Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z273

Tulp1, Tubby-related protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 543 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tulp1Q9Z273 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tulp1Q9Z273 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tulp1Q9Z273 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tulp1Q9Z273 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tulp1Q9Z273 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tulp1Q9Z273 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tulp1Q9Z273 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tulp1Q9Z273 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tulp1Q9Z273 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tulp1Q9Z273 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tulp1Q9Z273 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Tulp1Q9Z273 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Tulp1Q9Z273 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Tulp1Q9Z273 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Tulp1Q9Z273 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Tulp1Q9Z273 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Tulp1Q9Z273 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Tulp1Q9Z273 Gm16275-201ENSMUST00000147774 712 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tulp1Q9Z273 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tulp1Q9Z273 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tulp1Q9Z273 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tulp1Q9Z273 Gm42626-201ENSMUST00000196866 1148 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tulp1Q9Z273 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Tulp1Q9Z273 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tulp1Q9Z273 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Tulp1Q9Z273 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tulp1Q9Z273 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tulp1Q9Z273 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tulp1Q9Z273 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tulp1Q9Z273 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tulp1Q9Z273 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tulp1Q9Z273 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tulp1Q9Z273 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tulp1Q9Z273 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tulp1Q9Z273 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tulp1Q9Z273 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tulp1Q9Z273 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tulp1Q9Z273 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tulp1Q9Z273 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tulp1Q9Z273 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tulp1Q9Z273 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Tulp1Q9Z273 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tulp1Q9Z273 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tulp1Q9Z273 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tulp1Q9Z273 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tulp1Q9Z273 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tulp1Q9Z273 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tulp1Q9Z273 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tulp1Q9Z273 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tulp1Q9Z273 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tulp1Q9Z273 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tulp1Q9Z273 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tulp1Q9Z273 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tulp1Q9Z273 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tulp1Q9Z273 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tulp1Q9Z273 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tulp1Q9Z273 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tulp1Q9Z273 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tulp1Q9Z273 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tulp1Q9Z273 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tulp1Q9Z273 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tulp1Q9Z273 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tulp1Q9Z273 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tulp1Q9Z273 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tulp1Q9Z273 Gm6991-201ENSMUST00000218475 1178 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Tulp1Q9Z273 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tulp1Q9Z273 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tulp1Q9Z273 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tulp1Q9Z273 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tulp1Q9Z273 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tulp1Q9Z273 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tulp1Q9Z273 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tulp1Q9Z273 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tulp1Q9Z273 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tulp1Q9Z273 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tulp1Q9Z273 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tulp1Q9Z273 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tulp1Q9Z273 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tulp1Q9Z273 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tulp1Q9Z273 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tulp1Q9Z273 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tulp1Q9Z273 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tulp1Q9Z273 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tulp1Q9Z273 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tulp1Q9Z273 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tulp1Q9Z273 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tulp1Q9Z273 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tulp1Q9Z273 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tulp1Q9Z273 Tmem150cos-201ENSMUST00000143245 1216 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tulp1Q9Z273 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tulp1Q9Z273 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tulp1Q9Z273 Prl8a1-201ENSMUST00000006664 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tulp1Q9Z273 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tulp1Q9Z273 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tulp1Q9Z273 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tulp1Q9Z273 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tulp1Q9Z273 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tulp1Q9Z273 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tulp1Q9Z273 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tulp1Q9Z273 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.8 ms