Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1A9

Trex2, Three prime repair exonuclease 2, mousemouse

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trex2Q9R1A9 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trex2Q9R1A9 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trex2Q9R1A9 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trex2Q9R1A9 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Trex2Q9R1A9 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Trex2Q9R1A9 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trex2Q9R1A9 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trex2Q9R1A9 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trex2Q9R1A9 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trex2Q9R1A9 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trex2Q9R1A9 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trex2Q9R1A9 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trex2Q9R1A9 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trex2Q9R1A9 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trex2Q9R1A9 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trex2Q9R1A9 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trex2Q9R1A9 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trex2Q9R1A9 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trex2Q9R1A9 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trex2Q9R1A9 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trex2Q9R1A9 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trex2Q9R1A9 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trex2Q9R1A9 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trex2Q9R1A9 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trex2Q9R1A9 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trex2Q9R1A9 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trex2Q9R1A9 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trex2Q9R1A9 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trex2Q9R1A9 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Trex2Q9R1A9 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trex2Q9R1A9 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trex2Q9R1A9 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trex2Q9R1A9 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trex2Q9R1A9 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trex2Q9R1A9 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trex2Q9R1A9 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trex2Q9R1A9 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trex2Q9R1A9 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trex2Q9R1A9 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trex2Q9R1A9 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trex2Q9R1A9 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trex2Q9R1A9 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trex2Q9R1A9 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trex2Q9R1A9 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trex2Q9R1A9 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trex2Q9R1A9 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trex2Q9R1A9 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trex2Q9R1A9 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trex2Q9R1A9 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trex2Q9R1A9 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trex2Q9R1A9 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Trex2Q9R1A9 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Trex2Q9R1A9 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trex2Q9R1A9 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trex2Q9R1A9 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trex2Q9R1A9 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Trex2Q9R1A9 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trex2Q9R1A9 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Trex2Q9R1A9 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trex2Q9R1A9 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trex2Q9R1A9 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trex2Q9R1A9 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trex2Q9R1A9 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trex2Q9R1A9 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trex2Q9R1A9 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trex2Q9R1A9 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trex2Q9R1A9 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trex2Q9R1A9 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trex2Q9R1A9 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trex2Q9R1A9 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trex2Q9R1A9 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trex2Q9R1A9 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trex2Q9R1A9 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trex2Q9R1A9 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trex2Q9R1A9 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trex2Q9R1A9 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trex2Q9R1A9 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trex2Q9R1A9 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trex2Q9R1A9 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trex2Q9R1A9 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trex2Q9R1A9 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trex2Q9R1A9 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trex2Q9R1A9 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trex2Q9R1A9 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trex2Q9R1A9 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trex2Q9R1A9 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trex2Q9R1A9 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trex2Q9R1A9 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trex2Q9R1A9 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trex2Q9R1A9 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trex2Q9R1A9 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trex2Q9R1A9 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trex2Q9R1A9 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trex2Q9R1A9 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trex2Q9R1A9 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trex2Q9R1A9 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trex2Q9R1A9 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trex2Q9R1A9 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trex2Q9R1A9 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Trex2Q9R1A9 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms