Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVG6

Carm1, Histone-arginine methyltransferase CARM1, mousemouse

Predictions only

Length 608 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Carm1Q9WVG6 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Carm1Q9WVG6 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Carm1Q9WVG6 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Carm1Q9WVG6 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Carm1Q9WVG6 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Carm1Q9WVG6 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Carm1Q9WVG6 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Carm1Q9WVG6 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Carm1Q9WVG6 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Carm1Q9WVG6 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Carm1Q9WVG6 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Carm1Q9WVG6 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Carm1Q9WVG6 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Carm1Q9WVG6 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Carm1Q9WVG6 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Carm1Q9WVG6 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Carm1Q9WVG6 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Carm1Q9WVG6 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Carm1Q9WVG6 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Carm1Q9WVG6 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Carm1Q9WVG6 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Carm1Q9WVG6 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Carm1Q9WVG6 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Carm1Q9WVG6 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Carm1Q9WVG6 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Carm1Q9WVG6 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Carm1Q9WVG6 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Carm1Q9WVG6 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Carm1Q9WVG6 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Carm1Q9WVG6 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Carm1Q9WVG6 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Carm1Q9WVG6 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Carm1Q9WVG6 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Carm1Q9WVG6 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Carm1Q9WVG6 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Carm1Q9WVG6 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Carm1Q9WVG6 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Carm1Q9WVG6 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Carm1Q9WVG6 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Carm1Q9WVG6 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Carm1Q9WVG6 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Carm1Q9WVG6 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Carm1Q9WVG6 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Carm1Q9WVG6 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Carm1Q9WVG6 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Carm1Q9WVG6 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Carm1Q9WVG6 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Carm1Q9WVG6 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Carm1Q9WVG6 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Carm1Q9WVG6 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Carm1Q9WVG6 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Carm1Q9WVG6 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Carm1Q9WVG6 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Carm1Q9WVG6 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Carm1Q9WVG6 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Carm1Q9WVG6 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Carm1Q9WVG6 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Carm1Q9WVG6 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Carm1Q9WVG6 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Carm1Q9WVG6 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Carm1Q9WVG6 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Carm1Q9WVG6 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Carm1Q9WVG6 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Carm1Q9WVG6 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Carm1Q9WVG6 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Carm1Q9WVG6 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Carm1Q9WVG6 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Carm1Q9WVG6 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Carm1Q9WVG6 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Carm1Q9WVG6 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Carm1Q9WVG6 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Carm1Q9WVG6 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Carm1Q9WVG6 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Carm1Q9WVG6 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Carm1Q9WVG6 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Carm1Q9WVG6 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Carm1Q9WVG6 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Carm1Q9WVG6 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Carm1Q9WVG6 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Carm1Q9WVG6 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Carm1Q9WVG6 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Carm1Q9WVG6 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Carm1Q9WVG6 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Carm1Q9WVG6 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Carm1Q9WVG6 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Carm1Q9WVG6 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Carm1Q9WVG6 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Carm1Q9WVG6 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Carm1Q9WVG6 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Carm1Q9WVG6 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Carm1Q9WVG6 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Carm1Q9WVG6 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Carm1Q9WVG6 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Carm1Q9WVG6 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Carm1Q9WVG6 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Carm1Q9WVG6 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Carm1Q9WVG6 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Carm1Q9WVG6 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Carm1Q9WVG6 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Carm1Q9WVG6 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms