Protein–RNA interactions for Protein: P46100

ATRX, Transcriptional regulator ATRX, humanhuman

Predictions only

Length 2,492 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRXP46100 EIF5P1-201ENST00000400019 1231 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
ATRXP46100 AL138827.1-201ENST00000402666 306 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
ATRXP46100 GSTM3P2-201ENST00000412746 530 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
ATRXP46100 EFCAB14-AS1-201ENST00000418985 491 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
ATRXP46100 MTND4LP11-201ENST00000422184 280 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
ATRXP46100 YWHAZP8-201ENST00000436935 731 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
ATRXP46100 AL139230.1-201ENST00000440094 425 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
ATRXP46100 DNAJC19P4-201ENST00000440115 345 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
ATRXP46100 AC069542.1-201ENST00000445235 557 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
ATRXP46100 AC055764.1-201ENST00000454526 473 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
ATRXP46100 AP001439.1-201ENST00000455275 392 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
ATRXP46100 PLSCR5-AS1-201ENST00000473817 450 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
ATRXP46100 AC084117.1-201ENST00000496975 270 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
ATRXP46100 AC107208.1-201ENST00000508265 519 ntTSL 4 BASIC2.76□□□□□ -1.97
ATRXP46100 AC016550.2-202ENST00000511940 581 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
ATRXP46100 AC091965.2-201ENST00000512324 613 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
ATRXP46100 RNU6-678P-201ENST00000516832 109 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
ATRXP46100 AP002833.1-201ENST00000530572 566 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
ATRXP46100 AC013828.2-201ENST00000532487 235 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
ATRXP46100 AC123905.1-201ENST00000552098 541 ntTSL 4 BASIC2.76□□□□□ -1.97
ATRXP46100 AC093519.1-201ENST00000566109 298 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
ATRXP46100 LINC01584-203ENST00000567231 646 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
ATRXP46100 APOOP1-201ENST00000604695 592 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
ATRXP46100 AC007938.3-201ENST00000604965 623 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
ATRXP46100 AC092354.1-201ENST00000606057 376 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
ATRXP46100 AL590227.1-201ENST00000622616 315 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
ATRXP46100 AC073348.1-201ENST00000623002 331 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
ATRXP46100 PSMD5-AS1-215ENST00000640622 205 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
ATRXP46100 DNAH14-210ENST00000439375 13548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
ATRXP46100 OR51L1-203ENST00000641819 7300 ntAPPRIS P1 BASIC2.75□□□□□ -1.97
ATRXP46100 TAS2R30-201ENST00000539585 1687 ntAPPRIS P1 BASIC2.75□□□□□ -1.97
ATRXP46100 RNU6-374P-201ENST00000364146 108 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
ATRXP46100 SNORA71.1-201ENST00000364523 117 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
ATRXP46100 RNU6-348P-201ENST00000384386 107 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
ATRXP46100 ZNF788-202ENST00000397759 777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
ATRXP46100 RNA5SP146-201ENST00000410743 123 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
ATRXP46100 FCF1P9-201ENST00000412546 282 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
ATRXP46100 AF178030.1-201ENST00000415088 402 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
ATRXP46100 SLC44A3-AS1-205ENST00000424505 612 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
ATRXP46100 AC099060.1-201ENST00000427806 448 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
ATRXP46100 LINC01724-201ENST00000430519 621 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
ATRXP46100 AC010881.1-201ENST00000433830 235 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
ATRXP46100 AL163192.1-201ENST00000448858 708 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
ATRXP46100 RPL23AP35-201ENST00000451906 501 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
ATRXP46100 HMGB1P15-201ENST00000453854 435 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
ATRXP46100 SLC16A12-AS1-202ENST00000454270 478 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
ATRXP46100 RPL18AP17-201ENST00000455326 198 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
ATRXP46100 AC092620.2-201ENST00000458007 744 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
ATRXP46100 AL121769.1-201ENST00000469473 401 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
ATRXP46100 AC016687.2-201ENST00000504795 541 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
ATRXP46100 OR5AP1P-201ENST00000529730 940 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
ATRXP46100 AC010185.1-201ENST00000542489 456 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
ATRXP46100 AC011602.1-201ENST00000546484 331 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
ATRXP46100 AC122134.1-201ENST00000565664 1104 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
ATRXP46100 AC012146.1-204ENST00000570712 426 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
ATRXP46100 MIR4307-201ENST00000582802 84 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
ATRXP46100 AC087683.1-201ENST00000591187 441 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
ATRXP46100 HSPE1P14-201ENST00000605812 302 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
ATRXP46100 AP001521.1-201ENST00000609150 300 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
ATRXP46100 AC010338.1-201ENST00000621823 717 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
ATRXP46100 ABCA9-AS1-203ENST00000627596 426 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
ATRXP46100 AC092017.3-201ENST00000638880 536 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
ATRXP46100 AC011978.2-201ENST00000569835 2054 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
ATRXP46100 MME-201ENST00000360490 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
ATRXP46100 RGPD1-202ENST00000409776 6692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
ATRXP46100 AC105074.1-201ENST00000623380 3095 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
ATRXP46100 DLD-204ENST00000437604 1859 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
ATRXP46100 GDI2P1-201ENST00000429312 1336 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
ATRXP46100 SNORD114-1-201ENST00000362705 72 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
ATRXP46100 Y_RNA.256-201ENST00000364594 104 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
ATRXP46100 Y_RNA.381-201ENST00000365666 102 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
ATRXP46100 RNU6-332P-201ENST00000391193 108 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
ATRXP46100 AL592148.1-201ENST00000413568 445 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
ATRXP46100 AC010737.1-201ENST00000426699 559 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
ATRXP46100 Z83839.2-201ENST00000436294 274 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
ATRXP46100 USP9YP8-201ENST00000441913 500 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
ATRXP46100 AP1S3-208ENST00000446015 499 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
ATRXP46100 AL357793.2-201ENST00000447056 850 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
ATRXP46100 AL589935.1-212ENST00000450998 525 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
ATRXP46100 BX322784.1-201ENST00000455793 1077 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
ATRXP46100 RPL23AP71-201ENST00000470966 469 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
ATRXP46100 AC092944.1-205ENST00000494885 517 ntTSL 4 BASIC2.75□□□□□ -1.97
ATRXP46100 SNX5P1-201ENST00000505757 1041 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
ATRXP46100 LINC02101-201ENST00000505861 725 ntTSL 4 BASIC2.75□□□□□ -1.97
ATRXP46100 AC005920.2-201ENST00000509833 332 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
ATRXP46100 AP001001.1-201ENST00000532422 826 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
ATRXP46100 AC015845.1-201ENST00000579285 335 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
ATRXP46100 AP001094.1-201ENST00000579805 193 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
ATRXP46100 AL589743.7-201ENST00000612637 233 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
ATRXP46100 MIR7844-201ENST00000616161 122 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
ATRXP46100 AL158801.5-201ENST00000623123 465 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
ATRXP46100 AL079343.1-201ENST00000572358 1771 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
ATRXP46100 ERBIN-203ENST00000380938 4701 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
ATRXP46100 OSBPL9P4-201ENST00000371707 1800 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
ATRXP46100 CXCL10-201ENST00000306602 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
ATRXP46100 NFIB-202ENST00000380924 840 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
ATRXP46100 Y_RNA.548-201ENST00000384656 105 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
ATRXP46100 UBE2Q2P5Y-201ENST00000413867 207 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
ATRXP46100 MRPS36P1-201ENST00000421291 307 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
ATRXP46100 AL645937.1-202ENST00000421799 937 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
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