Protein–RNA interactions for Protein: Q9R244

Trpc2, Short transient receptor potential channel 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc2Q9R244 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trpc2Q9R244 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trpc2Q9R244 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trpc2Q9R244 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trpc2Q9R244 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trpc2Q9R244 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trpc2Q9R244 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trpc2Q9R244 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trpc2Q9R244 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trpc2Q9R244 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trpc2Q9R244 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trpc2Q9R244 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trpc2Q9R244 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trpc2Q9R244 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trpc2Q9R244 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Trpc2Q9R244 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Trpc2Q9R244 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Trpc2Q9R244 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Trpc2Q9R244 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Trpc2Q9R244 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trpc2Q9R244 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trpc2Q9R244 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trpc2Q9R244 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trpc2Q9R244 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trpc2Q9R244 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trpc2Q9R244 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trpc2Q9R244 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trpc2Q9R244 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trpc2Q9R244 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trpc2Q9R244 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trpc2Q9R244 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trpc2Q9R244 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trpc2Q9R244 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trpc2Q9R244 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trpc2Q9R244 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trpc2Q9R244 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trpc2Q9R244 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trpc2Q9R244 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trpc2Q9R244 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trpc2Q9R244 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trpc2Q9R244 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trpc2Q9R244 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trpc2Q9R244 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trpc2Q9R244 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trpc2Q9R244 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Trpc2Q9R244 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trpc2Q9R244 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trpc2Q9R244 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trpc2Q9R244 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Trpc2Q9R244 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Trpc2Q9R244 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Trpc2Q9R244 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trpc2Q9R244 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trpc2Q9R244 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trpc2Q9R244 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trpc2Q9R244 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trpc2Q9R244 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trpc2Q9R244 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trpc2Q9R244 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Trpc2Q9R244 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trpc2Q9R244 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trpc2Q9R244 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Trpc2Q9R244 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Trpc2Q9R244 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trpc2Q9R244 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trpc2Q9R244 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trpc2Q9R244 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trpc2Q9R244 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trpc2Q9R244 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trpc2Q9R244 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trpc2Q9R244 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trpc2Q9R244 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trpc2Q9R244 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trpc2Q9R244 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trpc2Q9R244 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trpc2Q9R244 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trpc2Q9R244 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trpc2Q9R244 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trpc2Q9R244 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trpc2Q9R244 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trpc2Q9R244 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trpc2Q9R244 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trpc2Q9R244 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trpc2Q9R244 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trpc2Q9R244 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trpc2Q9R244 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trpc2Q9R244 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trpc2Q9R244 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trpc2Q9R244 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trpc2Q9R244 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trpc2Q9R244 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trpc2Q9R244 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trpc2Q9R244 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trpc2Q9R244 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trpc2Q9R244 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trpc2Q9R244 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trpc2Q9R244 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trpc2Q9R244 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trpc2Q9R244 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trpc2Q9R244 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms