHX3Q15911 AC034234.1-202ENST00000508696 339 ntTSL 3 BASIC1.3□□□□□ -2.2
ZFHX3Q15911 AC012613.1-201ENST00000522685 387 ntTSL 2 BASIC1.3□□□□□ -2.2
ZFHX3Q15911 AP002884.4-201ENST00000527589 594 ntTSL 3 BASIC1.3□□□□□ -2.2
ZFHX3Q15911 MTND2P26-201ENST00000528255 1029 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
ZFHX3Q15911 AP000873.2-205ENST00000529031 435 ntTSL 2 BASIC1.3□□□□□ -2.2
ZFHX3Q15911 AC130469.1-201ENST00000597256 388 ntTSL 5 BASIC1.3□□□□□ -2.2
ZFHX3Q15911 AC090525.3-201ENST00000605601 189 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
ZFHX3Q15911 AC112503.2-201ENST00000609005 552 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
ZFHX3Q15911 SPAM1-205ENST00000439500 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.29□□□□□ -2.2
ZFHX3Q15911 RNA5SP363-201ENST00000365072 115 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
ZFHX3Q15911 RNA5SP489-201ENST00000410986 109 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
ZFHX3Q15911 FNDC3CP-201ENST00000420795 1155 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
ZFHX3Q15911 AC092783.1-201ENST00000435832 231 ntTSL 3 BASIC1.29□□□□□ -2.2
ZFHX3Q15911 AC109486.1-201ENST00000486833 374 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
ZFHX3Q15911 AC025755.1-201ENST00000521306 278 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
ZFHX3Q15911 LINC01467-201ENST00000554211 1187 ntTSL 1 (best) BASIC1.29□□□□□ -2.2
ZFHX3Q15911 AL136298.1-202ENST00000556520 518 ntTSL 3 BASIC1.29□□□□□ -2.2
ZFHX3Q15911 AC005332.10-201ENST00000612725 619 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
ZFHX3Q15911 TDRD15-202ENST00000622654 5805 ntAPPRIS P1 BASIC1.29□□□□□ -2.2
ZFHX3Q15911 SNORA38-201ENST00000363946 132 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
ZFHX3Q15911 RNU6-629P-201ENST00000384061 103 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
ZFHX3Q15911 AL445183.3-201ENST00000414168 502 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
ZFHX3Q15911 RPL23AP35-201ENST00000451906 501 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
ZFHX3Q15911 AC010273.1-201ENST00000504129 946 ntTSL 5 BASIC1.29□□□□□ -2.2
ZFHX3Q15911 AC069228.1-202ENST00000550272 737 ntTSL 3 BASIC1.29□□□□□ -2.2
ZFHX3Q15911 AL031601.2-202ENST00000622650 282 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
ZFHX3Q15911 AC006963.1-201ENST00000624003 1052 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
ZFHX3Q15911 MIR338-201ENST00000636369 67 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
ZFHX3Q15911 AC009902.3-201ENST00000606235 2172 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
ZFHX3Q15911 ZNF37BP-203ENST00000452306 1352 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
ZFHX3Q15911 CENPK-201ENST00000242872 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.29□□□□□ -2.2
ZFHX3Q15911 RNU6-115P-201ENST00000364310 107 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
ZFHX3Q15911 NAP1L1P3-201ENST00000462291 880 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
ZFHX3Q15911 RPS29P20-201ENST00000489592 171 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
ZFHX3Q15911 AC022690.1-201ENST00000526681 550 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
ZFHX3Q15911 IFNG-AS1-201ENST00000536914 494 ntTSL 5 BASIC1.29□□□□□ -2.2
ZFHX3Q15911 HSPE1P3-201ENST00000559254 309 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
ZFHX3Q15911 KLRA1P-202ENST00000510134 1410 ntTSL 5 BASIC1.29□□□□□ -2.2
ZFHX3Q15911 AC103710.2-202ENST00000641454 2853 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
