Protein–RNA interactions for Protein: O43300

LRRTM2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, humanhuman

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Length 516 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM2O43300 AL359273.1-201ENST00000510918 627 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
LRRTM2O43300 AC010486.3-201ENST00000511602 785 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
LRRTM2O43300 AC008885.1-201ENST00000514930 301 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
LRRTM2O43300 AC109466.1-211ENST00000519327 496 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
LRRTM2O43300 MTERF3-203ENST00000522822 1148 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
LRRTM2O43300 DEFB108D-201ENST00000527787 222 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
LRRTM2O43300 AP004247.1-201ENST00000531556 1289 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
LRRTM2O43300 AC068587.4-201ENST00000533893 186 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
LRRTM2O43300 LINC02235-201ENST00000534675 466 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
LRRTM2O43300 AC022509.2-201ENST00000540392 699 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
LRRTM2O43300 AKIRIN1P1-201ENST00000547384 544 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
LRRTM2O43300 CR383656.7-201ENST00000548164 174 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
LRRTM2O43300 AL157955.1-201ENST00000554433 331 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
LRRTM2O43300 AC074052.2-201ENST00000562516 214 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
LRRTM2O43300 AC092718.6-202ENST00000563072 408 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
LRRTM2O43300 AC020978.4-201ENST00000569088 460 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
LRRTM2O43300 AC090615.1-201ENST00000577519 154 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
LRRTM2O43300 AC006116.8-203ENST00000587448 465 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
LRRTM2O43300 AC020895.1-201ENST00000595362 272 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
LRRTM2O43300 AC110760.3-201ENST00000598794 467 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
LRRTM2O43300 RPL23AP78-201ENST00000599928 470 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
LRRTM2O43300 uc_338.1-201ENST00000612113 180 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
LRRTM2O43300 Metazoa_SRP.117-201ENST00000615106 292 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
LRRTM2O43300 RDM1-219ENST00000615378 542 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
LRRTM2O43300 AC002550.2-201ENST00000621246 394 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
LRRTM2O43300 AC002064.3-201ENST00000623448 346 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
LRRTM2O43300 AC244517.5-202ENST00000623741 500 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
LRRTM2O43300 AF246928.1-201ENST00000623768 87 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
LRRTM2O43300 CU459211.1-201ENST00000635667 749 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
LRRTM2O43300 ASPN-201ENST00000375543 2237 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
LRRTM2O43300 ZNF479-202ENST00000331162 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
LRRTM2O43300 KIAA1107-202ENST00000636278 4065 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
LRRTM2O43300 RASA1-202ENST00000456692 3776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
LRRTM2O43300 AL161781.1-201ENST00000354277 403 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
LRRTM2O43300 RNU6-1207P-201ENST00000384343 107 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
LRRTM2O43300 SNORA46-201ENST00000384762 135 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
LRRTM2O43300 RNU6-1197P-201ENST00000391183 107 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
LRRTM2O43300 TANK-204ENST00000403609 555 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
LRRTM2O43300 TPMTP3-201ENST00000411928 735 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
LRRTM2O43300 AC245054.2-201ENST00000415639 319 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
LRRTM2O43300 Z99497.1-201ENST00000421282 135 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
LRRTM2O43300 AL136322.1-201ENST00000422250 548 ntTSL 4 BASIC2.88□□□□□ -1.95
LRRTM2O43300 AL513365.2-201ENST00000423060 529 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
LRRTM2O43300 AL357375.1-201ENST00000424274 525 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
LRRTM2O43300 AC022018.1-201ENST00000430685 241 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
LRRTM2O43300 AC024082.2-201ENST00000434771 238 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
LRRTM2O43300 ZNF385D-AS2-201ENST00000436306 424 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
LRRTM2O43300 MTATP6P26-201ENST00000445926 662 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
LRRTM2O43300 AL592447.1-201ENST00000447592 540 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
LRRTM2O43300 MYCBP2-AS1-202ENST00000448470 333 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
LRRTM2O43300 EPS15P1-201ENST00000448836 336 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
LRRTM2O43300 PLSCR5-AS1-201ENST00000473817 450 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
LRRTM2O43300 AC104563.1-201ENST00000476147 376 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
LRRTM2O43300 RPF2P2-201ENST00000504693 896 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
LRRTM2O43300 AC099499.1-201ENST00000505040 558 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
LRRTM2O43300 LINC01846-201ENST00000505908 651 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
LRRTM2O43300 CTD-2350J17.1-202ENST00000510456 360 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
LRRTM2O43300 AC092436.2-201ENST00000515188 411 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
LRRTM2O43300 AC009812.2-201ENST00000517657 457 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
LRRTM2O43300 IL18-204ENST00000528832 795 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
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LRRTM2O43300 AL132819.1-201ENST00000555595 208 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
LRRTM2O43300 LINC02562-201ENST00000561705 785 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
LRRTM2O43300 AC215217.1-201ENST00000562162 347 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
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LRRTM2O43300 DUXAP11-201ENST00000603858 526 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
LRRTM2O43300 AL022161.1-201ENST00000604390 213 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
LRRTM2O43300 NCRUPAR_2.1-201ENST00000616308 99 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
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LRRTM2O43300 AL356266.1-201ENST00000623311 483 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
LRRTM2O43300 MIR3974-201ENST00000637126 96 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
LRRTM2O43300 AP003481.1-201ENST00000637808 351 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
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LRRTM2O43300 ZNF85-203ENST00000345030 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
LRRTM2O43300 AGTR1-208ENST00000475347 1669 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
LRRTM2O43300 AC138915.1-201ENST00000565427 1685 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
LRRTM2O43300 NEBL-202ENST00000377122 9216 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
LRRTM2O43300 TDRD15-201ENST00000405799 6135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
LRRTM2O43300 PRKACB-201ENST00000370680 1914 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
LRRTM2O43300 MGAT4C-211ENST00000621808 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
LRRTM2O43300 CFHR4-201ENST00000251424 1292 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
LRRTM2O43300 FTLP6-201ENST00000355274 422 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
LRRTM2O43300 SNORD21-201ENST00000383953 95 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
LRRTM2O43300 Y_RNA.560-201ENST00000384689 102 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
LRRTM2O43300 ERMN-204ENST00000409925 556 ntTSL 4 BASIC2.87□□□□□ -1.95
LRRTM2O43300 MTCO1P17-201ENST00000411522 491 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
LRRTM2O43300 AC090960.1-201ENST00000421072 306 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
LRRTM2O43300 AC092573.2-201ENST00000434546 243 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
LRRTM2O43300 MTCYBP39-201ENST00000437562 491 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
LRRTM2O43300 ATP5C1P1-201ENST00000441945 895 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
LRRTM2O43300 GDI2P2-201ENST00000445131 608 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
LRRTM2O43300 UBBP3-201ENST00000445497 241 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
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