Protein–RNA interactions for Protein: Q9R233

Tapbp, Tapasin, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TapbpQ9R233 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TapbpQ9R233 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
TapbpQ9R233 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TapbpQ9R233 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TapbpQ9R233 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TapbpQ9R233 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TapbpQ9R233 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TapbpQ9R233 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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TapbpQ9R233 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TapbpQ9R233 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TapbpQ9R233 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TapbpQ9R233 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TapbpQ9R233 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TapbpQ9R233 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TapbpQ9R233 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
TapbpQ9R233 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TapbpQ9R233 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TapbpQ9R233 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TapbpQ9R233 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TapbpQ9R233 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TapbpQ9R233 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TapbpQ9R233 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TapbpQ9R233 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TapbpQ9R233 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TapbpQ9R233 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
TapbpQ9R233 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
TapbpQ9R233 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TapbpQ9R233 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TapbpQ9R233 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TapbpQ9R233 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TapbpQ9R233 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TapbpQ9R233 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TapbpQ9R233 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TapbpQ9R233 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TapbpQ9R233 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TapbpQ9R233 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TapbpQ9R233 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TapbpQ9R233 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TapbpQ9R233 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TapbpQ9R233 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TapbpQ9R233 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TapbpQ9R233 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TapbpQ9R233 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TapbpQ9R233 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TapbpQ9R233 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
TapbpQ9R233 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TapbpQ9R233 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TapbpQ9R233 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TapbpQ9R233 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TapbpQ9R233 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TapbpQ9R233 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TapbpQ9R233 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TapbpQ9R233 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TapbpQ9R233 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TapbpQ9R233 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TapbpQ9R233 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TapbpQ9R233 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TapbpQ9R233 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TapbpQ9R233 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TapbpQ9R233 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TapbpQ9R233 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TapbpQ9R233 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TapbpQ9R233 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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TapbpQ9R233 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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TapbpQ9R233 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TapbpQ9R233 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TapbpQ9R233 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TapbpQ9R233 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TapbpQ9R233 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
TapbpQ9R233 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TapbpQ9R233 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TapbpQ9R233 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TapbpQ9R233 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TapbpQ9R233 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TapbpQ9R233 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TapbpQ9R233 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TapbpQ9R233 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TapbpQ9R233 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TapbpQ9R233 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TapbpQ9R233 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
TapbpQ9R233 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
TapbpQ9R233 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
TapbpQ9R233 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
TapbpQ9R233 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
TapbpQ9R233 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
TapbpQ9R233 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TapbpQ9R233 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TapbpQ9R233 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TapbpQ9R233 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
TapbpQ9R233 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TapbpQ9R233 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TapbpQ9R233 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TapbpQ9R233 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TapbpQ9R233 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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