Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1N5

Ddx39b, Spliceosome RNA helicase Ddx39b, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx39bQ9Z1N5 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ddx39bQ9Z1N5 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ddx39bQ9Z1N5 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ddx39bQ9Z1N5 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ddx39bQ9Z1N5 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ddx39bQ9Z1N5 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ddx39bQ9Z1N5 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ddx39bQ9Z1N5 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ddx39bQ9Z1N5 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ddx39bQ9Z1N5 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ddx39bQ9Z1N5 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ddx39bQ9Z1N5 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ddx39bQ9Z1N5 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ddx39bQ9Z1N5 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ddx39bQ9Z1N5 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ddx39bQ9Z1N5 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ddx39bQ9Z1N5 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ddx39bQ9Z1N5 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ddx39bQ9Z1N5 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ddx39bQ9Z1N5 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ddx39bQ9Z1N5 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ddx39bQ9Z1N5 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ddx39bQ9Z1N5 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ddx39bQ9Z1N5 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ddx39bQ9Z1N5 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ddx39bQ9Z1N5 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ddx39bQ9Z1N5 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ddx39bQ9Z1N5 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ddx39bQ9Z1N5 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Ddx39bQ9Z1N5 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ddx39bQ9Z1N5 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ddx39bQ9Z1N5 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ddx39bQ9Z1N5 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ddx39bQ9Z1N5 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ddx39bQ9Z1N5 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ddx39bQ9Z1N5 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ddx39bQ9Z1N5 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ddx39bQ9Z1N5 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ddx39bQ9Z1N5 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ddx39bQ9Z1N5 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ddx39bQ9Z1N5 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ddx39bQ9Z1N5 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ddx39bQ9Z1N5 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ddx39bQ9Z1N5 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ddx39bQ9Z1N5 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ddx39bQ9Z1N5 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ddx39bQ9Z1N5 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ddx39bQ9Z1N5 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ddx39bQ9Z1N5 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ddx39bQ9Z1N5 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Ddx39bQ9Z1N5 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Ddx39bQ9Z1N5 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ddx39bQ9Z1N5 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ddx39bQ9Z1N5 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ddx39bQ9Z1N5 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ddx39bQ9Z1N5 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ddx39bQ9Z1N5 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ddx39bQ9Z1N5 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ddx39bQ9Z1N5 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ddx39bQ9Z1N5 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ddx39bQ9Z1N5 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ddx39bQ9Z1N5 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ddx39bQ9Z1N5 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ddx39bQ9Z1N5 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Ddx39bQ9Z1N5 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ddx39bQ9Z1N5 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ddx39bQ9Z1N5 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ddx39bQ9Z1N5 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ddx39bQ9Z1N5 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ddx39bQ9Z1N5 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ddx39bQ9Z1N5 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ddx39bQ9Z1N5 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ddx39bQ9Z1N5 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ddx39bQ9Z1N5 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ddx39bQ9Z1N5 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ddx39bQ9Z1N5 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ddx39bQ9Z1N5 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ddx39bQ9Z1N5 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ddx39bQ9Z1N5 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ddx39bQ9Z1N5 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ddx39bQ9Z1N5 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ddx39bQ9Z1N5 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ddx39bQ9Z1N5 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ddx39bQ9Z1N5 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ddx39bQ9Z1N5 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ddx39bQ9Z1N5 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ddx39bQ9Z1N5 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ddx39bQ9Z1N5 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ddx39bQ9Z1N5 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ddx39bQ9Z1N5 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ddx39bQ9Z1N5 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ddx39bQ9Z1N5 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ddx39bQ9Z1N5 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ddx39bQ9Z1N5 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ddx39bQ9Z1N5 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Ddx39bQ9Z1N5 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ddx39bQ9Z1N5 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ddx39bQ9Z1N5 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ddx39bQ9Z1N5 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ddx39bQ9Z1N5 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms