Protein–RNA interactions for Protein: Q13485

SMAD4, Mothers against decapentaplegic homolog 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD4Q13485 AC010745.2-201ENST00000420404 839 ntTSL 3 BASIC4.52□□□□□ -1.69
SMAD4Q13485 AC091493.1-201ENST00000426218 411 ntTSL 3 BASIC4.52□□□□□ -1.69
SMAD4Q13485 AL080248.1-201ENST00000428954 388 ntTSL 3 BASIC4.52□□□□□ -1.69
SMAD4Q13485 TXNP1-201ENST00000441872 371 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
SMAD4Q13485 AL035666.1-201ENST00000446195 348 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
SMAD4Q13485 AL390730.1-201ENST00000457106 692 ntTSL 2 BASIC4.52□□□□□ -1.69
SMAD4Q13485 AC068633.1-201ENST00000482142 787 ntTSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
SMAD4Q13485 AC079140.5-201ENST00000507882 310 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
SMAD4Q13485 SNHG1-208ENST00000538266 347 ntTSL 3 BASIC4.52□□□□□ -1.69
SMAD4Q13485 AC007619.1-201ENST00000544086 412 ntTSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
SMAD4Q13485 AC096558.2-201ENST00000546678 506 ntTSL 3 BASIC4.52□□□□□ -1.69
SMAD4Q13485 AC079598.1-201ENST00000548691 554 ntTSL 4 BASIC4.52□□□□□ -1.69
SMAD4Q13485 OR11H5P-201ENST00000554039 926 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
SMAD4Q13485 LINC00644-201ENST00000555156 295 ntTSL 2 BASIC4.52□□□□□ -1.69
SMAD4Q13485 AL133153.1-201ENST00000557756 303 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
SMAD4Q13485 AC012100.2-201ENST00000558317 304 ntTSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
SMAD4Q13485 AC067852.4-201ENST00000590314 478 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
SMAD4Q13485 AL606490.9-201ENST00000603331 271 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
SMAD4Q13485 AL356056.1-205ENST00000608904 651 ntTSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
SMAD4Q13485 AL357559.1-201ENST00000622228 274 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
SMAD4Q13485 AC022418.1-201ENST00000624118 445 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
SMAD4Q13485 OR10Z1-202ENST00000641002 6323 ntAPPRIS P1 BASIC4.52□□□□□ -1.69
SMAD4Q13485 BMPR2-201ENST00000374574 9683 ntTSL 2 BASIC4.52□□□□□ -1.69
SMAD4Q13485 LINC01505-206ENST00000637046 4266 ntTSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
SMAD4Q13485 OR1A1-202ENST00000641322 3743 ntAPPRIS P1 BASIC4.52□□□□□ -1.69
SMAD4Q13485 KCNJ1-202ENST00000324036 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
SMAD4Q13485 AC139769.1-204ENST00000472297 1931 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
SMAD4Q13485 ZNF207-203ENST00000394670 13781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
SMAD4Q13485 DCX-202ENST00000358070 9405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
SMAD4Q13485 RIMS1-204ENST00000401910 3542 ntTSL 2 BASIC4.51□□□□□ -1.69
SMAD4Q13485 KRTAP24-1-201ENST00000340345 1650 ntAPPRIS P1 BASIC4.51□□□□□ -1.69
SMAD4Q13485 AL445623.2-201ENST00000640307 4805 ntTSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
SMAD4Q13485 NR5A2-201ENST00000236914 3115 ntTSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
SMAD4Q13485 CRISP1-202ENST00000335847 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
SMAD4Q13485 Y_RNA.135-201ENST00000363439 95 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
SMAD4Q13485 RNU6-61P-201ENST00000365528 109 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
SMAD4Q13485 RNU6-1032P-201ENST00000384100 107 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
SMAD4Q13485 RNU6-505P-201ENST00000384427 107 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
SMAD4Q13485 TRAJ32-201ENST00000390505 66 ntAPPRIS P1 BASIC4.51□□□□□ -1.69
SMAD4Q13485 RNU6-278P-201ENST00000390945 109 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
SMAD4Q13485 CISD1P1-201ENST00000393907 327 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
SMAD4Q13485 AC097374.1-203ENST00000400783 485 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
SMAD4Q13485 AL136372.1-201ENST00000403060 228 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
SMAD4Q13485 RNU2-36P-201ENST00000410361 191 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
SMAD4Q13485 POLHP1-201ENST00000411806 470 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
SMAD4Q13485 RPL31P2-201ENST00000413849 377 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
SMAD4Q13485 AC133106.1-201ENST00000419029 397 ntTSL 3 BASIC4.51□□□□□ -1.69
SMAD4Q13485 AL139396.1-201ENST00000421137 167 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
SMAD4Q13485 AC026355.1-201ENST00000423466 587 ntTSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
SMAD4Q13485 AC004837.2-201ENST00000435766 731 ntTSL 3 BASIC4.51□□□□□ -1.69
