Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0E3

Aire, Autoimmune regulator, mousemouse

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Length 552 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AireQ9Z0E3 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
AireQ9Z0E3 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
AireQ9Z0E3 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
AireQ9Z0E3 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
AireQ9Z0E3 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
AireQ9Z0E3 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
AireQ9Z0E3 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
AireQ9Z0E3 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
AireQ9Z0E3 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
AireQ9Z0E3 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
AireQ9Z0E3 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
AireQ9Z0E3 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
AireQ9Z0E3 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
AireQ9Z0E3 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
AireQ9Z0E3 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
AireQ9Z0E3 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
AireQ9Z0E3 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
AireQ9Z0E3 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
AireQ9Z0E3 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
AireQ9Z0E3 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
AireQ9Z0E3 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
AireQ9Z0E3 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
AireQ9Z0E3 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
AireQ9Z0E3 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
AireQ9Z0E3 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
AireQ9Z0E3 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
AireQ9Z0E3 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
AireQ9Z0E3 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
AireQ9Z0E3 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
AireQ9Z0E3 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
AireQ9Z0E3 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
AireQ9Z0E3 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
AireQ9Z0E3 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
AireQ9Z0E3 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
AireQ9Z0E3 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
AireQ9Z0E3 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
AireQ9Z0E3 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
AireQ9Z0E3 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
AireQ9Z0E3 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
AireQ9Z0E3 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
AireQ9Z0E3 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
AireQ9Z0E3 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
AireQ9Z0E3 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
AireQ9Z0E3 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
AireQ9Z0E3 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
AireQ9Z0E3 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
AireQ9Z0E3 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
AireQ9Z0E3 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
AireQ9Z0E3 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
AireQ9Z0E3 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
AireQ9Z0E3 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
AireQ9Z0E3 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
AireQ9Z0E3 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
AireQ9Z0E3 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
AireQ9Z0E3 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
AireQ9Z0E3 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
AireQ9Z0E3 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
AireQ9Z0E3 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
AireQ9Z0E3 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
AireQ9Z0E3 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
AireQ9Z0E3 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
AireQ9Z0E3 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
AireQ9Z0E3 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
AireQ9Z0E3 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
AireQ9Z0E3 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
AireQ9Z0E3 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
AireQ9Z0E3 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
AireQ9Z0E3 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
AireQ9Z0E3 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
AireQ9Z0E3 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
AireQ9Z0E3 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
AireQ9Z0E3 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
AireQ9Z0E3 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
AireQ9Z0E3 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
AireQ9Z0E3 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
AireQ9Z0E3 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
AireQ9Z0E3 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
AireQ9Z0E3 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
AireQ9Z0E3 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
AireQ9Z0E3 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
AireQ9Z0E3 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
AireQ9Z0E3 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
AireQ9Z0E3 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
AireQ9Z0E3 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
AireQ9Z0E3 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
AireQ9Z0E3 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
AireQ9Z0E3 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
AireQ9Z0E3 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
AireQ9Z0E3 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
AireQ9Z0E3 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
AireQ9Z0E3 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
AireQ9Z0E3 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
AireQ9Z0E3 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
AireQ9Z0E3 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
AireQ9Z0E3 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
AireQ9Z0E3 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
AireQ9Z0E3 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
AireQ9Z0E3 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
AireQ9Z0E3 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
AireQ9Z0E3 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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