ZFHX3Q15911 RNU6-1251P-201ENST00000364502 107 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
ZFHX3Q15911 SNORD23.1-201ENST00000408212 104 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
ZFHX3Q15911 AC090096.1-201ENST00000489168 390 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
ZFHX3Q15911 HMGB1P46-201ENST00000520062 610 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
ZFHX3Q15911 AC084851.1-201ENST00000529105 249 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
ZFHX3Q15911 LINC02098-201ENST00000608492 475 ntTSL 3 BASIC1.28□□□□□ -2.2
ZFHX3Q15911 AC245884.12-201ENST00000615364 59 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
ZFHX3Q15911 ZNF260-203ENST00000588993 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.28□□□□□ -2.2
ZFHX3Q15911 BCL2A1-202ENST00000335661 809 ntTSL 1 (best) BASIC1.28□□□□□ -2.2
ZFHX3Q15911 MTND4P11-201ENST00000417020 1058 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
ZFHX3Q15911 AC010273.2-201ENST00000479830 438 ntTSL 5 BASIC1.28□□□□□ -2.2
ZFHX3Q15911 AC107032.1-201ENST00000485945 480 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
ZFHX3Q15911 PDCD10-214ENST00000487947 716 ntTSL 5 BASIC1.28□□□□□ -2.2
ZFHX3Q15911 AC105914.1-201ENST00000511798 226 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
ZFHX3Q15911 AP003128.1-201ENST00000531414 448 ntTSL 2 BASIC1.28□□□□□ -2.2
ZFHX3Q15911 PSMA4-205ENST00000558281 773 ntTSL 3 BASIC1.28□□□□□ -2.2
ZFHX3Q15911 LINC01919-202ENST00000579506 384 ntTSL 3 BASIC1.28□□□□□ -2.2
ZFHX3Q15911 AC098657.3-201ENST00000620434 263 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
ZFHX3Q15911 MIR222-201ENST00000384992 110 ntBASIC1.28□□□□□ -2.21
ZFHX3Q15911 CBX3P8-201ENST00000532412 525 ntBASIC1.28□□□□□ -2.21
ZFHX3Q15911 AC092451.2-201ENST00000538746 658 ntBASIC1.28□□□□□ -2.21
ZFHX3Q15911 AC010928.2-201ENST00000588017 287 ntBASIC1.28□□□□□ -2.21
ZFHX3Q15911 AC013444.2-201ENST00000603317 787 ntBASIC1.28□□□□□ -2.21
ZFHX3Q15911 BNIP3P4-201ENST00000604946 565 ntBASIC1.28□□□□□ -2.21
ZFHX3Q15911 RMST_6.1-201ENST00000611980 203 ntBASIC1.28□□□□□ -2.21
ZFHX3Q15911 AC020923.1-201ENST00000624021 917 ntBASIC1.28□□□□□ -2.21
ZFHX3Q15911 AL160287.1-202ENST00000638113 454 ntTSL 5 BASIC1.28□□□□□ -2.21
ZFHX3Q15911 AC025263.3-201ENST00000622965 1396 ntBASIC1.28□□□□□ -2.21
ZFHX3Q15911 RNU1-105P-201ENST00000363470 161 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
ZFHX3Q15911 LINC01673-201ENST00000426418 468 ntTSL 3 BASIC1.27□□□□□ -2.21
ZFHX3Q15911 Z77249.1-201ENST00000444622 1175 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
ZFHX3Q15911 AC022447.3-201ENST00000506865 495 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
ZFHX3Q15911 AC023824.2-201ENST00000566185 400 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
ZFHX3Q15911 TTN-AS1-212ENST00000582847 1036 ntTSL 5 BASIC1.27□□□□□ -2.21
ZFHX3Q15911 TLR6-205ENST00000610323 1443 ntTSL 5 BASIC1.27□□□□□ -2.21
ZFHX3Q15911 MLIP-AS1-201ENST00000434196 1534 ntTSL 2 BASIC1.27□□□□□ -2.21
ZFHX3Q15911 TRAJ22-201ENST00000390515 63 ntAPPRIS P1 BASIC1.27□□□□□ -2.21
ZFHX3Q15911 BCL2L15-203ENST00000393320 276 ntTSL 1 (best) BASIC1.27□□□□□ -2.21
ZFHX3Q15911 SNRPEP2-201ENST00000397592 279 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
ZFHX3Q15911 RN7SKP101-201ENST00000411376 320 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
ZFHX3Q15911 AC007179.1-201ENST00000415159 438 ntTSL 3 BASIC1.27□□□□□ -2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107.7 ms