Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU72

Tnfsf13b, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 13B, mousemouse

Predictions only

Length 309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf13bQ9WU72 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tnfsf13bQ9WU72 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tnfsf13bQ9WU72 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tnfsf13bQ9WU72 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tnfsf13bQ9WU72 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tnfsf13bQ9WU72 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tnfsf13bQ9WU72 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tnfsf13bQ9WU72 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tnfsf13bQ9WU72 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tnfsf13bQ9WU72 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tnfsf13bQ9WU72 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tnfsf13bQ9WU72 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tnfsf13bQ9WU72 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tnfsf13bQ9WU72 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tnfsf13bQ9WU72 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tnfsf13bQ9WU72 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tnfsf13bQ9WU72 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Tnfsf13bQ9WU72 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tnfsf13bQ9WU72 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tnfsf13bQ9WU72 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tnfsf13bQ9WU72 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tnfsf13bQ9WU72 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tnfsf13bQ9WU72 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tnfsf13bQ9WU72 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tnfsf13bQ9WU72 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tnfsf13bQ9WU72 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tnfsf13bQ9WU72 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tnfsf13bQ9WU72 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tnfsf13bQ9WU72 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tnfsf13bQ9WU72 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tnfsf13bQ9WU72 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tnfsf13bQ9WU72 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tnfsf13bQ9WU72 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tnfsf13bQ9WU72 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tnfsf13bQ9WU72 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tnfsf13bQ9WU72 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tnfsf13bQ9WU72 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tnfsf13bQ9WU72 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tnfsf13bQ9WU72 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tnfsf13bQ9WU72 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tnfsf13bQ9WU72 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Tnfsf13bQ9WU72 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tnfsf13bQ9WU72 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tnfsf13bQ9WU72 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Tnfsf13bQ9WU72 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tnfsf13bQ9WU72 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tnfsf13bQ9WU72 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tnfsf13bQ9WU72 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tnfsf13bQ9WU72 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tnfsf13bQ9WU72 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tnfsf13bQ9WU72 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tnfsf13bQ9WU72 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tnfsf13bQ9WU72 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tnfsf13bQ9WU72 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tnfsf13bQ9WU72 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tnfsf13bQ9WU72 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tnfsf13bQ9WU72 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tnfsf13bQ9WU72 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tnfsf13bQ9WU72 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tnfsf13bQ9WU72 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tnfsf13bQ9WU72 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tnfsf13bQ9WU72 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tnfsf13bQ9WU72 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tnfsf13bQ9WU72 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tnfsf13bQ9WU72 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tnfsf13bQ9WU72 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tnfsf13bQ9WU72 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tnfsf13bQ9WU72 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tnfsf13bQ9WU72 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tnfsf13bQ9WU72 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Tnfsf13bQ9WU72 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tnfsf13bQ9WU72 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tnfsf13bQ9WU72 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tnfsf13bQ9WU72 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tnfsf13bQ9WU72 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tnfsf13bQ9WU72 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tnfsf13bQ9WU72 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tnfsf13bQ9WU72 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tnfsf13bQ9WU72 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tnfsf13bQ9WU72 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tnfsf13bQ9WU72 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tnfsf13bQ9WU72 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tnfsf13bQ9WU72 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tnfsf13bQ9WU72 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Tnfsf13bQ9WU72 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tnfsf13bQ9WU72 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tnfsf13bQ9WU72 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tnfsf13bQ9WU72 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Tnfsf13bQ9WU72 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
Tnfsf13bQ9WU72 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Tnfsf13bQ9WU72 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Tnfsf13bQ9WU72 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tnfsf13bQ9WU72 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tnfsf13bQ9WU72 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tnfsf13bQ9WU72 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tnfsf13bQ9WU72 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tnfsf13bQ9WU72 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tnfsf13bQ9WU72 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tnfsf13bQ9WU72 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tnfsf13bQ9WU72 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms