Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0E2

Plod1, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 1, mousemouse

Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plod1Q9R0E2 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Plod1Q9R0E2 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Plod1Q9R0E2 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Plod1Q9R0E2 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Plod1Q9R0E2 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Plod1Q9R0E2 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Plod1Q9R0E2 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Plod1Q9R0E2 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Plod1Q9R0E2 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Plod1Q9R0E2 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Plod1Q9R0E2 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Plod1Q9R0E2 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Plod1Q9R0E2 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Plod1Q9R0E2 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Plod1Q9R0E2 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Plod1Q9R0E2 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Plod1Q9R0E2 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Plod1Q9R0E2 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Plod1Q9R0E2 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Plod1Q9R0E2 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Plod1Q9R0E2 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Plod1Q9R0E2 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Plod1Q9R0E2 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Plod1Q9R0E2 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Plod1Q9R0E2 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Plod1Q9R0E2 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Plod1Q9R0E2 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Plod1Q9R0E2 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Plod1Q9R0E2 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Plod1Q9R0E2 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Plod1Q9R0E2 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Plod1Q9R0E2 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Plod1Q9R0E2 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Plod1Q9R0E2 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Plod1Q9R0E2 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Plod1Q9R0E2 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Plod1Q9R0E2 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Plod1Q9R0E2 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Plod1Q9R0E2 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Plod1Q9R0E2 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Plod1Q9R0E2 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Plod1Q9R0E2 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Plod1Q9R0E2 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Plod1Q9R0E2 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Plod1Q9R0E2 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Plod1Q9R0E2 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Plod1Q9R0E2 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Plod1Q9R0E2 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Plod1Q9R0E2 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Plod1Q9R0E2 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Plod1Q9R0E2 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Plod1Q9R0E2 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Plod1Q9R0E2 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Plod1Q9R0E2 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Plod1Q9R0E2 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Plod1Q9R0E2 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Plod1Q9R0E2 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Plod1Q9R0E2 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Plod1Q9R0E2 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Plod1Q9R0E2 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Plod1Q9R0E2 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Plod1Q9R0E2 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Plod1Q9R0E2 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Plod1Q9R0E2 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Plod1Q9R0E2 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Plod1Q9R0E2 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Plod1Q9R0E2 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Plod1Q9R0E2 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Plod1Q9R0E2 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Plod1Q9R0E2 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Plod1Q9R0E2 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Plod1Q9R0E2 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Plod1Q9R0E2 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Plod1Q9R0E2 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Plod1Q9R0E2 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Plod1Q9R0E2 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Plod1Q9R0E2 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Plod1Q9R0E2 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Plod1Q9R0E2 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Plod1Q9R0E2 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Plod1Q9R0E2 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Plod1Q9R0E2 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Plod1Q9R0E2 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Plod1Q9R0E2 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Plod1Q9R0E2 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Plod1Q9R0E2 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Plod1Q9R0E2 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Plod1Q9R0E2 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Plod1Q9R0E2 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Plod1Q9R0E2 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Plod1Q9R0E2 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Plod1Q9R0E2 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Plod1Q9R0E2 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Plod1Q9R0E2 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Plod1Q9R0E2 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Plod1Q9R0E2 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Plod1Q9R0E2 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Plod1Q9R0E2 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Plod1Q9R0E2 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Plod1Q9R0E2 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms