Protein–RNA interactions for Protein: Q12996

CSTF3, Cleavage stimulation factor subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 717 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSTF3Q12996 AL512271.1-201ENST00000439878 434 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
CSTF3Q12996 LINC01510-201ENST00000441991 468 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
CSTF3Q12996 MTATP6P30-201ENST00000443540 664 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CSTF3Q12996 AL357552.1-201ENST00000445254 415 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CSTF3Q12996 AC020550.1-201ENST00000447385 163 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CSTF3Q12996 GRM7-AS3-209ENST00000458713 454 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
CSTF3Q12996 SNORD105B-201ENST00000458770 79 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CSTF3Q12996 SNORD97-201ENST00000459187 142 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CSTF3Q12996 ANKRD7-204ENST00000477532 744 ntTSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
CSTF3Q12996 AC010273.2-201ENST00000479830 438 ntTSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
CSTF3Q12996 RPS4XP22-201ENST00000480755 780 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CSTF3Q12996 AC008957.1-201ENST00000510740 478 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
CSTF3Q12996 RNU4ATAC15P-201ENST00000516415 126 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CSTF3Q12996 AC090985.1-201ENST00000554440 480 ntTSL 2 BASIC3.39□□□□□ -1.87
CSTF3Q12996 AL445074.1-201ENST00000555362 318 ntTSL 2 BASIC3.39□□□□□ -1.87
CSTF3Q12996 AL160191.1-201ENST00000555480 566 ntTSL 4 BASIC3.39□□□□□ -1.87
CSTF3Q12996 EGLN3-AS1-201ENST00000555922 308 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
CSTF3Q12996 AC099793.1-201ENST00000567538 285 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
CSTF3Q12996 MIR3913-1-201ENST00000577744 102 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CSTF3Q12996 DPPA3P3-201ENST00000603842 430 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CSTF3Q12996 AL356130.2-201ENST00000612554 404 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
CSTF3Q12996 AC011939.3-201ENST00000613686 466 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CSTF3Q12996 PHF3-202ENST00000393387 6947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
CSTF3Q12996 SUGT1-201ENST00000310528 14131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
CSTF3Q12996 MME-211ENST00000492661 2854 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.39□□□□□ -1.87
CSTF3Q12996 SYTL2-203ENST00000359152 4123 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
CSTF3Q12996 FAM35A-202ENST00000298786 3614 ntTSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
CSTF3Q12996 EYS-204ENST00000370621 10485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
CSTF3Q12996 GPRC6A-202ENST00000368549 2622 ntTSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
CSTF3Q12996 ABCA5-208ENST00000588877 6525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
CSTF3Q12996 OR52E2-201ENST00000321522 978 ntAPPRIS P1 BASIC3.38□□□□□ -1.87
CSTF3Q12996 SNORD9-201ENST00000362566 104 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
CSTF3Q12996 RNA5SP51-201ENST00000364750 119 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
CSTF3Q12996 RNU6-1119P-201ENST00000384349 108 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
CSTF3Q12996 AL663109.1-201ENST00000411498 844 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
CSTF3Q12996 RAC1P6-201ENST00000423911 575 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
CSTF3Q12996 AC090952.1-201ENST00000424242 446 ntTSL 3 BASIC3.38□□□□□ -1.87
CSTF3Q12996 USP9YP36-201ENST00000424581 829 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
CSTF3Q12996 AL033504.1-201ENST00000427015 773 ntTSL 2 BASIC3.38□□□□□ -1.87
CSTF3Q12996 AC090617.2-201ENST00000433167 404 ntTSL 3 BASIC3.38□□□□□ -1.87
CSTF3Q12996 SNRPEP4-201ENST00000435815 279 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
CSTF3Q12996 LINC00302-201ENST00000444515 302 ntTSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
CSTF3Q12996 CBWD4P-201ENST00000445695 655 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
CSTF3Q12996 AL136380.1-201ENST00000447970 162 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
CSTF3Q12996 RGS5-217ENST00000451759 835 ntTSL 3 BASIC3.38□□□□□ -1.87
CSTF3Q12996 AL672167.3-201ENST00000465951 960 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
CSTF3Q12996 RPL7P5-201ENST00000471472 736 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
CSTF3Q12996 AC092185.1-201ENST00000491371 97 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
CSTF3Q12996 RPL30P5-201ENST00000494923 336 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
CSTF3Q12996 RN7SKP298-201ENST00000515950 94 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
CSTF3Q12996 SNORA70.19-201ENST00000516717 90 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
CSTF3Q12996 AC009803.1-201ENST00000551531 416 ntTSL 3 BASIC3.38□□□□□ -1.87
CSTF3Q12996 SLC12A1-210ENST00000561031 735 ntTSL 2 BASIC3.38□□□□□ -1.87
CSTF3Q12996 AL139286.2-201ENST00000606838 396 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
CSTF3Q12996 AL445584.2-201ENST00000614030 616 ntTSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
CSTF3Q12996 TFG-209ENST00000615993 1244 ntTSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
CSTF3Q12996 AC068831.7-201ENST00000616954 363 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
CSTF3Q12996 GABRG2-215ENST00000639213 9960 ntTSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
CSTF3Q12996 TIMM9-202ENST00000395159 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
CSTF3Q12996 PPP1R12A-204ENST00000546369 2977 ntTSL 2 BASIC3.38□□□□□ -1.87
CSTF3Q12996 AC007823.1-201ENST00000569932 1566 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
CSTF3Q12996 HNRNPC-203ENST00000430246 4501 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
CSTF3Q12996 C12orf4-201ENST00000261250 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
CSTF3Q12996 TRIQK-214ENST00000521988 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
CSTF3Q12996 ZNF682-207ENST00000595736 1710 ntTSL 2 BASIC3.37□□□□□ -1.87
CSTF3Q12996 SNORD56.2-201ENST00000363242 71 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
CSTF3Q12996 Y_RNA.194-201ENST00000363985 102 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
CSTF3Q12996 TCEAL7-202ENST00000372666 852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.37□□□□□ -1.87
CSTF3Q12996 RPS4XP3-201ENST00000398541 413 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
CSTF3Q12996 AC097717.1-228ENST00000417006 754 ntTSL 3 BASIC3.37□□□□□ -1.87
CSTF3Q12996 BX295541.1-201ENST00000417774 250 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
CSTF3Q12996 MORF4L1P6-201ENST00000418771 268 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
CSTF3Q12996 LINC01780-201ENST00000420059 442 ntTSL 2 BASIC3.37□□□□□ -1.87
CSTF3Q12996 AL589765.2-201ENST00000420382 424 ntTSL 3 BASIC3.37□□□□□ -1.87
CSTF3Q12996 AC093843.1-201ENST00000424395 512 ntTSL 2 BASIC3.37□□□□□ -1.87
CSTF3Q12996 AC091390.3-201ENST00000426478 338 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
CSTF3Q12996 DPPA2P1-201ENST00000428060 556 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
CSTF3Q12996 RPL31P35-201ENST00000431058 377 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
CSTF3Q12996 AL445584.1-201ENST00000431451 330 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
CSTF3Q12996 VN1R108P-201ENST00000431580 830 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
CSTF3Q12996 AL360169.1-201ENST00000435116 143 ntTSL 5 BASIC3.37□□□□□ -1.87
CSTF3Q12996 AC096558.1-202ENST00000442794 561 ntTSL 4 BASIC3.37□□□□□ -1.87
CSTF3Q12996 NOTCH2P1-201ENST00000443481 624 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
CSTF3Q12996 AC018643.1-201ENST00000445459 414 ntTSL 5 BASIC3.37□□□□□ -1.87
CSTF3Q12996 ITGA9-AS1-208ENST00000449586 726 ntTSL 3 BASIC3.37□□□□□ -1.87
CSTF3Q12996 SNRPGP6-201ENST00000451124 220 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
CSTF3Q12996 AC023794.1-201ENST00000504210 403 ntTSL 2 BASIC3.37□□□□□ -1.87
CSTF3Q12996 MTCO3P7-201ENST00000510008 774 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
CSTF3Q12996 AC025475.1-201ENST00000512939 487 ntTSL 3 BASIC3.37□□□□□ -1.87
CSTF3Q12996 LINC02374-202ENST00000515222 578 ntTSL 4 BASIC3.37□□□□□ -1.87
CSTF3Q12996 AC110296.1-201ENST00000515680 341 ntTSL 3 BASIC3.37□□□□□ -1.87
CSTF3Q12996 RNU7-51P-201ENST00000516560 62 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
CSTF3Q12996 AC022616.3-201ENST00000523940 148 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
CSTF3Q12996 NDUFB1-204ENST00000555441 458 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.37□□□□□ -1.87
CSTF3Q12996 AC069061.2-202ENST00000580280 357 ntTSL 3 BASIC3.37□□□□□ -1.87
CSTF3Q12996 AC090371.2-202ENST00000582239 644 ntTSL 5 BASIC3.37□□□□□ -1.87
CSTF3Q12996 AC245014.2-201ENST00000603689 287 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
CSTF3Q12996 AL670379.6-201ENST00000603753 252 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
CSTF3Q12996 AL670379.11-201ENST00000604059 253 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
CSTF3Q12996 AC008162.1-201ENST00000604718 254 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
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