Protein–RNA interactions for Protein: Q15573

TAF1A, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1AQ15573 AC118942.1-201ENST00000529674 1035 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
TAF1AQ15573 LIPI-203ENST00000536861 1529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.04□□□□□ -2.08
TAF1AQ15573 LINC02165-201ENST00000563061 443 ntTSL 3 BASIC2.04□□□□□ -2.08
TAF1AQ15573 AC130650.1-201ENST00000570581 415 ntTSL 2 BASIC2.04□□□□□ -2.08
TAF1AQ15573 AC015727.1-201ENST00000572792 512 ntTSL 5 BASIC2.04□□□□□ -2.08
TAF1AQ15573 STARD13-AS-208ENST00000589472 859 ntTSL 5 BASIC2.04□□□□□ -2.08
TAF1AQ15573 AC097504.2-201ENST00000608088 454 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
TAF1AQ15573 AC103710.1-201ENST00000610003 901 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
TAF1AQ15573 IL33-205ENST00000611532 757 ntTSL 1 (best) BASIC2.04□□□□□ -2.08
TAF1AQ15573 AL671511.2-201ENST00000611838 659 ntTSL 2 BASIC2.04□□□□□ -2.08
TAF1AQ15573 AL136981.2-201ENST00000617319 734 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
TAF1AQ15573 AC009318.4-201ENST00000620496 486 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
TAF1AQ15573 AC012640.5-201ENST00000623897 319 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
TAF1AQ15573 AC098679.5-201ENST00000624394 571 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
TAF1AQ15573 ZNF883-201ENST00000619044 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.03□□□□□ -2.08
TAF1AQ15573 SOBP-204ENST00000618129 1550 ntTSL 1 (best) BASIC2.03□□□□□ -2.08
TAF1AQ15573 AC025263.3-201ENST00000622965 1396 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
TAF1AQ15573 SNORD82-201ENST00000365530 70 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
TAF1AQ15573 RNU4-52P-201ENST00000384209 138 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
TAF1AQ15573 RNU6-1035P-201ENST00000384477 107 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
TAF1AQ15573 AC092660.1-201ENST00000420648 371 ntTSL 2 BASIC2.03□□□□□ -2.08
TAF1AQ15573 AC104777.1-203ENST00000423428 554 ntTSL 3 BASIC2.03□□□□□ -2.08
TAF1AQ15573 AC027124.2-201ENST00000428249 105 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
TAF1AQ15573 AC012497.1-201ENST00000429392 575 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
TAF1AQ15573 ZRANB2-AS2-204ENST00000430605 213 ntTSL 2 BASIC2.03□□□□□ -2.08
TAF1AQ15573 AL445646.1-201ENST00000431784 216 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
TAF1AQ15573 PCYT1B-AS1-201ENST00000432626 275 ntTSL 2 BASIC2.03□□□□□ -2.08
TAF1AQ15573 AL590502.1-201ENST00000433019 505 ntTSL 2 BASIC2.03□□□□□ -2.08
TAF1AQ15573 DEFB122-201ENST00000433453 499 ntTSL 1 (best) BASIC2.03□□□□□ -2.08
TAF1AQ15573 ARF4P4-201ENST00000439608 520 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
TAF1AQ15573 TRGVB-201ENST00000453257 471 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
TAF1AQ15573 AC073486.1-201ENST00000453278 531 ntTSL 5 BASIC2.03□□□□□ -2.08
TAF1AQ15573 AC010976.1-211ENST00000454503 644 ntTSL 2 BASIC2.03□□□□□ -2.08
TAF1AQ15573 AC097493.1-201ENST00000463958 372 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
TAF1AQ15573 LINC01335-201ENST00000507890 389 ntTSL 3 BASIC2.03□□□□□ -2.08
TAF1AQ15573 AL133330.2-201ENST00000532760 776 ntTSL 2 BASIC2.03□□□□□ -2.08
TAF1AQ15573 AL049835.1-201ENST00000555850 514 ntTSL 3 BASIC2.03□□□□□ -2.08
TAF1AQ15573 AC006504.5-204ENST00000592404 765 ntTSL 3 BASIC2.03□□□□□ -2.08
TAF1AQ15573 AC068313.1-201ENST00000604028 1008 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
TAF1AQ15573 SATB1-AS1-237ENST00000626982 735 ntTSL 5 BASIC2.03□□□□□ -2.08
TAF1AQ15573 AP000553.5-201ENST00000641933 54 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
TAF1AQ15573 ZBED5-201ENST00000413761 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.02□□□□□ -2.09
TAF1AQ15573 STAU2-225ENST00000523558 1603 ntTSL 2 BASIC2.02□□□□□ -2.09
TAF1AQ15573 IDE-201ENST00000265986 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.02□□□□□ -2.09
TAF1AQ15573 ZBTB8OSP1-201ENST00000342688 498 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
TAF1AQ15573 DEFB130A-201ENST00000400079 240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.02□□□□□ -2.09
TAF1AQ15573 TAF9BP2-201ENST00000400856 499 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
TAF1AQ15573 AC009237.2-201ENST00000421358 284 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
TAF1AQ15573 HMGN2P38-201ENST00000423806 265 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
TAF1AQ15573 MTND2P21-201ENST00000436242 1042 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
