Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2Q5

Mrpl40, 39S ribosomal protein L40, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl40Q9Z2Q5 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Mrpl40Q9Z2Q5 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Mrpl40Q9Z2Q5 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Mrpl40Q9Z2Q5 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mrpl40Q9Z2Q5 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mrpl40Q9Z2Q5 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mrpl40Q9Z2Q5 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mrpl40Q9Z2Q5 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mrpl40Q9Z2Q5 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mrpl40Q9Z2Q5 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mrpl40Q9Z2Q5 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mrpl40Q9Z2Q5 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mrpl40Q9Z2Q5 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mrpl40Q9Z2Q5 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mrpl40Q9Z2Q5 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mrpl40Q9Z2Q5 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mrpl40Q9Z2Q5 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mrpl40Q9Z2Q5 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mrpl40Q9Z2Q5 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mrpl40Q9Z2Q5 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mrpl40Q9Z2Q5 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mrpl40Q9Z2Q5 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mrpl40Q9Z2Q5 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mrpl40Q9Z2Q5 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mrpl40Q9Z2Q5 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mrpl40Q9Z2Q5 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mrpl40Q9Z2Q5 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mrpl40Q9Z2Q5 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mrpl40Q9Z2Q5 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mrpl40Q9Z2Q5 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mrpl40Q9Z2Q5 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mrpl40Q9Z2Q5 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mrpl40Q9Z2Q5 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mrpl40Q9Z2Q5 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mrpl40Q9Z2Q5 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mrpl40Q9Z2Q5 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mrpl40Q9Z2Q5 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mrpl40Q9Z2Q5 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Mrpl40Q9Z2Q5 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mrpl40Q9Z2Q5 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mrpl40Q9Z2Q5 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mrpl40Q9Z2Q5 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mrpl40Q9Z2Q5 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mrpl40Q9Z2Q5 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mrpl40Q9Z2Q5 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mrpl40Q9Z2Q5 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mrpl40Q9Z2Q5 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mrpl40Q9Z2Q5 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mrpl40Q9Z2Q5 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mrpl40Q9Z2Q5 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Mrpl40Q9Z2Q5 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Mrpl40Q9Z2Q5 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Mrpl40Q9Z2Q5 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Mrpl40Q9Z2Q5 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Mrpl40Q9Z2Q5 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Mrpl40Q9Z2Q5 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Mrpl40Q9Z2Q5 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Mrpl40Q9Z2Q5 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Mrpl40Q9Z2Q5 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Mrpl40Q9Z2Q5 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Mrpl40Q9Z2Q5 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Mrpl40Q9Z2Q5 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Mrpl40Q9Z2Q5 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Mrpl40Q9Z2Q5 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Mrpl40Q9Z2Q5 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Mrpl40Q9Z2Q5 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Mrpl40Q9Z2Q5 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Mrpl40Q9Z2Q5 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Mrpl40Q9Z2Q5 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Mrpl40Q9Z2Q5 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Mrpl40Q9Z2Q5 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Mrpl40Q9Z2Q5 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Mrpl40Q9Z2Q5 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Mrpl40Q9Z2Q5 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Mrpl40Q9Z2Q5 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Mrpl40Q9Z2Q5 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Mrpl40Q9Z2Q5 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Mrpl40Q9Z2Q5 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Mrpl40Q9Z2Q5 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Mrpl40Q9Z2Q5 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Mrpl40Q9Z2Q5 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Mrpl40Q9Z2Q5 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Mrpl40Q9Z2Q5 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Mrpl40Q9Z2Q5 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Mrpl40Q9Z2Q5 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Mrpl40Q9Z2Q5 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Mrpl40Q9Z2Q5 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Mrpl40Q9Z2Q5 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Mrpl40Q9Z2Q5 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Mrpl40Q9Z2Q5 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Mrpl40Q9Z2Q5 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Mrpl40Q9Z2Q5 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Mrpl40Q9Z2Q5 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Mrpl40Q9Z2Q5 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Mrpl40Q9Z2Q5 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Mrpl40Q9Z2Q5 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms