Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1T1

Ap3b1, AP-3 complex subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap3b1Q9Z1T1 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ap3b1Q9Z1T1 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ap3b1Q9Z1T1 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Ap3b1Q9Z1T1 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ap3b1Q9Z1T1 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Ap3b1Q9Z1T1 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ap3b1Q9Z1T1 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ap3b1Q9Z1T1 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ap3b1Q9Z1T1 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ap3b1Q9Z1T1 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Ap3b1Q9Z1T1 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Ap3b1Q9Z1T1 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ap3b1Q9Z1T1 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ap3b1Q9Z1T1 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ap3b1Q9Z1T1 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ap3b1Q9Z1T1 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ap3b1Q9Z1T1 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ap3b1Q9Z1T1 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ap3b1Q9Z1T1 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ap3b1Q9Z1T1 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ap3b1Q9Z1T1 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ap3b1Q9Z1T1 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Ap3b1Q9Z1T1 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ap3b1Q9Z1T1 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ap3b1Q9Z1T1 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ap3b1Q9Z1T1 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ap3b1Q9Z1T1 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ap3b1Q9Z1T1 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ap3b1Q9Z1T1 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ap3b1Q9Z1T1 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ap3b1Q9Z1T1 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Ap3b1Q9Z1T1 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ap3b1Q9Z1T1 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ap3b1Q9Z1T1 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ap3b1Q9Z1T1 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ap3b1Q9Z1T1 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ap3b1Q9Z1T1 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ap3b1Q9Z1T1 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ap3b1Q9Z1T1 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ap3b1Q9Z1T1 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ap3b1Q9Z1T1 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ap3b1Q9Z1T1 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ap3b1Q9Z1T1 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ap3b1Q9Z1T1 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Ap3b1Q9Z1T1 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Ap3b1Q9Z1T1 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ap3b1Q9Z1T1 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ap3b1Q9Z1T1 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ap3b1Q9Z1T1 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Ap3b1Q9Z1T1 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ap3b1Q9Z1T1 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ap3b1Q9Z1T1 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ap3b1Q9Z1T1 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ap3b1Q9Z1T1 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ap3b1Q9Z1T1 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Ap3b1Q9Z1T1 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ap3b1Q9Z1T1 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ap3b1Q9Z1T1 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ap3b1Q9Z1T1 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ap3b1Q9Z1T1 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ap3b1Q9Z1T1 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ap3b1Q9Z1T1 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ap3b1Q9Z1T1 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ap3b1Q9Z1T1 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Ap3b1Q9Z1T1 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Ap3b1Q9Z1T1 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Ap3b1Q9Z1T1 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Ap3b1Q9Z1T1 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Ap3b1Q9Z1T1 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Ap3b1Q9Z1T1 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ap3b1Q9Z1T1 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ap3b1Q9Z1T1 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ap3b1Q9Z1T1 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ap3b1Q9Z1T1 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Ap3b1Q9Z1T1 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ap3b1Q9Z1T1 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ap3b1Q9Z1T1 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ap3b1Q9Z1T1 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ap3b1Q9Z1T1 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ap3b1Q9Z1T1 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ap3b1Q9Z1T1 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ap3b1Q9Z1T1 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ap3b1Q9Z1T1 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ap3b1Q9Z1T1 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ap3b1Q9Z1T1 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ap3b1Q9Z1T1 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ap3b1Q9Z1T1 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ap3b1Q9Z1T1 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ap3b1Q9Z1T1 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ap3b1Q9Z1T1 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ap3b1Q9Z1T1 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ap3b1Q9Z1T1 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ap3b1Q9Z1T1 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ap3b1Q9Z1T1 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ap3b1Q9Z1T1 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ap3b1Q9Z1T1 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ap3b1Q9Z1T1 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ap3b1Q9Z1T1 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ap3b1Q9Z1T1 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ap3b1Q9Z1T1 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.9 ms