TAF1AQ15573 DEFB130B-201ENST00000437818 240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.02□□□□□ -2.09
TAF1AQ15573 AC009237.8-201ENST00000445492 379 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
TAF1AQ15573 AC005703.2-201ENST00000453339 343 ntTSL 2 BASIC2.02□□□□□ -2.09
TAF1AQ15573 RNU6-717P-201ENST00000459076 104 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
TAF1AQ15573 AC108734.3-201ENST00000481241 1165 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
TAF1AQ15573 OR4G11P-201ENST00000492842 939 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
TAF1AQ15573 RNU5A-7P-201ENST00000515979 116 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
TAF1AQ15573 RNU6-798P-201ENST00000516912 103 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
TAF1AQ15573 AP000722.1-201ENST00000531176 775 ntTSL 3 BASIC2.02□□□□□ -2.09
TAF1AQ15573 CYCSP26-201ENST00000534107 320 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
TAF1AQ15573 SDHAF2-203ENST00000534878 523 ntTSL 2 BASIC2.02□□□□□ -2.09
TAF1AQ15573 AC012379.1-201ENST00000558304 406 ntTSL 3 BASIC2.02□□□□□ -2.09
TAF1AQ15573 AC092718.6-202ENST00000563072 408 ntTSL 2 BASIC2.02□□□□□ -2.09
TAF1AQ15573 AC090616.5-201ENST00000581225 299 ntTSL 5 BASIC2.02□□□□□ -2.09
TAF1AQ15573 AC002984.1-201ENST00000591692 448 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
TAF1AQ15573 AL137246.1-201ENST00000607072 977 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
TAF1AQ15573 AC091965.1-202ENST00000607662 397 ntTSL 3 BASIC2.02□□□□□ -2.09
TAF1AQ15573 AC103710.4-201ENST00000609301 899 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
TAF1AQ15573 AC034238.1-213ENST00000611148 150 ntTSL 5 BASIC2.02□□□□□ -2.09
TAF1AQ15573 Y_RNA.783-201ENST00000613546 102 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
TAF1AQ15573 FRG1HP-204ENST00000617940 757 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
TAF1AQ15573 SNORD51-201ENST00000384320 80 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
TAF1AQ15573 RNU6-882P-201ENST00000391025 103 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
TAF1AQ15573 NPM1P10-201ENST00000398310 865 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
TAF1AQ15573 AL023807.1-201ENST00000407932 359 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
TAF1AQ15573 ZDHHC20P2-201ENST00000424108 429 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
TAF1AQ15573 AP002512.3-201ENST00000440231 985 ntAPPRIS P1 BASIC2.01□□□□□ -2.09
TAF1AQ15573 CBWD4P-201ENST00000445695 655 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
TAF1AQ15573 AL049714.1-201ENST00000466686 347 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
TAF1AQ15573 RPL31P60-201ENST00000478450 367 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
TAF1AQ15573 AC022272.1-201ENST00000503478 777 ntTSL 2 BASIC2.01□□□□□ -2.09
TAF1AQ15573 RNU6-27P-201ENST00000516146 107 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
TAF1AQ15573 HSPE1P18-201ENST00000517602 280 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
TAF1AQ15573 AC022784.2-201ENST00000521298 328 ntTSL 2 BASIC2.01□□□□□ -2.09
TAF1AQ15573 AC021698.1-201ENST00000524858 716 ntTSL 3 BASIC2.01□□□□□ -2.09
TAF1AQ15573 AC084033.1-201ENST00000550830 633 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
TAF1AQ15573 TIMM9-203ENST00000555061 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.01□□□□□ -2.09
TAF1AQ15573 AGGF1P5-201ENST00000567900 919 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
TAF1AQ15573 AC103810.2-203ENST00000584959 631 ntTSL 5 BASIC2.01□□□□□ -2.09
TAF1AQ15573 AC091132.5-204ENST00000586348 630 ntTSL 3 BASIC2.01□□□□□ -2.09
TAF1AQ15573 AC092954.1-201ENST00000609121 445 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
TAF1AQ15573 AL445584.2-201ENST00000614030 616 ntTSL 5 BASIC2.01□□□□□ -2.09
TAF1AQ15573 AC073308.1-201ENST00000623696 305 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
TAF1AQ15573 AC010872.1-201ENST00000624225 675 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
TAF1AQ15573 AGTR1-208ENST00000475347 1669 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.01□□□□□ -2.09
TAF1AQ15573 CLLU1-201ENST00000378485 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.01□□□□□ -2.09
TAF1AQ15573 MCF2-204ENST00000414978 3813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.01□□□□□ -2.09
TAF1AQ15573 CCT4P2-201ENST00000233836 1548 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
TAF1AQ15573 ZNF355P-201ENST00000427301 3216 ntBASIC2□□□□□ -2.09
TAF1AQ15573 SI-201ENST00000264382 6011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.5 ms