Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2J6

Ptgdr2, Prostaglandin D2 receptor 2, mousemouse

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptgdr2Q9Z2J6 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ptgdr2Q9Z2J6 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ptgdr2Q9Z2J6 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ptgdr2Q9Z2J6 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ptgdr2Q9Z2J6 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ptgdr2Q9Z2J6 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ptgdr2Q9Z2J6 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ptgdr2Q9Z2J6 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ptgdr2Q9Z2J6 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ptgdr2Q9Z2J6 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ptgdr2Q9Z2J6 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ptgdr2Q9Z2J6 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ptgdr2Q9Z2J6 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ptgdr2Q9Z2J6 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ptgdr2Q9Z2J6 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ptgdr2Q9Z2J6 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ptgdr2Q9Z2J6 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ptgdr2Q9Z2J6 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ptgdr2Q9Z2J6 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ptgdr2Q9Z2J6 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ptgdr2Q9Z2J6 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ptgdr2Q9Z2J6 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ptgdr2Q9Z2J6 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ptgdr2Q9Z2J6 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ptgdr2Q9Z2J6 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ptgdr2Q9Z2J6 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ptgdr2Q9Z2J6 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ptgdr2Q9Z2J6 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ptgdr2Q9Z2J6 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Ptgdr2Q9Z2J6 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ptgdr2Q9Z2J6 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ptgdr2Q9Z2J6 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ptgdr2Q9Z2J6 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ptgdr2Q9Z2J6 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ptgdr2Q9Z2J6 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ptgdr2Q9Z2J6 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ptgdr2Q9Z2J6 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ptgdr2Q9Z2J6 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ptgdr2Q9Z2J6 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ptgdr2Q9Z2J6 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ptgdr2Q9Z2J6 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ptgdr2Q9Z2J6 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ptgdr2Q9Z2J6 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ptgdr2Q9Z2J6 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ptgdr2Q9Z2J6 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ptgdr2Q9Z2J6 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ptgdr2Q9Z2J6 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ptgdr2Q9Z2J6 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ptgdr2Q9Z2J6 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ptgdr2Q9Z2J6 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ptgdr2Q9Z2J6 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ptgdr2Q9Z2J6 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ptgdr2Q9Z2J6 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ptgdr2Q9Z2J6 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ptgdr2Q9Z2J6 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ptgdr2Q9Z2J6 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ptgdr2Q9Z2J6 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ptgdr2Q9Z2J6 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ptgdr2Q9Z2J6 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ptgdr2Q9Z2J6 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ptgdr2Q9Z2J6 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ptgdr2Q9Z2J6 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ptgdr2Q9Z2J6 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ptgdr2Q9Z2J6 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ptgdr2Q9Z2J6 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ptgdr2Q9Z2J6 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ptgdr2Q9Z2J6 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ptgdr2Q9Z2J6 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ptgdr2Q9Z2J6 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ptgdr2Q9Z2J6 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ptgdr2Q9Z2J6 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ptgdr2Q9Z2J6 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ptgdr2Q9Z2J6 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ptgdr2Q9Z2J6 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ptgdr2Q9Z2J6 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ptgdr2Q9Z2J6 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ptgdr2Q9Z2J6 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ptgdr2Q9Z2J6 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ptgdr2Q9Z2J6 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ptgdr2Q9Z2J6 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ptgdr2Q9Z2J6 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ptgdr2Q9Z2J6 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ptgdr2Q9Z2J6 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ptgdr2Q9Z2J6 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ptgdr2Q9Z2J6 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ptgdr2Q9Z2J6 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ptgdr2Q9Z2J6 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ptgdr2Q9Z2J6 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ptgdr2Q9Z2J6 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ptgdr2Q9Z2J6 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ptgdr2Q9Z2J6 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ptgdr2Q9Z2J6 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ptgdr2Q9Z2J6 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ptgdr2Q9Z2J6 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ptgdr2Q9Z2J6 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ptgdr2Q9Z2J6 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Ptgdr2Q9Z2J6 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ptgdr2Q9Z2J6 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ptgdr2Q9Z2J6 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ptgdr2Q9Z2J6 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.7 ms