Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0S7

Cldn9, Claudin-9, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn9Q9Z0S7 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cldn9Q9Z0S7 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cldn9Q9Z0S7 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cldn9Q9Z0S7 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cldn9Q9Z0S7 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cldn9Q9Z0S7 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cldn9Q9Z0S7 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cldn9Q9Z0S7 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cldn9Q9Z0S7 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cldn9Q9Z0S7 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cldn9Q9Z0S7 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cldn9Q9Z0S7 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Cldn9Q9Z0S7 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cldn9Q9Z0S7 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cldn9Q9Z0S7 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cldn9Q9Z0S7 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cldn9Q9Z0S7 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cldn9Q9Z0S7 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cldn9Q9Z0S7 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cldn9Q9Z0S7 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cldn9Q9Z0S7 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cldn9Q9Z0S7 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cldn9Q9Z0S7 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cldn9Q9Z0S7 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cldn9Q9Z0S7 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cldn9Q9Z0S7 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cldn9Q9Z0S7 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cldn9Q9Z0S7 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cldn9Q9Z0S7 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cldn9Q9Z0S7 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cldn9Q9Z0S7 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cldn9Q9Z0S7 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cldn9Q9Z0S7 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cldn9Q9Z0S7 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cldn9Q9Z0S7 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cldn9Q9Z0S7 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cldn9Q9Z0S7 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cldn9Q9Z0S7 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cldn9Q9Z0S7 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Cldn9Q9Z0S7 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Cldn9Q9Z0S7 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cldn9Q9Z0S7 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cldn9Q9Z0S7 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cldn9Q9Z0S7 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cldn9Q9Z0S7 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Cldn9Q9Z0S7 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cldn9Q9Z0S7 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cldn9Q9Z0S7 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cldn9Q9Z0S7 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cldn9Q9Z0S7 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cldn9Q9Z0S7 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Cldn9Q9Z0S7 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cldn9Q9Z0S7 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cldn9Q9Z0S7 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cldn9Q9Z0S7 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cldn9Q9Z0S7 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cldn9Q9Z0S7 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cldn9Q9Z0S7 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cldn9Q9Z0S7 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cldn9Q9Z0S7 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cldn9Q9Z0S7 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cldn9Q9Z0S7 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cldn9Q9Z0S7 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cldn9Q9Z0S7 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cldn9Q9Z0S7 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
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Cldn9Q9Z0S7 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cldn9Q9Z0S7 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cldn9Q9Z0S7 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cldn9Q9Z0S7 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cldn9Q9Z0S7 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
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Cldn9Q9Z0S7 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cldn9Q9Z0S7 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cldn9Q9Z0S7 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cldn9Q9Z0S7 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cldn9Q9Z0S7 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cldn9Q9Z0S7 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cldn9Q9Z0S7 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cldn9Q9Z0S7 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cldn9Q9Z0S7 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cldn9Q9Z0S7 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cldn9Q9Z0S7 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cldn9Q9Z0S7 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cldn9Q9Z0S7 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cldn9Q9Z0S7 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cldn9Q9Z0S7 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cldn9Q9Z0S7 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cldn9Q9Z0S7 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cldn9Q9Z0S7 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cldn9Q9Z0S7 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cldn9Q9Z0S7 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cldn9Q9Z0S7 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Cldn9Q9Z0S7 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cldn9Q9Z0S7 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cldn9Q9Z0S7 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cldn9Q9Z0S7 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cldn9Q9Z0S7 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cldn9Q9Z0S7 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cldn9Q9Z0S7 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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