Protein–RNA interactions for Protein: Q96LT4

SAMD8, Sphingomyelin synthase-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD8Q96LT4 AC018495.1-201ENST00000440266 452 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
SAMD8Q96LT4 AL356475.1-201ENST00000440321 341 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
SAMD8Q96LT4 LINC01986-201ENST00000440867 590 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
SAMD8Q96LT4 AP000146.1-202ENST00000441666 441 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
SAMD8Q96LT4 AC104978.1-201ENST00000449387 391 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SAMD8Q96LT4 RPL12P25-201ENST00000455592 494 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SAMD8Q96LT4 OR6K1P-201ENST00000456766 971 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SAMD8Q96LT4 RPL21P41-201ENST00000459863 264 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SAMD8Q96LT4 RN7SL863P-201ENST00000462370 296 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SAMD8Q96LT4 AC010631.1-201ENST00000474150 156 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SAMD8Q96LT4 AP004217.1-201ENST00000480579 346 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SAMD8Q96LT4 AC093752.1-212ENST00000500559 453 ntTSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
SAMD8Q96LT4 AC091951.3-201ENST00000504093 246 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SAMD8Q96LT4 TPT1P8-201ENST00000510120 555 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SAMD8Q96LT4 AP002004.1-207ENST00000531371 526 ntTSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
SAMD8Q96LT4 AP000756.1-201ENST00000532606 679 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
SAMD8Q96LT4 AC007115.1-201ENST00000546853 234 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SAMD8Q96LT4 AC123904.3-201ENST00000547218 814 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SAMD8Q96LT4 MIR5680-201ENST00000577577 84 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SAMD8Q96LT4 AL683887.1-201ENST00000603401 287 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
SAMD8Q96LT4 AC024560.3-201ENST00000608482 349 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SAMD8Q96LT4 AC138932.5-201ENST00000617759 563 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SAMD8Q96LT4 AC091965.5-201ENST00000624785 342 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SAMD8Q96LT4 PTP4A2-219ENST00000626355 606 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
SAMD8Q96LT4 PRKAA2-201ENST00000371244 9347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
SAMD8Q96LT4 AC073346.2-201ENST00000624724 2058 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SAMD8Q96LT4 MTND5P29-201ENST00000458676 1807 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SAMD8Q96LT4 LIPI-203ENST00000536861 1529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
SAMD8Q96LT4 PRKACB-219ENST00000614872 4306 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
SAMD8Q96LT4 MIR208A-201ENST00000362287 71 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SAMD8Q96LT4 DEFB119-202ENST00000376315 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
SAMD8Q96LT4 RNU6-278P-201ENST00000390945 109 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SAMD8Q96LT4 AL122016.1-201ENST00000403365 367 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SAMD8Q96LT4 AC007271.1-201ENST00000428188 382 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
SAMD8Q96LT4 RPS15AP5-201ENST00000436276 388 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SAMD8Q96LT4 SNRPEP9-201ENST00000436794 238 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SAMD8Q96LT4 AL513043.1-201ENST00000439124 535 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SAMD8Q96LT4 Z75741.1-201ENST00000446793 314 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SAMD8Q96LT4 AC016696.1-201ENST00000446949 318 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SAMD8Q96LT4 HTR2A-AS1-202ENST00000452352 384 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
SAMD8Q96LT4 LINC01036-201ENST00000458683 858 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
SAMD8Q96LT4 GTF2IP9-201ENST00000502460 301 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SAMD8Q96LT4 SUB1-211ENST00000512913 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
SAMD8Q96LT4 VTRNA2-2P-201ENST00000516091 103 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SAMD8Q96LT4 RN7SKP40-201ENST00000517211 242 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SAMD8Q96LT4 MS4A4E-206ENST00000528394 555 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
SAMD8Q96LT4 GLYCAM1-201ENST00000546596 285 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SAMD8Q96LT4 AC008083.1-201ENST00000547748 663 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
SAMD8Q96LT4 MIR544B-201ENST00000582372 78 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SAMD8Q96LT4 UBL5P2-201ENST00000583788 219 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SAMD8Q96LT4 AC016866.2-201ENST00000585251 502 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
SAMD8Q96LT4 AC011471.1-201ENST00000585766 187 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SAMD8Q96LT4 AC009271.1-202ENST00000588803 492 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
SAMD8Q96LT4 BNIP3P39-201ENST00000601077 554 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SAMD8Q96LT4 MTND4LP5-201ENST00000605152 292 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SAMD8Q96LT4 C9orf153-205ENST00000617985 333 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
SAMD8Q96LT4 AC007318.2-201ENST00000620999 243 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SAMD8Q96LT4 AC099506.2-201ENST00000623074 221 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SAMD8Q96LT4 LRRC77P-213ENST00000637727 880 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SAMD8Q96LT4 AC108206.1-201ENST00000570186 4159 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SAMD8Q96LT4 TLR6-205ENST00000610323 1443 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
SAMD8Q96LT4 AL359693.1-201ENST00000614959 2407 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SAMD8Q96LT4 FPGT-TNNI3K-202ENST00000370895 7566 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
SAMD8Q96LT4 MIR133A1HG-202ENST00000581072 4226 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
SAMD8Q96LT4 PSG1-205ENST00000595124 1692 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
SAMD8Q96LT4 RNY4P24-201ENST00000362735 96 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SAMD8Q96LT4 RNU6-433P-201ENST00000363216 104 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SAMD8Q96LT4 SNORA7.4-201ENST00000384249 137 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SAMD8Q96LT4 RNU6-769P-201ENST00000384407 104 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SAMD8Q96LT4 AP003170.3-201ENST00000399123 158 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
SAMD8Q96LT4 HIST1H2APS3-201ENST00000403259 134 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SAMD8Q96LT4 RPL7P25-201ENST00000404151 721 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SAMD8Q96LT4 BMS1P22-201ENST00000414726 313 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SAMD8Q96LT4 BX682237.1-201ENST00000415016 335 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SAMD8Q96LT4 BTF3L4P3-201ENST00000418879 476 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SAMD8Q96LT4 AL445669.1-201ENST00000426743 755 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SAMD8Q96LT4 LINC01674-201ENST00000427446 504 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
SAMD8Q96LT4 HMGB1P9-201ENST00000429856 646 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SAMD8Q96LT4 AC092427.1-202ENST00000430569 476 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SAMD8Q96LT4 AL138830.1-201ENST00000435802 402 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
SAMD8Q96LT4 Z80107.1-201ENST00000436830 412 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SAMD8Q96LT4 YWHAZP7-201ENST00000436906 631 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SAMD8Q96LT4 AC004691.1-201ENST00000440376 547 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
SAMD8Q96LT4 AC005094.1-201ENST00000440420 368 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SAMD8Q96LT4 AL592182.1-201ENST00000440897 250 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
SAMD8Q96LT4 AC108059.3-201ENST00000456388 214 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SAMD8Q96LT4 snoU13.22-201ENST00000459428 104 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SAMD8Q96LT4 MCCC1-AS1-201ENST00000471731 765 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
SAMD8Q96LT4 AC109925.1-201ENST00000478069 331 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SAMD8Q96LT4 RPL23AP70-201ENST00000483361 460 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SAMD8Q96LT4 AP000907.2-201ENST00000530827 353 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SAMD8Q96LT4 AC013828.2-201ENST00000532487 235 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SAMD8Q96LT4 IFNG-AS1-201ENST00000536914 494 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
SAMD8Q96LT4 AC023050.2-201ENST00000544968 387 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SAMD8Q96LT4 AL359212.1-201ENST00000556608 614 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SAMD8Q96LT4 AC106796.1-201ENST00000577173 615 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
SAMD8Q96LT4 MIR5195-201ENST00000583555 115 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SAMD8Q96LT4 AC245884.10-201ENST00000597355 337 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SAMD8Q96LT4 AL450336.1-201ENST00000605180 586 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SAMD8Q96LT4 OR5H6-201ENST00000615035 1113 ntAPPRIS P1 BASIC2.74□□□□□ -1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 115.3 ms