Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V6

Hdac5, Histone deacetylase 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac5Q9Z2V6 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Hdac5Q9Z2V6 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Hdac5Q9Z2V6 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Hdac5Q9Z2V6 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Hdac5Q9Z2V6 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Hdac5Q9Z2V6 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Hdac5Q9Z2V6 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Hdac5Q9Z2V6 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Hdac5Q9Z2V6 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Hdac5Q9Z2V6 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Hdac5Q9Z2V6 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Hdac5Q9Z2V6 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Hdac5Q9Z2V6 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Hdac5Q9Z2V6 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Hdac5Q9Z2V6 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Hdac5Q9Z2V6 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Hdac5Q9Z2V6 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Hdac5Q9Z2V6 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Hdac5Q9Z2V6 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Hdac5Q9Z2V6 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Hdac5Q9Z2V6 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Hdac5Q9Z2V6 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Hdac5Q9Z2V6 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Hdac5Q9Z2V6 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Hdac5Q9Z2V6 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Hdac5Q9Z2V6 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Hdac5Q9Z2V6 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Hdac5Q9Z2V6 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Hdac5Q9Z2V6 Gm43936-201ENSMUST00000203987 490 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Hdac5Q9Z2V6 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Hdac5Q9Z2V6 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Hdac5Q9Z2V6 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Hdac5Q9Z2V6 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Hdac5Q9Z2V6 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Hdac5Q9Z2V6 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Hdac5Q9Z2V6 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Hdac5Q9Z2V6 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Hdac5Q9Z2V6 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Hdac5Q9Z2V6 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Hdac5Q9Z2V6 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Hdac5Q9Z2V6 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Hdac5Q9Z2V6 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Hdac5Q9Z2V6 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Hdac5Q9Z2V6 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Hdac5Q9Z2V6 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Hdac5Q9Z2V6 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Hdac5Q9Z2V6 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Hdac5Q9Z2V6 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Hdac5Q9Z2V6 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Hdac5Q9Z2V6 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Hdac5Q9Z2V6 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Hdac5Q9Z2V6 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Hdac5Q9Z2V6 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Hdac5Q9Z2V6 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Hdac5Q9Z2V6 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Hdac5Q9Z2V6 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Hdac5Q9Z2V6 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Hdac5Q9Z2V6 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Hdac5Q9Z2V6 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Hdac5Q9Z2V6 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Hdac5Q9Z2V6 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Hdac5Q9Z2V6 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Hdac5Q9Z2V6 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Hdac5Q9Z2V6 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Hdac5Q9Z2V6 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Hdac5Q9Z2V6 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Hdac5Q9Z2V6 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Hdac5Q9Z2V6 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Hdac5Q9Z2V6 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Hdac5Q9Z2V6 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Hdac5Q9Z2V6 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Hdac5Q9Z2V6 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Hdac5Q9Z2V6 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Hdac5Q9Z2V6 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Hdac5Q9Z2V6 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Hdac5Q9Z2V6 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Hdac5Q9Z2V6 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Hdac5Q9Z2V6 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Hdac5Q9Z2V6 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Hdac5Q9Z2V6 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Hdac5Q9Z2V6 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Hdac5Q9Z2V6 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Hdac5Q9Z2V6 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Hdac5Q9Z2V6 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Hdac5Q9Z2V6 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Hdac5Q9Z2V6 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Hdac5Q9Z2V6 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Hdac5Q9Z2V6 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Hdac5Q9Z2V6 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Hdac5Q9Z2V6 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Hdac5Q9Z2V6 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Hdac5Q9Z2V6 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Hdac5Q9Z2V6 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Hdac5Q9Z2V6 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Hdac5Q9Z2V6 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Hdac5Q9Z2V6 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Hdac5Q9Z2V6 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Hdac5Q9Z2V6 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Hdac5Q9Z2V6 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Hdac5Q9Z2V6 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms