Protein–RNA interactions for Protein: Q92575

UBXN4, UBX domain-containing protein 4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4Q92575 CP-201ENST00000264613 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
UBXN4Q92575 NACAP2-201ENST00000318548 624 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
UBXN4Q92575 RNA5SP307-201ENST00000362863 116 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
UBXN4Q92575 RNU6-552P-201ENST00000362869 119 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
UBXN4Q92575 Y_RNA.89-201ENST00000363031 102 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
UBXN4Q92575 RNA5SP443-201ENST00000363083 132 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
UBXN4Q92575 MAPK8-202ENST00000374174 739 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
UBXN4Q92575 AKR1C1-201ENST00000380859 858 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
UBXN4Q92575 KRTAP19-8-201ENST00000382822 318 ntAPPRIS P1 BASIC4.77□□□□□ -1.65
UBXN4Q92575 SNORA1.3-201ENST00000384676 136 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
UBXN4Q92575 RNA5SP306-201ENST00000411087 107 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
UBXN4Q92575 AC114755.2-201ENST00000413520 361 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
UBXN4Q92575 AL161631.1-201ENST00000417933 486 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
UBXN4Q92575 LINC01341-201ENST00000419361 552 ntTSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
UBXN4Q92575 RPL7P46-201ENST00000425129 740 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
UBXN4Q92575 AP001117.1-201ENST00000428205 609 ntTSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
UBXN4Q92575 AC008067.1-203ENST00000430876 359 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
UBXN4Q92575 AC024908.1-202ENST00000441907 764 ntTSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
UBXN4Q92575 AC073415.1-201ENST00000449240 153 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
UBXN4Q92575 ELOCP23-201ENST00000452014 332 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
UBXN4Q92575 MTUS2-AS2-203ENST00000452602 651 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
UBXN4Q92575 SNRPFP3-201ENST00000457792 225 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
UBXN4Q92575 MTCO3P38-201ENST00000468910 766 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
UBXN4Q92575 MFAP3L-206ENST00000506110 548 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
UBXN4Q92575 AC092436.1-201ENST00000506450 503 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
UBXN4Q92575 AC117522.3-201ENST00000507974 584 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
UBXN4Q92575 AC017037.1-201ENST00000508460 471 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
UBXN4Q92575 AC091868.1-201ENST00000508746 304 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
UBXN4Q92575 RNU6-914P-201ENST00000516749 109 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
UBXN4Q92575 RN7SKP219-201ENST00000516825 296 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
UBXN4Q92575 IGKV1-32-201ENST00000519290 311 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
UBXN4Q92575 AC090281.1-201ENST00000523019 276 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
UBXN4Q92575 AC084083.1-201ENST00000526947 722 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
UBXN4Q92575 LINC02306-201ENST00000546412 529 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
UBXN4Q92575 AC078778.1-201ENST00000547177 735 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
UBXN4Q92575 AC068789.1-201ENST00000547942 577 ntTSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
UBXN4Q92575 AL355102.1-201ENST00000555383 460 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
UBXN4Q92575 AC046158.1-201ENST00000563408 719 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
UBXN4Q92575 AC087501.4-201ENST00000574460 235 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
UBXN4Q92575 AC129492.2-201ENST00000577807 517 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
UBXN4Q92575 MIR3667-201ENST00000581025 74 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
UBXN4Q92575 AP000907.4-201ENST00000604143 237 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
UBXN4Q92575 AC012603.1-201ENST00000606424 528 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
UBXN4Q92575 AC092683.2-203ENST00000618807 788 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
UBXN4Q92575 AC019278.1-201ENST00000623516 479 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
UBXN4Q92575 ORC4-202ENST00000392857 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
UBXN4Q92575 AMY2B-208ENST00000610648 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
UBXN4Q92575 NR3C1-202ENST00000343796 7286 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
UBXN4Q92575 DNAH8-202ENST00000359357 13864 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
UBXN4Q92575 MLH1-212ENST00000455445 2296 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
UBXN4Q92575 RNA5SP295-201ENST00000362655 121 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
UBXN4Q92575 RNU6-550P-201ENST00000391057 101 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
UBXN4Q92575 AL139397.2-201ENST00000404529 772 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
UBXN4Q92575 CTNNA2-204ENST00000409266 432 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
UBXN4Q92575 RN7SKP106-201ENST00000410832 272 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
UBXN4Q92575 AL109914.1-201ENST00000414740 146 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
UBXN4Q92575 MTND1P23-201ENST00000416931 372 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
UBXN4Q92575 RPL9P9-201ENST00000418824 636 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
UBXN4Q92575 RBM6-203ENST00000421682 684 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
UBXN4Q92575 LINC01204-201ENST00000422047 639 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
UBXN4Q92575 AF124730.1-201ENST00000430001 327 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
UBXN4Q92575 GTF2IP20-201ENST00000431663 360 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
UBXN4Q92575 AL158209.1-201ENST00000433460 439 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
UBXN4Q92575 AC005062.1-201ENST00000457921 566 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
UBXN4Q92575 AC063943.1-201ENST00000465434 453 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
UBXN4Q92575 TIPARP-AS1-202ENST00000478005 554 ntTSL 4 BASIC4.76□□□□□ -1.65
UBXN4Q92575 EIF4EP3-201ENST00000498782 656 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
UBXN4Q92575 PCBP2P3-201ENST00000509726 843 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
UBXN4Q92575 AC098591.2-201ENST00000510152 315 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
UBXN4Q92575 AC091180.4-201ENST00000511322 245 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
UBXN4Q92575 AC112196.1-201ENST00000515092 832 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
UBXN4Q92575 RNU4ATAC8P-201ENST00000516196 109 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
UBXN4Q92575 RNU6-835P-201ENST00000516974 104 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
UBXN4Q92575 RNU6-685P-201ENST00000517088 95 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
UBXN4Q92575 AC026470.3-201ENST00000563994 438 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
UBXN4Q92575 AC113137.1-201ENST00000591869 558 ntTSL 4 BASIC4.76□□□□□ -1.65
UBXN4Q92575 AC234771.5-201ENST00000600161 514 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
UBXN4Q92575 MIR15A-201ENST00000607334 83 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
UBXN4Q92575 UBE2Q2P6-201ENST00000612666 153 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
UBXN4Q92575 MIR6076-201ENST00000617521 113 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
UBXN4Q92575 AC007546.2-201ENST00000623996 360 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
UBXN4Q92575 AC006355.2-201ENST00000629240 317 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
UBXN4Q92575 Z99571.1-201ENST00000636677 394 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
UBXN4Q92575 LRFN5-204ENST00000554171 4253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
UBXN4Q92575 LRRC49-224ENST00000560691 2531 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
UBXN4Q92575 DTWD2-201ENST00000304058 4365 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
UBXN4Q92575 CACNB4-273ENST00000638091 4061 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
UBXN4Q92575 CFTR-201ENST00000003084 6132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
UBXN4Q92575 AC012618.3-205ENST00000637896 1496 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
UBXN4Q92575 ZNF43-207ENST00000595461 3399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
UBXN4Q92575 MIR301A-201ENST00000385261 86 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
UBXN4Q92575 U3.30-201ENST00000391308 210 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
UBXN4Q92575 UBE2V1P2-201ENST00000397758 440 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
UBXN4Q92575 AL606923.1-201ENST00000406616 190 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
UBXN4Q92575 RNA5SP113-201ENST00000410486 84 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
UBXN4Q92575 AL591848.1-201ENST00000413092 322 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
UBXN4Q92575 LINC01423-201ENST00000414189 608 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
UBXN4Q92575 ZNF863P-201ENST00000426746 417 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
UBXN4Q92575 AL080284.1-201ENST00000434493 442 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
UBXN4Q92575 AC016292.1-201ENST00000438344 235 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
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