Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z140

Cpne6, Copine-6, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne6Q9Z140 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cpne6Q9Z140 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cpne6Q9Z140 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cpne6Q9Z140 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cpne6Q9Z140 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cpne6Q9Z140 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cpne6Q9Z140 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cpne6Q9Z140 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cpne6Q9Z140 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cpne6Q9Z140 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cpne6Q9Z140 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cpne6Q9Z140 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cpne6Q9Z140 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cpne6Q9Z140 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cpne6Q9Z140 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cpne6Q9Z140 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cpne6Q9Z140 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Cpne6Q9Z140 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cpne6Q9Z140 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cpne6Q9Z140 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cpne6Q9Z140 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cpne6Q9Z140 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cpne6Q9Z140 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cpne6Q9Z140 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cpne6Q9Z140 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cpne6Q9Z140 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cpne6Q9Z140 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cpne6Q9Z140 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cpne6Q9Z140 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cpne6Q9Z140 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Cpne6Q9Z140 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cpne6Q9Z140 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cpne6Q9Z140 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cpne6Q9Z140 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cpne6Q9Z140 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cpne6Q9Z140 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Cpne6Q9Z140 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Cpne6Q9Z140 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cpne6Q9Z140 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Cpne6Q9Z140 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cpne6Q9Z140 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cpne6Q9Z140 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cpne6Q9Z140 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cpne6Q9Z140 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cpne6Q9Z140 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cpne6Q9Z140 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cpne6Q9Z140 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cpne6Q9Z140 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cpne6Q9Z140 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cpne6Q9Z140 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cpne6Q9Z140 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cpne6Q9Z140 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Cpne6Q9Z140 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cpne6Q9Z140 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cpne6Q9Z140 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cpne6Q9Z140 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cpne6Q9Z140 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cpne6Q9Z140 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cpne6Q9Z140 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cpne6Q9Z140 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cpne6Q9Z140 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cpne6Q9Z140 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cpne6Q9Z140 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cpne6Q9Z140 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cpne6Q9Z140 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cpne6Q9Z140 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cpne6Q9Z140 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cpne6Q9Z140 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cpne6Q9Z140 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cpne6Q9Z140 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cpne6Q9Z140 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cpne6Q9Z140 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cpne6Q9Z140 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cpne6Q9Z140 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cpne6Q9Z140 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cpne6Q9Z140 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Cpne6Q9Z140 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cpne6Q9Z140 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cpne6Q9Z140 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cpne6Q9Z140 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cpne6Q9Z140 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cpne6Q9Z140 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cpne6Q9Z140 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cpne6Q9Z140 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cpne6Q9Z140 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cpne6Q9Z140 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cpne6Q9Z140 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Cpne6Q9Z140 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cpne6Q9Z140 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cpne6Q9Z140 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Cpne6Q9Z140 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cpne6Q9Z140 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cpne6Q9Z140 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cpne6Q9Z140 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cpne6Q9Z140 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cpne6Q9Z140 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cpne6Q9Z140 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cpne6Q9Z140 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cpne6Q9Z140 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cpne6Q9Z140 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms