Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0C8

Vav3, Guanine nucleotide exchange factor VAV3, mousemouse

Predictions only

Length 847 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vav3Q9R0C8 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Vav3Q9R0C8 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Vav3Q9R0C8 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Vav3Q9R0C8 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Vav3Q9R0C8 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Vav3Q9R0C8 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Vav3Q9R0C8 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Vav3Q9R0C8 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Vav3Q9R0C8 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vav3Q9R0C8 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vav3Q9R0C8 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vav3Q9R0C8 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vav3Q9R0C8 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vav3Q9R0C8 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vav3Q9R0C8 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vav3Q9R0C8 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vav3Q9R0C8 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vav3Q9R0C8 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vav3Q9R0C8 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vav3Q9R0C8 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vav3Q9R0C8 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vav3Q9R0C8 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vav3Q9R0C8 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vav3Q9R0C8 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vav3Q9R0C8 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vav3Q9R0C8 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vav3Q9R0C8 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Vav3Q9R0C8 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Vav3Q9R0C8 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vav3Q9R0C8 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Vav3Q9R0C8 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Vav3Q9R0C8 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Vav3Q9R0C8 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vav3Q9R0C8 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Vav3Q9R0C8 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Vav3Q9R0C8 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Vav3Q9R0C8 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Vav3Q9R0C8 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Vav3Q9R0C8 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Vav3Q9R0C8 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vav3Q9R0C8 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vav3Q9R0C8 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Vav3Q9R0C8 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vav3Q9R0C8 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vav3Q9R0C8 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Vav3Q9R0C8 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vav3Q9R0C8 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vav3Q9R0C8 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vav3Q9R0C8 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vav3Q9R0C8 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vav3Q9R0C8 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vav3Q9R0C8 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vav3Q9R0C8 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vav3Q9R0C8 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vav3Q9R0C8 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vav3Q9R0C8 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vav3Q9R0C8 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vav3Q9R0C8 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vav3Q9R0C8 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vav3Q9R0C8 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vav3Q9R0C8 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vav3Q9R0C8 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vav3Q9R0C8 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vav3Q9R0C8 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vav3Q9R0C8 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vav3Q9R0C8 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vav3Q9R0C8 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vav3Q9R0C8 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vav3Q9R0C8 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vav3Q9R0C8 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vav3Q9R0C8 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vav3Q9R0C8 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vav3Q9R0C8 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vav3Q9R0C8 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Vav3Q9R0C8 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vav3Q9R0C8 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vav3Q9R0C8 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Vav3Q9R0C8 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vav3Q9R0C8 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vav3Q9R0C8 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vav3Q9R0C8 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vav3Q9R0C8 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vav3Q9R0C8 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vav3Q9R0C8 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vav3Q9R0C8 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vav3Q9R0C8 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vav3Q9R0C8 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vav3Q9R0C8 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vav3Q9R0C8 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vav3Q9R0C8 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vav3Q9R0C8 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vav3Q9R0C8 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vav3Q9R0C8 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vav3Q9R0C8 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vav3Q9R0C8 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vav3Q9R0C8 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vav3Q9R0C8 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vav3Q9R0C8 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vav3Q9R0C8 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vav3Q9R0C8 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms