Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1Y4

Trip6, Thyroid receptor-interacting protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip6Q9Z1Y4 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Trip6Q9Z1Y4 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Trip6Q9Z1Y4 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Trip6Q9Z1Y4 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Trip6Q9Z1Y4 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Trip6Q9Z1Y4 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Trip6Q9Z1Y4 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Trip6Q9Z1Y4 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Trip6Q9Z1Y4 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Trip6Q9Z1Y4 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Trip6Q9Z1Y4 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Trip6Q9Z1Y4 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Trip6Q9Z1Y4 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Trip6Q9Z1Y4 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Trip6Q9Z1Y4 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Trip6Q9Z1Y4 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Trip6Q9Z1Y4 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Trip6Q9Z1Y4 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Trip6Q9Z1Y4 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Trip6Q9Z1Y4 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Trip6Q9Z1Y4 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Trip6Q9Z1Y4 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Trip6Q9Z1Y4 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Trip6Q9Z1Y4 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Trip6Q9Z1Y4 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Trip6Q9Z1Y4 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Trip6Q9Z1Y4 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Trip6Q9Z1Y4 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Trip6Q9Z1Y4 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Trip6Q9Z1Y4 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Trip6Q9Z1Y4 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Trip6Q9Z1Y4 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Trip6Q9Z1Y4 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Trip6Q9Z1Y4 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Trip6Q9Z1Y4 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Trip6Q9Z1Y4 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Trip6Q9Z1Y4 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Trip6Q9Z1Y4 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Trip6Q9Z1Y4 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.78
Trip6Q9Z1Y4 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Trip6Q9Z1Y4 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Trip6Q9Z1Y4 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Trip6Q9Z1Y4 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Trip6Q9Z1Y4 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Trip6Q9Z1Y4 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Trip6Q9Z1Y4 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Trip6Q9Z1Y4 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Trip6Q9Z1Y4 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Trip6Q9Z1Y4 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Trip6Q9Z1Y4 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Trip6Q9Z1Y4 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Trip6Q9Z1Y4 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Trip6Q9Z1Y4 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Trip6Q9Z1Y4 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Trip6Q9Z1Y4 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Trip6Q9Z1Y4 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Trip6Q9Z1Y4 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Trip6Q9Z1Y4 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Trip6Q9Z1Y4 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Trip6Q9Z1Y4 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Trip6Q9Z1Y4 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Trip6Q9Z1Y4 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Trip6Q9Z1Y4 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Trip6Q9Z1Y4 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Trip6Q9Z1Y4 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Trip6Q9Z1Y4 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Trip6Q9Z1Y4 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Trip6Q9Z1Y4 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Trip6Q9Z1Y4 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Trip6Q9Z1Y4 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Trip6Q9Z1Y4 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Trip6Q9Z1Y4 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Trip6Q9Z1Y4 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Trip6Q9Z1Y4 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Trip6Q9Z1Y4 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Trip6Q9Z1Y4 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Trip6Q9Z1Y4 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Trip6Q9Z1Y4 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Trip6Q9Z1Y4 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Trip6Q9Z1Y4 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Trip6Q9Z1Y4 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Trip6Q9Z1Y4 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Trip6Q9Z1Y4 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Trip6Q9Z1Y4 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Trip6Q9Z1Y4 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Trip6Q9Z1Y4 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Trip6Q9Z1Y4 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Trip6Q9Z1Y4 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Trip6Q9Z1Y4 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Trip6Q9Z1Y4 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Trip6Q9Z1Y4 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Trip6Q9Z1Y4 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Trip6Q9Z1Y4 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Trip6Q9Z1Y4 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Trip6Q9Z1Y4 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Trip6Q9Z1Y4 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Trip6Q9Z1Y4 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Trip6Q9Z1Y4 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Trip6Q9Z1Y4 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Trip6Q9Z1Y4 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms