Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVC5

Trpc7, Short transient receptor potential channel 7, mousemouse

Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc7Q9WVC5 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trpc7Q9WVC5 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Trpc7Q9WVC5 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trpc7Q9WVC5 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trpc7Q9WVC5 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Trpc7Q9WVC5 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trpc7Q9WVC5 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trpc7Q9WVC5 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Trpc7Q9WVC5 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trpc7Q9WVC5 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trpc7Q9WVC5 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trpc7Q9WVC5 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trpc7Q9WVC5 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trpc7Q9WVC5 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trpc7Q9WVC5 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trpc7Q9WVC5 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trpc7Q9WVC5 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trpc7Q9WVC5 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trpc7Q9WVC5 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trpc7Q9WVC5 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trpc7Q9WVC5 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trpc7Q9WVC5 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trpc7Q9WVC5 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trpc7Q9WVC5 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trpc7Q9WVC5 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trpc7Q9WVC5 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trpc7Q9WVC5 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Trpc7Q9WVC5 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Trpc7Q9WVC5 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Trpc7Q9WVC5 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trpc7Q9WVC5 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Trpc7Q9WVC5 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trpc7Q9WVC5 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trpc7Q9WVC5 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trpc7Q9WVC5 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trpc7Q9WVC5 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Trpc7Q9WVC5 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trpc7Q9WVC5 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trpc7Q9WVC5 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trpc7Q9WVC5 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trpc7Q9WVC5 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trpc7Q9WVC5 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trpc7Q9WVC5 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trpc7Q9WVC5 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trpc7Q9WVC5 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trpc7Q9WVC5 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trpc7Q9WVC5 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trpc7Q9WVC5 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trpc7Q9WVC5 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trpc7Q9WVC5 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trpc7Q9WVC5 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Trpc7Q9WVC5 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trpc7Q9WVC5 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trpc7Q9WVC5 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trpc7Q9WVC5 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trpc7Q9WVC5 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trpc7Q9WVC5 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trpc7Q9WVC5 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trpc7Q9WVC5 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trpc7Q9WVC5 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trpc7Q9WVC5 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trpc7Q9WVC5 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trpc7Q9WVC5 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trpc7Q9WVC5 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trpc7Q9WVC5 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trpc7Q9WVC5 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trpc7Q9WVC5 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trpc7Q9WVC5 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trpc7Q9WVC5 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trpc7Q9WVC5 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Trpc7Q9WVC5 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trpc7Q9WVC5 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trpc7Q9WVC5 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trpc7Q9WVC5 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trpc7Q9WVC5 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trpc7Q9WVC5 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trpc7Q9WVC5 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trpc7Q9WVC5 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Trpc7Q9WVC5 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Trpc7Q9WVC5 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trpc7Q9WVC5 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trpc7Q9WVC5 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Trpc7Q9WVC5 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trpc7Q9WVC5 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trpc7Q9WVC5 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trpc7Q9WVC5 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trpc7Q9WVC5 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Trpc7Q9WVC5 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Trpc7Q9WVC5 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trpc7Q9WVC5 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Trpc7Q9WVC5 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Trpc7Q9WVC5 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trpc7Q9WVC5 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trpc7Q9WVC5 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trpc7Q9WVC5 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trpc7Q9WVC5 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trpc7Q9WVC5 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Trpc7Q9WVC5 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Trpc7Q9WVC5 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Trpc7Q9WVC5 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms