Protein–RNA interactions for Protein: Q9R194

Cry2, Cryptochrome-2, mousemouse

Predictions only

Length 592 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cry2Q9R194 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cry2Q9R194 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cry2Q9R194 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cry2Q9R194 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cry2Q9R194 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cry2Q9R194 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cry2Q9R194 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cry2Q9R194 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cry2Q9R194 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cry2Q9R194 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cry2Q9R194 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cry2Q9R194 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Cry2Q9R194 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cry2Q9R194 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cry2Q9R194 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Cry2Q9R194 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cry2Q9R194 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cry2Q9R194 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cry2Q9R194 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cry2Q9R194 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cry2Q9R194 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cry2Q9R194 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cry2Q9R194 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cry2Q9R194 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cry2Q9R194 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cry2Q9R194 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cry2Q9R194 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cry2Q9R194 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cry2Q9R194 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cry2Q9R194 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cry2Q9R194 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Cry2Q9R194 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cry2Q9R194 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cry2Q9R194 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cry2Q9R194 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cry2Q9R194 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cry2Q9R194 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cry2Q9R194 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cry2Q9R194 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cry2Q9R194 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cry2Q9R194 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cry2Q9R194 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cry2Q9R194 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cry2Q9R194 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cry2Q9R194 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cry2Q9R194 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cry2Q9R194 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cry2Q9R194 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cry2Q9R194 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cry2Q9R194 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cry2Q9R194 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cry2Q9R194 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cry2Q9R194 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cry2Q9R194 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cry2Q9R194 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cry2Q9R194 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cry2Q9R194 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cry2Q9R194 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cry2Q9R194 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cry2Q9R194 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cry2Q9R194 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cry2Q9R194 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cry2Q9R194 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cry2Q9R194 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cry2Q9R194 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cry2Q9R194 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cry2Q9R194 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cry2Q9R194 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cry2Q9R194 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Cry2Q9R194 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cry2Q9R194 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cry2Q9R194 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cry2Q9R194 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cry2Q9R194 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Cry2Q9R194 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cry2Q9R194 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cry2Q9R194 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cry2Q9R194 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cry2Q9R194 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cry2Q9R194 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cry2Q9R194 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cry2Q9R194 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cry2Q9R194 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cry2Q9R194 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cry2Q9R194 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cry2Q9R194 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cry2Q9R194 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cry2Q9R194 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cry2Q9R194 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cry2Q9R194 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cry2Q9R194 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Cry2Q9R194 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cry2Q9R194 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cry2Q9R194 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cry2Q9R194 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cry2Q9R194 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cry2Q9R194 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cry2Q9R194 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cry2Q9R194 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cry2Q9R194 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 7.8 ms