SMAD4Q13485 AC084149.1-201ENST00000437233 284 ntTSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
SMAD4Q13485 AC005538.1-201ENST00000455991 594 ntTSL 3 BASIC4.51□□□□□ -1.69
SMAD4Q13485 AC009468.2-201ENST00000457372 366 ntTSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
SMAD4Q13485 AC010468.2-201ENST00000511981 438 ntTSL 2 BASIC4.51□□□□□ -1.69
SMAD4Q13485 AC104393.1-201ENST00000517495 255 ntTSL 3 BASIC4.51□□□□□ -1.69
SMAD4Q13485 AP005357.1-201ENST00000520749 476 ntTSL 3 BASIC4.51□□□□□ -1.69
SMAD4Q13485 AC024909.1-201ENST00000549278 599 ntTSL 4 BASIC4.51□□□□□ -1.69
SMAD4Q13485 AC128707.1-201ENST00000552230 494 ntTSL 3 BASIC4.51□□□□□ -1.69
SMAD4Q13485 LINC01269-201ENST00000553682 602 ntTSL 4 BASIC4.51□□□□□ -1.69
SMAD4Q13485 AC084882.1-201ENST00000561254 555 ntTSL 4 BASIC4.51□□□□□ -1.69
SMAD4Q13485 RPL26-207ENST00000583011 524 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.51□□□□□ -1.69
SMAD4Q13485 RN7SL435P-201ENST00000584418 282 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
SMAD4Q13485 AC090409.2-202ENST00000585706 604 ntTSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
SMAD4Q13485 EAF1-AS1-207ENST00000599742 772 ntTSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
SMAD4Q13485 AC080078.1-201ENST00000603643 410 ntTSL 3 BASIC4.51□□□□□ -1.69
SMAD4Q13485 AL355598.1-201ENST00000604169 202 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
SMAD4Q13485 AL442067.1-201ENST00000613261 223 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
SMAD4Q13485 AL157817.1-201ENST00000614264 790 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
SMAD4Q13485 C2orf91-203ENST00000615044 393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
SMAD4Q13485 AL590099.1-201ENST00000615276 138 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
SMAD4Q13485 AL445363.3-201ENST00000623080 671 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
SMAD4Q13485 AC119674.1-207ENST00000641355 633 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
SMAD4Q13485 SLC5A12-202ENST00000396005 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
SMAD4Q13485 CEP97-201ENST00000341893 8361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
SMAD4Q13485 PAPPA-AS1-201ENST00000445861 2450 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
SMAD4Q13485 TMEM71-210ENST00000523829 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
SMAD4Q13485 FAM46D-202ENST00000538312 3106 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.5□□□□□ -1.69
SMAD4Q13485 C3orf67-AS1-202ENST00000482372 2203 ntTSL 2 BASIC4.5□□□□□ -1.69
SMAD4Q13485 SEC31A-237ENST00000513858 3687 ntTSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
SMAD4Q13485 EPHA7-202ENST00000369303 6588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
SMAD4Q13485 SLC17A1-204ENST00000476801 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.5□□□□□ -1.69
SMAD4Q13485 AC104623.2-202ENST00000623477 4002 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
SMAD4Q13485 PUS7L-201ENST00000344862 13593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
SMAD4Q13485 ISPD-AS1-202ENST00000438573 2252 ntTSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
SMAD4Q13485 OR10A7-201ENST00000326258 951 ntAPPRIS P1 BASIC4.5□□□□□ -1.69
SMAD4Q13485 RNU6-1252P-201ENST00000363054 104 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
SMAD4Q13485 RNA5SP175-201ENST00000364275 119 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
SMAD4Q13485 SNORA9-201ENST00000384215 133 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
SMAD4Q13485 RNU6-784P-201ENST00000384330 106 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
SMAD4Q13485 EIF4E2P1-201ENST00000393781 255 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
SMAD4Q13485 NT5C3A-205ENST00000409467 1032 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
SMAD4Q13485 AC093578.1-201ENST00000415219 368 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
SMAD4Q13485 MCFD2P1-201ENST00000417812 300 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
SMAD4Q13485 EIF4HP2-201ENST00000424380 563 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
SMAD4Q13485 AL138759.1-201ENST00000432120 645 ntTSL 2 BASIC4.5□□□□□ -1.69
SMAD4Q13485 RPS6P12-201ENST00000432491 726 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
SMAD4Q13485 AC005019.1-201ENST00000436455 431 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
SMAD4Q13485 BTF3P15-201ENST00000455606 336 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
SMAD4Q13485 RPL30P15-201ENST00000457129 321 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
SMAD4Q13485 LINC01753-201ENST00000458145 631 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104.1 ms