Protein–RNA interactions for Protein: W4VSP8

Vmn1r10, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r10W4VSP8 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r10W4VSP8 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r10W4VSP8 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r10W4VSP8 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r10W4VSP8 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r10W4VSP8 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r10W4VSP8 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r10W4VSP8 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r10W4VSP8 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r10W4VSP8 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r10W4VSP8 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r10W4VSP8 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r10W4VSP8 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r10W4VSP8 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r10W4VSP8 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Vmn1r10W4VSP8 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Vmn1r10W4VSP8 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Vmn1r10W4VSP8 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Vmn1r10W4VSP8 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Vmn1r10W4VSP8 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vmn1r10W4VSP8 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vmn1r10W4VSP8 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vmn1r10W4VSP8 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Vmn1r10W4VSP8 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vmn1r10W4VSP8 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vmn1r10W4VSP8 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vmn1r10W4VSP8 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vmn1r10W4VSP8 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Vmn1r10W4VSP8 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Vmn1r10W4VSP8 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vmn1r10W4VSP8 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vmn1r10W4VSP8 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vmn1r10W4VSP8 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vmn1r10W4VSP8 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vmn1r10W4VSP8 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vmn1r10W4VSP8 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vmn1r10W4VSP8 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vmn1r10W4VSP8 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vmn1r10W4VSP8 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vmn1r10W4VSP8 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vmn1r10W4VSP8 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vmn1r10W4VSP8 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vmn1r10W4VSP8 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vmn1r10W4VSP8 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vmn1r10W4VSP8 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vmn1r10W4VSP8 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vmn1r10W4VSP8 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vmn1r10W4VSP8 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vmn1r10W4VSP8 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vmn1r10W4VSP8 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vmn1r10W4VSP8 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vmn1r10W4VSP8 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vmn1r10W4VSP8 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vmn1r10W4VSP8 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vmn1r10W4VSP8 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vmn1r10W4VSP8 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vmn1r10W4VSP8 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vmn1r10W4VSP8 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vmn1r10W4VSP8 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vmn1r10W4VSP8 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vmn1r10W4VSP8 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vmn1r10W4VSP8 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vmn1r10W4VSP8 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vmn1r10W4VSP8 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vmn1r10W4VSP8 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vmn1r10W4VSP8 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vmn1r10W4VSP8 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vmn1r10W4VSP8 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vmn1r10W4VSP8 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vmn1r10W4VSP8 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vmn1r10W4VSP8 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vmn1r10W4VSP8 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vmn1r10W4VSP8 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vmn1r10W4VSP8 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vmn1r10W4VSP8 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vmn1r10W4VSP8 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vmn1r10W4VSP8 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vmn1r10W4VSP8 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vmn1r10W4VSP8 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vmn1r10W4VSP8 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vmn1r10W4VSP8 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vmn1r10W4VSP8 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vmn1r10W4VSP8 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vmn1r10W4VSP8 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vmn1r10W4VSP8 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vmn1r10W4VSP8 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vmn1r10W4VSP8 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vmn1r10W4VSP8 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vmn1r10W4VSP8 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vmn1r10W4VSP8 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vmn1r10W4VSP8 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vmn1r10W4VSP8 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vmn1r10W4VSP8 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vmn1r10W4VSP8 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vmn1r10W4VSP8 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vmn1r10W4VSP8 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vmn1r10W4VSP8 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vmn1r10W4VSP8 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vmn1r10W4VSP8 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vmn1r10W4VSP8 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.3 ms