Protein–RNA interactions for Protein: Q14993

COL19A1, Collagen alpha-1(XIX) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,142 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL19A1Q14993 UBE2L2-201ENST00000254302 429 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
COL19A1Q14993 RNU6-593P-201ENST00000364716 112 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
COL19A1Q14993 Y_RNA.350-201ENST00000365409 98 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
COL19A1Q14993 SNORA75B-201ENST00000384053 137 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
COL19A1Q14993 RNU6-45P-201ENST00000384471 107 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
COL19A1Q14993 RNU6-601P-201ENST00000384540 107 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
COL19A1Q14993 RNA5SP397-201ENST00000391323 118 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
COL19A1Q14993 RPL21P90-201ENST00000415692 466 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
COL19A1Q14993 TOMM22P1-201ENST00000418578 312 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
COL19A1Q14993 U51244.1-201ENST00000423120 374 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
COL19A1Q14993 NDUFB4P8-201ENST00000435351 367 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
COL19A1Q14993 RPS5P7-201ENST00000456664 608 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
COL19A1Q14993 HMGB3P30-201ENST00000457863 606 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
COL19A1Q14993 snoU13.24-201ENST00000458998 104 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
COL19A1Q14993 MED28P2-201ENST00000475771 317 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
COL19A1Q14993 AC092059.1-201ENST00000485347 429 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
COL19A1Q14993 GZMAP1-201ENST00000503054 631 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
COL19A1Q14993 AC104304.1-201ENST00000505797 291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
COL19A1Q14993 AC121154.1-201ENST00000507299 430 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
COL19A1Q14993 AL359273.1-201ENST00000510918 627 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
COL19A1Q14993 Y_RNA.661-201ENST00000516003 99 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
COL19A1Q14993 SNORA14.1-201ENST00000516113 141 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
COL19A1Q14993 RNU6-1332P-201ENST00000516666 104 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
COL19A1Q14993 RNU6-914P-201ENST00000516749 109 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
COL19A1Q14993 RNU6-1073P-201ENST00000517182 106 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
COL19A1Q14993 THEM7P-202ENST00000525689 764 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
COL19A1Q14993 AC023442.3-203ENST00000530946 533 ntTSL 4 BASIC5.21□□□□□ -1.58
COL19A1Q14993 AC055720.1-201ENST00000539552 475 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
COL19A1Q14993 AC093227.2-201ENST00000589357 285 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
COL19A1Q14993 AC104695.3-201ENST00000604052 296 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
COL19A1Q14993 SNORD91B-202ENST00000608459 222 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
COL19A1Q14993 AC243585.1-201ENST00000617867 607 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
COL19A1Q14993 AL360181.4-201ENST00000621752 134 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
COL19A1Q14993 AL158163.1-201ENST00000603915 1649 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
COL19A1Q14993 OR56B2P-202ENST00000641377 2453 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
COL19A1Q14993 FNIP1-201ENST00000307954 6366 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
COL19A1Q14993 ZNF83-202ENST00000536937 2726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
COL19A1Q14993 AKAP6-212ENST00000557272 4601 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
COL19A1Q14993 ST8SIA4-201ENST00000231461 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
COL19A1Q14993 MAPK10-263ENST00000641052 4307 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
COL19A1Q14993 TCF7L2-217ENST00000536810 3953 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
COL19A1Q14993 AL137141.1-201ENST00000624622 4836 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
COL19A1Q14993 MMRN1-204ENST00000508372 3234 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
COL19A1Q14993 SLC1A2-203ENST00000395753 11689 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
COL19A1Q14993 DAZ4-205ENST00000440066 1891 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
COL19A1Q14993 AC005592.1-201ENST00000566527 1640 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
COL19A1Q14993 RABGAP1L-208ENST00000392064 6282 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
COL19A1Q14993 EEF1A1-210ENST00000610520 3447 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
COL19A1Q14993 TRBV21OR9-2-201ENST00000331828 367 ntAPPRIS P1 BASIC5.2□□□□□ -1.58
COL19A1Q14993 AL590240.1-201ENST00000334118 313 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
COL19A1Q14993 RNU6-266P-201ENST00000364225 107 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
COL19A1Q14993 Y_RNA.389-201ENST00000383924 113 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
COL19A1Q14993 Y_RNA.399-201ENST00000383955 105 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
COL19A1Q14993 MIR514A1-201ENST00000385133 98 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
COL19A1Q14993 MIR708-201ENST00000390708 88 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
COL19A1Q14993 Y_RNA.645-201ENST00000391229 102 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
COL19A1Q14993 Y_RNA.646-201ENST00000410980 101 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
COL19A1Q14993 AC114755.2-201ENST00000413520 361 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
COL19A1Q14993 EI24P1-201ENST00000416584 867 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
COL19A1Q14993 LHFPL3-AS1-203ENST00000417290 950 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
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COL19A1Q14993 LINC02350-201ENST00000544419 480 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
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COL19A1Q14993 ATP5A1P2-202ENST00000616464 443 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
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COL19A1Q14993 PROX1-AS1-244ENST00000630355 599 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
COL19A1Q14993 CDC27P3-201ENST00000635418 1910 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
COL19A1Q14993 SGIP1-203ENST00000371037 7768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
COL19A1Q14993 NHSL2-204ENST00000631375 12593 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
COL19A1Q14993 LMO3-209ENST00000447609 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
COL19A1Q14993 GHR-202ENST00000357703 4316 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
COL19A1Q14993 STRBP-204ENST00000447404 6161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
COL19A1Q14993 XIST-204ENST00000429829 19275 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
COL19A1Q14993 SDAD1P2-201ENST00000441308 2028 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
COL19A1Q14993 ZEB1-202ENST00000361642 5990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
COL19A1Q14993 CNGA1-203ENST00000420489 2746 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
COL19A1Q14993 LRRK2-201ENST00000298910 9158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
COL19A1Q14993 MGAT4C-207ENST00000552808 1937 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
COL19A1Q14993 R3HCC1L-202ENST00000314594 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
COL19A1Q14993 OR9G1-202ENST00000642097 3611 ntAPPRIS P1 BASIC5.19□□□□□ -1.58
COL19A1Q14993 RAB23-201ENST00000317483 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
COL19A1Q14993 RNU6-562P-201ENST00000362731 107 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
COL19A1Q14993 RNU6-512P-201ENST00000364438 103 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
COL19A1Q14993 Y_RNA.291-201ENST00000364886 113 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
COL19A1Q14993 RCAN3-201ENST00000374393 382 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
COL19A1Q14993 SNORD116-11-201ENST00000383882 92 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
COL19A1Q14993 SNORA2.3-201ENST00000383920 135 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
COL19A1Q14993 AL360182.1-201ENST00000397433 468 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
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