Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU22

Ptpn4, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 4, mousemouse

Predictions only

Length 926 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn4Q9WU22 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ptpn4Q9WU22 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ptpn4Q9WU22 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ptpn4Q9WU22 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ptpn4Q9WU22 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ptpn4Q9WU22 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ptpn4Q9WU22 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ptpn4Q9WU22 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ptpn4Q9WU22 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ptpn4Q9WU22 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ptpn4Q9WU22 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ptpn4Q9WU22 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ptpn4Q9WU22 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ptpn4Q9WU22 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ptpn4Q9WU22 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ptpn4Q9WU22 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ptpn4Q9WU22 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ptpn4Q9WU22 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ptpn4Q9WU22 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ptpn4Q9WU22 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ptpn4Q9WU22 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ptpn4Q9WU22 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ptpn4Q9WU22 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ptpn4Q9WU22 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ptpn4Q9WU22 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ptpn4Q9WU22 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ptpn4Q9WU22 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ptpn4Q9WU22 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ptpn4Q9WU22 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ptpn4Q9WU22 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ptpn4Q9WU22 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ptpn4Q9WU22 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ptpn4Q9WU22 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ptpn4Q9WU22 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ptpn4Q9WU22 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ptpn4Q9WU22 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ptpn4Q9WU22 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ptpn4Q9WU22 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ptpn4Q9WU22 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ptpn4Q9WU22 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ptpn4Q9WU22 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ptpn4Q9WU22 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ptpn4Q9WU22 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ptpn4Q9WU22 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ptpn4Q9WU22 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ptpn4Q9WU22 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ptpn4Q9WU22 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ptpn4Q9WU22 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ptpn4Q9WU22 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ptpn4Q9WU22 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ptpn4Q9WU22 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ptpn4Q9WU22 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ptpn4Q9WU22 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ptpn4Q9WU22 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ptpn4Q9WU22 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ptpn4Q9WU22 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ptpn4Q9WU22 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ptpn4Q9WU22 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ptpn4Q9WU22 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ptpn4Q9WU22 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ptpn4Q9WU22 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ptpn4Q9WU22 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ptpn4Q9WU22 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ptpn4Q9WU22 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ptpn4Q9WU22 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ptpn4Q9WU22 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ptpn4Q9WU22 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ptpn4Q9WU22 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ptpn4Q9WU22 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ptpn4Q9WU22 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ptpn4Q9WU22 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ptpn4Q9WU22 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ptpn4Q9WU22 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ptpn4Q9WU22 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ptpn4Q9WU22 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ptpn4Q9WU22 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ptpn4Q9WU22 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ptpn4Q9WU22 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ptpn4Q9WU22 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ptpn4Q9WU22 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ptpn4Q9WU22 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ptpn4Q9WU22 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ptpn4Q9WU22 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ptpn4Q9WU22 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ptpn4Q9WU22 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ptpn4Q9WU22 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ptpn4Q9WU22 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ptpn4Q9WU22 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ptpn4Q9WU22 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ptpn4Q9WU22 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ptpn4Q9WU22 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ptpn4Q9WU22 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ptpn4Q9WU22 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ptpn4Q9WU22 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ptpn4Q9WU22 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ptpn4Q9WU22 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ptpn4Q9WU22 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ptpn4Q9WU22 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ptpn4Q9WU22 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ptpn4Q9WU22 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.8 ms