Protein–RNA interactions for Protein: W4VSP6

Gm5538, MCG67716, mousemouse

Predictions only

Length 401 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5538W4VSP6 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm5538W4VSP6 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm5538W4VSP6 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
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Gm5538W4VSP6 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
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Gm5538W4VSP6 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm5538W4VSP6 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
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Gm5538W4VSP6 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
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Gm5538W4VSP6 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
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Gm5538W4VSP6 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm5538W4VSP6 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
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Gm5538W4VSP6 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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Gm5538W4VSP6 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
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Gm5538W4VSP6 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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