Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTV6

Usp18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, mousemouse

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp18Q9WTV6 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp18Q9WTV6 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp18Q9WTV6 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp18Q9WTV6 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp18Q9WTV6 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp18Q9WTV6 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp18Q9WTV6 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp18Q9WTV6 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp18Q9WTV6 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp18Q9WTV6 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp18Q9WTV6 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp18Q9WTV6 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp18Q9WTV6 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp18Q9WTV6 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp18Q9WTV6 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp18Q9WTV6 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp18Q9WTV6 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp18Q9WTV6 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp18Q9WTV6 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp18Q9WTV6 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp18Q9WTV6 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp18Q9WTV6 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp18Q9WTV6 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp18Q9WTV6 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp18Q9WTV6 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp18Q9WTV6 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp18Q9WTV6 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp18Q9WTV6 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp18Q9WTV6 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp18Q9WTV6 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp18Q9WTV6 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp18Q9WTV6 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp18Q9WTV6 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp18Q9WTV6 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp18Q9WTV6 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp18Q9WTV6 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp18Q9WTV6 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp18Q9WTV6 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp18Q9WTV6 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp18Q9WTV6 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp18Q9WTV6 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp18Q9WTV6 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp18Q9WTV6 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp18Q9WTV6 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp18Q9WTV6 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp18Q9WTV6 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp18Q9WTV6 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp18Q9WTV6 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp18Q9WTV6 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp18Q9WTV6 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp18Q9WTV6 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp18Q9WTV6 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp18Q9WTV6 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp18Q9WTV6 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp18Q9WTV6 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp18Q9WTV6 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp18Q9WTV6 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp18Q9WTV6 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp18Q9WTV6 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp18Q9WTV6 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp18Q9WTV6 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp18Q9WTV6 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp18Q9WTV6 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp18Q9WTV6 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp18Q9WTV6 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp18Q9WTV6 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp18Q9WTV6 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp18Q9WTV6 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp18Q9WTV6 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp18Q9WTV6 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp18Q9WTV6 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp18Q9WTV6 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp18Q9WTV6 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp18Q9WTV6 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp18Q9WTV6 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp18Q9WTV6 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp18Q9WTV6 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp18Q9WTV6 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp18Q9WTV6 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp18Q9WTV6 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp18Q9WTV6 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp18Q9WTV6 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp18Q9WTV6 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp18Q9WTV6 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp18Q9WTV6 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp18Q9WTV6 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp18Q9WTV6 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp18Q9WTV6 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp18Q9WTV6 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp18Q9WTV6 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp18Q9WTV6 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp18Q9WTV6 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp18Q9WTV6 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp18Q9WTV6 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp18Q9WTV6 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp18Q9WTV6 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp18Q9WTV6 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp18Q9WTV6 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp18Q9WTV6 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp18Q9WTV6 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms