Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2Q2

Knop1, Lysine-rich nucleolar protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Knop1Q9Z2Q2 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Knop1Q9Z2Q2 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Knop1Q9Z2Q2 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Knop1Q9Z2Q2 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Knop1Q9Z2Q2 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Knop1Q9Z2Q2 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Knop1Q9Z2Q2 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Knop1Q9Z2Q2 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Knop1Q9Z2Q2 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Knop1Q9Z2Q2 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Knop1Q9Z2Q2 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Knop1Q9Z2Q2 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Knop1Q9Z2Q2 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Knop1Q9Z2Q2 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Knop1Q9Z2Q2 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Knop1Q9Z2Q2 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Knop1Q9Z2Q2 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Knop1Q9Z2Q2 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Knop1Q9Z2Q2 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Knop1Q9Z2Q2 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Knop1Q9Z2Q2 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Knop1Q9Z2Q2 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Knop1Q9Z2Q2 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Knop1Q9Z2Q2 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Knop1Q9Z2Q2 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Knop1Q9Z2Q2 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Knop1Q9Z2Q2 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Knop1Q9Z2Q2 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Knop1Q9Z2Q2 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Knop1Q9Z2Q2 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Knop1Q9Z2Q2 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Knop1Q9Z2Q2 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Knop1Q9Z2Q2 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Knop1Q9Z2Q2 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Knop1Q9Z2Q2 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Knop1Q9Z2Q2 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Knop1Q9Z2Q2 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Knop1Q9Z2Q2 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Knop1Q9Z2Q2 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Knop1Q9Z2Q2 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Knop1Q9Z2Q2 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Knop1Q9Z2Q2 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Knop1Q9Z2Q2 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Knop1Q9Z2Q2 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Knop1Q9Z2Q2 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Knop1Q9Z2Q2 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Knop1Q9Z2Q2 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Knop1Q9Z2Q2 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Knop1Q9Z2Q2 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Knop1Q9Z2Q2 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Knop1Q9Z2Q2 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Knop1Q9Z2Q2 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Knop1Q9Z2Q2 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Knop1Q9Z2Q2 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Knop1Q9Z2Q2 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Knop1Q9Z2Q2 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Knop1Q9Z2Q2 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Knop1Q9Z2Q2 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Knop1Q9Z2Q2 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Knop1Q9Z2Q2 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Knop1Q9Z2Q2 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Knop1Q9Z2Q2 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Knop1Q9Z2Q2 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Knop1Q9Z2Q2 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Knop1Q9Z2Q2 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Knop1Q9Z2Q2 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Knop1Q9Z2Q2 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Knop1Q9Z2Q2 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Knop1Q9Z2Q2 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Knop1Q9Z2Q2 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Knop1Q9Z2Q2 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Knop1Q9Z2Q2 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Knop1Q9Z2Q2 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Knop1Q9Z2Q2 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Knop1Q9Z2Q2 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Knop1Q9Z2Q2 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Knop1Q9Z2Q2 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Knop1Q9Z2Q2 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Knop1Q9Z2Q2 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Knop1Q9Z2Q2 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Knop1Q9Z2Q2 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Knop1Q9Z2Q2 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Knop1Q9Z2Q2 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Knop1Q9Z2Q2 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Knop1Q9Z2Q2 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Knop1Q9Z2Q2 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Knop1Q9Z2Q2 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Knop1Q9Z2Q2 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Knop1Q9Z2Q2 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Knop1Q9Z2Q2 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Knop1Q9Z2Q2 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Knop1Q9Z2Q2 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Knop1Q9Z2Q2 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Knop1Q9Z2Q2 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Knop1Q9Z2Q2 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Knop1Q9Z2Q2 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Knop1Q9Z2Q2 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Knop1Q9Z2Q2 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Knop1Q9Z2Q2 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Knop1Q9Z2Q2 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms