Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0D8

Wdr54, WD repeat-containing protein 54, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wdr54Q9R0D8 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Wdr54Q9R0D8 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Wdr54Q9R0D8 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Wdr54Q9R0D8 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Wdr54Q9R0D8 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Wdr54Q9R0D8 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Wdr54Q9R0D8 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Wdr54Q9R0D8 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Wdr54Q9R0D8 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Wdr54Q9R0D8 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Wdr54Q9R0D8 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Wdr54Q9R0D8 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Wdr54Q9R0D8 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Wdr54Q9R0D8 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Wdr54Q9R0D8 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Wdr54Q9R0D8 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Wdr54Q9R0D8 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Wdr54Q9R0D8 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Wdr54Q9R0D8 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Wdr54Q9R0D8 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Wdr54Q9R0D8 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Wdr54Q9R0D8 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Wdr54Q9R0D8 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Wdr54Q9R0D8 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Wdr54Q9R0D8 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Wdr54Q9R0D8 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Wdr54Q9R0D8 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Wdr54Q9R0D8 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Wdr54Q9R0D8 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Wdr54Q9R0D8 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Wdr54Q9R0D8 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Wdr54Q9R0D8 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Wdr54Q9R0D8 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Wdr54Q9R0D8 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Wdr54Q9R0D8 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Wdr54Q9R0D8 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Wdr54Q9R0D8 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Wdr54Q9R0D8 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Wdr54Q9R0D8 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Wdr54Q9R0D8 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Wdr54Q9R0D8 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Wdr54Q9R0D8 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Wdr54Q9R0D8 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Wdr54Q9R0D8 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Wdr54Q9R0D8 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Wdr54Q9R0D8 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Wdr54Q9R0D8 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Wdr54Q9R0D8 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Wdr54Q9R0D8 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Wdr54Q9R0D8 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Wdr54Q9R0D8 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Wdr54Q9R0D8 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Wdr54Q9R0D8 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Wdr54Q9R0D8 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Wdr54Q9R0D8 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Wdr54Q9R0D8 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Wdr54Q9R0D8 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Wdr54Q9R0D8 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Wdr54Q9R0D8 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Wdr54Q9R0D8 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Wdr54Q9R0D8 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Wdr54Q9R0D8 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Wdr54Q9R0D8 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Wdr54Q9R0D8 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Wdr54Q9R0D8 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Wdr54Q9R0D8 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Wdr54Q9R0D8 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Wdr54Q9R0D8 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Wdr54Q9R0D8 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Wdr54Q9R0D8 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Wdr54Q9R0D8 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Wdr54Q9R0D8 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Wdr54Q9R0D8 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Wdr54Q9R0D8 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Wdr54Q9R0D8 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Wdr54Q9R0D8 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Wdr54Q9R0D8 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Wdr54Q9R0D8 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Wdr54Q9R0D8 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Wdr54Q9R0D8 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Wdr54Q9R0D8 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Wdr54Q9R0D8 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Wdr54Q9R0D8 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Wdr54Q9R0D8 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Wdr54Q9R0D8 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Wdr54Q9R0D8 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Wdr54Q9R0D8 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Wdr54Q9R0D8 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Wdr54Q9R0D8 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Wdr54Q9R0D8 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Wdr54Q9R0D8 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Wdr54Q9R0D8 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Wdr54Q9R0D8 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Wdr54Q9R0D8 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Wdr54Q9R0D8 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Wdr54Q9R0D8 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Wdr54Q9R0D8 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Wdr54Q9R0D8 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Wdr54Q9R0D8 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Wdr54Q9R0D8 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms