Protein–RNA interactions for Protein: Q9R049

Amfr, E3 ubiquitin-protein ligase AMFR, mousemouse

Predictions only

Length 643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AmfrQ9R049 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
AmfrQ9R049 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
AmfrQ9R049 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
AmfrQ9R049 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
AmfrQ9R049 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
AmfrQ9R049 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
AmfrQ9R049 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
AmfrQ9R049 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
AmfrQ9R049 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
AmfrQ9R049 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
AmfrQ9R049 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
AmfrQ9R049 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
AmfrQ9R049 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
AmfrQ9R049 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
AmfrQ9R049 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
AmfrQ9R049 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
AmfrQ9R049 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
AmfrQ9R049 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
AmfrQ9R049 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
AmfrQ9R049 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
AmfrQ9R049 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
AmfrQ9R049 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
AmfrQ9R049 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
AmfrQ9R049 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
AmfrQ9R049 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
AmfrQ9R049 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
AmfrQ9R049 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
AmfrQ9R049 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
AmfrQ9R049 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
AmfrQ9R049 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
AmfrQ9R049 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
AmfrQ9R049 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
AmfrQ9R049 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
AmfrQ9R049 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
AmfrQ9R049 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
AmfrQ9R049 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
AmfrQ9R049 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
AmfrQ9R049 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
AmfrQ9R049 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
AmfrQ9R049 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
AmfrQ9R049 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
AmfrQ9R049 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
AmfrQ9R049 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
AmfrQ9R049 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
AmfrQ9R049 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
AmfrQ9R049 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
AmfrQ9R049 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
AmfrQ9R049 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
AmfrQ9R049 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
AmfrQ9R049 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
AmfrQ9R049 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
AmfrQ9R049 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
AmfrQ9R049 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
AmfrQ9R049 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
AmfrQ9R049 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
AmfrQ9R049 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
AmfrQ9R049 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
AmfrQ9R049 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
AmfrQ9R049 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
AmfrQ9R049 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
AmfrQ9R049 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
AmfrQ9R049 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
AmfrQ9R049 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
AmfrQ9R049 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
AmfrQ9R049 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
AmfrQ9R049 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
AmfrQ9R049 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
AmfrQ9R049 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
AmfrQ9R049 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
AmfrQ9R049 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
AmfrQ9R049 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
AmfrQ9R049 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
AmfrQ9R049 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
AmfrQ9R049 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
AmfrQ9R049 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
AmfrQ9R049 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
AmfrQ9R049 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
AmfrQ9R049 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
AmfrQ9R049 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
AmfrQ9R049 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
AmfrQ9R049 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
AmfrQ9R049 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
AmfrQ9R049 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
AmfrQ9R049 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
AmfrQ9R049 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
AmfrQ9R049 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
AmfrQ9R049 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
AmfrQ9R049 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
AmfrQ9R049 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
AmfrQ9R049 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
AmfrQ9R049 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
AmfrQ9R049 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
AmfrQ9R049 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
AmfrQ9R049 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
AmfrQ9R049 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
AmfrQ9R049 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
AmfrQ9R049 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
AmfrQ9R049 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
AmfrQ9R049 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
AmfrQ9R049 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms